Prawda

Poniedziałek, 6 maja 2024 - 06:15

« Poprzedni Następny »


Specjacja sympatryczna we wnętrzu cykady


Ed Yong 2014-10-10


Łatwo sobie wyobrazić sytuację, że bariera fizyczna, taka jak rzeka lub góry, może powodować tworzenie się nowych gatunków. W sytuacji gdy po dwóch stronach przegrody zostaną odizolowane, dwie populacje tego samego gatunku nie będą mogły się wspólnie rozmnażać. Zaczną ewoluować według swoich odrębnych ścieżek, dopóki różnice nie staną się tak wyraźne, że uniemożliwią rozmnażanie osobnikom z tych gatunków nawet, gdy się spotkają. W ten sposób z jednego gatunku powstaną dwa.

Jest także wiele przykładów, gdy nowe gatunki powstały bez żadnej bariery - gdy jedna populacja podzieliła się na dwie nawet w sytuacji, gdy jej członkowie zajmowali tę samą przestrzeń. Nazywamy takie zjawisko specjacją sympatryczną (z greckiego „z tej samej ojczyzny”). Nazwa powstała ponad wiek temu lecz była kontrowersyjna przez prawie cały czas. Naukowcy wykrywali jednak coraz więcej przykładów potwierdzających słuszność tej koncepcji, gdy nowe osy, muchy, ryby i drzewa ewoluowały inaczej żyjąc obok siebie. W zeszłym tygodniu, pojawiła się wiadomość, o nowym gatunku mrówki tzw. deadbeat ant , który oddzielił się od macierzystego gatunku, żyjąc cały czas w tej samej kolonii.


Poprzedni, intrygujący przykład, opisali James Van Leuven i John McCutcheon z Universytetu Montana. Dotyczy bakterii zwanej Hodgkinia, która podzieliła się na dwa oddzielne gatunki, żyjąc w komórkach owada. Nie występowała tam żadna bariera. Sardynki w puszce nie są tak stłoczone jak bakterie Hodgkinia. Bakterie były upakowane w takie same dokładnie mikroskopowe struktury, lecz w jakiś sposób udało im się rozdzielić na dwa różne gatunki.


Dwa potomne gatunki stanowią, jak gdyby, dwie połowy swojego przodka. Każdy z nich utracił geny oryginalnej bakterii Hodgkinia, lecz utraciły inne geny. Każdy gatunek kompensuje utratę, jaka nastąpiła u siostrzanego gatunku. Są one dokładnie komplementarne - po połączeniu można uzyskać (prawie) kompletny genom ich przodka.


Van Leuven i McCutcheon dokonali swojego odkrycia badając cykady - owady znane z ogłuszających dźwięków. Około pięć lat temu wykazali, że w jednym gatunku cykady wewnątrz komórek żyją dwa rodzaje bakterii - Sulcia i Hodgkinia. Jest to normalne, wiele owadów ma pomocników w postaci wewnętrznych bakterii lub „endosymbiontów”. U owadów ssących sok roślin jak cykady, takie mikroby działają jak suplementy diety, tworząc substancje odżywcze, których te owady nie mają w swojej diecie.


Sprawy zaczęły wyglądać dziwnie, gdy Van Leuven iMcCutcheon przeanalizowali DNA cykady południowo-amerykańskiej zwanej Tettigades undata. Zbadali wiele fragmentów DNA bakterii Hodgkinia, lecz, po próbach, nie mogli połączyć ich w pojedynczy genom. Zawsze tworzyły dwa oddzielne genomy. Dla ułatwienia, będę je nazywał H1 i H2.


Wspomniane dwa genomy należą do rożnych bakterii; nigdy nie odkryto ich w tej samej komórce. Zespół badaczy potwierdził, to za pomocą cząsteczek fluorescencyjnych przeznaczonych do znakowania każdego genomu - żółtych dla H1 oraz niebieskich dla H2. Wyniki można zobaczyć na fotografii poniżej. Każda mała kropka odpowiada oddzielnej bakterii a każda z nich zawiera genom H1 lub H2 lecz nigdy nie ma ich obu. (Zielone kropki oznaczają Sulcia, a fioletowe należą do cykady)


Dwa gatunki Hodgkinii (niebieskie i żółte kropki) w komórkach cykady. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.
Dwa gatunki Hodgkinii (niebieskie i żółte kropki) w komórkach cykady. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.

Opisane bakterie pochodzą od wspólnego przodka, którego nazwałem H0, pochodzącego sprzed około 5 milionów lat. Badacze zdobyli dobre wyobrażenie, jak wyglądał ten przodek, dzięki dokładnemu zbadaniu pokrewnych gatunków cykad, które mają jeden genom Hodgkinii zawierający 137 geny. 20 z nich występuje w H1 lecz nie ma ich w H2, natomiast 44 są w H2 lecz nie ma ich w H1. Wszystkie (oprócz jednego) znaleziono w jednym lub u obu gatunków potomnych.


Taki wzór bardzo przypomina sytuację, gdy gatunek duplikuje swój cały genom, tak jak zdarzało się wiele razy w procesie ewolucji kwiatów, ryb i innych organizmów. Nagle gatunek ma dwie kopie każdego genu. Ponieważ jest mu potrzebna tylko jedna kopia, w drugiej pojawiają się mutacje prowadzące do nieaktywności i niszczą ją, co się często zdarza. W wyniku tego powstaje genom z prawie taką samą liczbą genów, lecz umieszczoną na podwójnej ilości materiału.


I to właśnie zobaczyli Van Leuven i McCutcheon u swoich cykad, oryginalną bakterię Hodgkinia zdublowaną do dwóch niezależnych genomów, z których jedna tworzy kopię zapasową oryginalnego genomu. Lecz w przypadkach duplikacji całego genomu, zdublowane DNA nadal jest częścią tego samego genomu. Nie w tym przypadku; w tym przypadku H1 i H2 są całkiem oddzielnymi bytami. Proces, w wyniku którego powstały, jest podobny do rozdzielania monet wzdłuż ich brzegu, tak żeby uzyskać monety tylko z reszką oraz tylko z orłem. Przy takim postępowaniu nie powstaje nowy obraz. H1 i H2 nie mają funkcji innych od tych, które posiada H0.


Jest to całkowicie jasne, gdy przyjrzymy się genom. H0 umożliwia przyswajanie przez gospodarza, czyli cykadę składników odżywczych takich jak witamina B12 i metionina. W to zadanie jest zaangażowanych wiele genów, po jednym dla każdego kroku w łańcuchu reakcji chemicznych ostatecznie produkujących podane substancje. Jeżeli chodzi o H1 i H2 jest tak samo, lecz żaden z tych genomów nie ma kompletnego zestawu genów dla pełnego łańcucha. Żaden z nich sam nie może zapewnić cykadom wymaganych czynników odżywczych. Muszą działać razem, przesuwając substancje chemiczne wzdłuż, jak gdyby, linii produkcyjnej przechodzącej pomiędzy dwoma sąsiednimi fabrykami.


Jak taki skomplikowany układ wyewoluował? Jak z populacji H0 powstały żyjące obok siebie komórki H1 i H2?


Bardzo trudne jest uzyskanie pewności, lecz McCutcheon wpadł na koncepcję, którą przedstawiono na rysunku poniżej. Każda bakteria Hodgkinia zawiera tysiące kopii swojego genomu (zielone kółka) w tej samej komórce (czarny obwód). W pewnym punkcie, u jednej bakterii następuje mutacja w jednym z jej genomów, która powoduje uszkodzenie jednego genu (zaznaczonego na żółto). U drugiej bakterii następuje mutacja, znowu w jednym z jej genomów, która powoduje uszkodzenie innego genu (zaznaczonego na niebiesko).


Jak z jednego gatunku bakterii Hodgkinia powstają dwa?. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.
Jak z jednego gatunku bakterii Hodgkinia powstają dwa?. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.

Przy takiej dużej ilości genomów znajdującej się w każdej z komórek powstałe mutacje nie mają znaczenia. Są niewidoczne dla naturalnej selekcji i swobodnie się rozprzestrzeniają. Przy podziale bakterii, przyszłe pokolenia potomne mogą mieć dwa genomy z mutacją, następnie cztery, potem osiem (C).


W końcu występuje pewnego rodzaju wąskie gardło (D) - pewne zdarzenie powodujące powstanie linii komórek, w których wszystkie genomy zawierają żółtą mutację lub niebieską. Żadna z tych dwóch linii nie jest przydatna cykadom pojedynczo, ponieważ żadna z nich nie może zapewnić pełnego zestawu koniecznych czynników odżywczych dla tych owadów. Muszą działać razem, tak więc obie muszą występować w pobliżu. Każda z nich zaczyna tracić coraz więcej genów, lecz zawsze w sposób komplementarny. W końcu przekształcają się w H1 i H2.


Prawdopodobnie pomocne jest, że cykady żyją do 17 lat – to  długo jak na owady, lecz cała  nieskończoność dla bakterii. Przez większość tego czasu cykady mieszkają pod ziemią jako niedojrzałe nimfy (larwy), które ledwie rosną. W ciągu tych lat, symbionty nie mają większego znaczenia. Mogą one zmieniać się, ewoluować, a nawet tworzyć szkodliwe mutacje, nie wpływając na życie swoich gospodarzy. Te same wybryki symbiontów byłyby większym problemem u krótko-żyjących owadów takich jak mszyce, wtedy zarówno gospodarze, jak i mikroby z uszkodzonym genomem byłyby szybko wyeliminowane przez dobór naturalny. Nie jest to prawdopodobnie przypadkiem, że - jak pisze McCutcheon: „U najdłużej żyjących cykad genomy bakterii Hodgkinia skoczyły na głębokie wody”:


„Uważamy, że jest to bardzo wyraźny przypadek nieadaptacyjnej ewolucji”. Hodgkinia niczego nie zyskuje dzięki rozszczepieniu na dwa gatunki tak samo jak cykada. Jest to wynik losowych zdarzeń. Można to potraktować jako bardzo ważne przypomnienie faktu, że ewolucja nie jest dążeniem w kierunku lepszych i bardziej skutecznych form. Czasami, prowadzi do większej złożoności dzięki swojemu działaniu. Jak mówi McCutcheon „nowa symbioza nie jest w żaden sposób lepsza od prostszej wersji. Jest tylko bardziej skomplikowana i się zaklinowała”


Odniesienie:
Van Leuven, Meister, Simon & McCutcheon. 2014. Sympatric Speciation in a Bacterial Endosymbiont Results in Two Genomes with the Functionality of One. Cell. http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2014.07.047

Inne przykład dziwnych symbiontów owadów:  Snug as a Bug in a Bug in a Bug

 

One species becomes two inside an insect

Tłumaczenie: Elżbieta Pląskowska



Ed Yong 


Mieszka w Londynie i pracuje w Cancer Research UK. Jego blog „Not Exactly Rocket Science” jest próbą zainteresowania nauką szerszej rzeszy czytelników poprzez unikanie żargonu i przystępną prezentację.
Strona www autora


Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1476 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

„Grubogłowi przedsiębiorcy pogrzebowi w noc żywych trupów”   Júnior   2022-05-31
„Gryzoń skunksowy”, który żuje trujące rośliny i wypluwa truciznę na swoje futro   Coyne   2020-12-02
„Kryzys klimatyczny” to mistyfikacja   Williams   2023-09-25
„Najbardziej znany zabójca ludzi”: jakie są prawdziwe początki XIV-wiecznej Czarnej Śmierci?   Lewis   2023-09-15
„New Yorker” pisze o hoacynie, sugeruje, że koncepcja Darwina drzew ewolucyjnych może być urojeniem   Coyne   2022-07-25
„San Francisco Chronicle” bardzo myli się w sprawie biologicznej płci   Coyne   2023-06-09
„Zapylisz mnie!”: nachalni bohaterowie świata roślin   Júnior   2022-06-11
“Czarne tygrysy” w małym indyjskim rezerwacie sugerują losowy dryf genetyczny   Coyne   2021-10-26
“Daily Beast” wypacza epigenetykę oszukańczymi twierdzeniami, że dzieci mogą “odziedziczyć wspomnienia Holocaustu”   Coyne   2017-10-05
“Konwergentna” ewolucja mrówek grzybiarek Starego i Nowego świata   Coyne   2023-03-23
“Odwrócenie specjacji” (fuzja gatunków) u kruków   Coyne   2018-03-16
“Partenogenetyczny” rak rozmnaża się bez seksu: czy to jest nowy gatunek?   Coyne   2018-02-17
“Rogi” trylobitów mogły być używane jako broń w walkach między samcami   Coyne   2023-02-15
“Scientific American” poświęca się polityce, a nie nauce; odmawia publikowania krytycznych analiz swoich fałszywych lub wprowadzających w błąd twierdzeń   Coyne   2022-09-01
“Współczesny” Homo sapiens mógł być w Eurazji aż 210 tysięcy lat temu   Coyne   2019-07-17
‘Raniąca’ idea merytorycznych podstaw nauki    i Jerry Coyne   2023-05-29
 Syntetyczna biologia oferuje obietnicę rozwiązania globalnego problemu z plastikiem   Agaba   2021-12-13
10 twierdzeń działaczy walczących w Afryce z GMO o tym, dlaczego postępy w biotechnologii upraw powinny zostać odrzucone – i dlaczego są one błędne   Maina   2022-11-17
100 milionów lat ozdabiania się śmieciami   Yong   2016-07-05
12 podstawowych punktów biologii ewolucyjnej   Cobb   2016-03-02
Pseudonauka Masaru Emoto   Novella   2017-12-18
Czy „toksyczna kobiecość” jest główną przyczyną bojów o społeczną sprawiedliwość?   Coyne   2021-02-08
Paradoksalne cechy genetyki inteligencji   Ridley   2013-12-18
“New Scientist”: Darwin jednak miał rację    Coyne   2020-10-01
Intelektualna pustka numeru “New Scientist” o ewolucji: 1. Genetyczna plastyczność    Coyne   2020-10-03
Intelektualna pustka numeru “New Scientist” o ewolucji: 2. Rzekome nieistnienie gatunków   Coyne   2020-10-05
Klasyczna historia skorygowana: porosty to grzyby + glony + drożdże (inne grzyby)   Coyne   2016-08-05
Homo floresiensis, hominin “hobbit”, w Internecie   Coyne   2016-11-25
No pasarán    Tonhasca Júnior   2023-03-04
Strzelby, zarazki, maszyny to zdecydowanie antyrasistowska książka. Dlaczego lewica jej nie kocha?   Barnett   2021-10-13
„ Całujące się” koralowce złapane in flagranti   Yong   2016-07-28
”Sygnalizowanie cnoty” może nas irytować. Cywilizacja byłaby jednak bez niego niemożliwa    Miller   2019-09-13
A jednak chorują na raka    Łopatniuk   2016-02-13
Czyste okrucieństwo cięć w pomocy żywnościowej   Lomborg   2017-08-07
Dalszy spadek zgonów z powodu raka   Novella   2019-02-04
Dlaczego mamy alergie?   Zimmer   2016-01-28
Dlaczego sądy nie powinny rozstrzygać o nauce     2018-12-13
Dlaczego większość zasobównie wyczerpuje się   Ridley   2014-05-04
Dlaczego zwierzęta są urocze?   Coyne   2014-12-30
Dziennik z Mozambiku: Demony w kurzu   Naskręcki   2018-03-30
Dziwaczne, wysysające krew czerwie jurajskie   Cobb   2014-06-28
Ewolucja, ptaki i kwiaty   Coyne   2014-06-02
Gigantyczne “paleonory” wykopane przez wymarłe ssaki   Coyne   2017-06-29
Grupy anty-GMO przegrywają sprawę sądową w Nigerii    i Nkechi Isaak   2022-07-30
Jak karakara wygrywa z osami   Cobb   2013-12-29
Kiedy zapada noc i ziemia jest ciemna   Tonhasca Júnior   2023-02-10
Kilka lekcji z rosyjskiej rewolucji. Jak kuszący radykalny nihilizm prowadzi do ekstremizmu   Geifman   2021-03-22
Komisja Europejska ukrywa naukę o pszczołach   Ridley   2017-05-03
Malaria pachnąca cytryną    Zimmer   2015-04-07
Małpo ty moja   Koraszewski   2015-04-17
Metamorfozy    Júnior   2022-04-09
Minęło 40 lat od wydania „Samolubnego genu” – śmiała książka Richarda Dawkinsa ostała się próbie czasu   Ridley   2016-02-17
Niezwykły pasikonik szklany   Naskręcki   2014-05-27
Nowe badanie wskazuje na jednego oszusta   Coyne   2016-08-18
Nowy i dziwaczny rodzaj mimikry: nasiona rośliny naśladują kształt i zapach odchodów zwierzęcych, by ułatwić roznoszenie ich przez żuki gnojowe   Coyne   2015-10-20
O porażkach wolności i lęku przed nauką   Dennett   2016-05-20
O rzeczywistości rasy i odrazie do rasizmu    i Brian Boutwell   2017-09-04
Obniżenie poprzeczki dla tradycyjnej medycyny chińskiej dla ideologii i zysku     2017-12-29
Olbrzymie armie o niezliczonych umiejętnościach    Tonhasca Júnior   2024-02-08
Osobisty mikrobiom w cyfrach   Zimmer   2014-08-14
Ostrogony nie są naprawdę “żywymi skamieniałościami”    Coyne   2015-07-29
Palestyńska intersekcjonalność z nazistami   Frantzman   2017-07-08
Pochwała ignorancji, czyli wiem, że nie wiem   Cullen   2017-01-11
Przykre niespodzianki, czyli czerniak i siwizna   Łopatniuk   2015-08-01
Przypuszczalnie złamana kość    Coyne   2015-06-04
Rozum i Wiara IICzyli takie sobie rozmowy o religijnych „prawdach” i problemach z nimi związanych.   Ferus   2015-11-22
Ryba z biodrami   Mayer   2016-03-30
Siedem narzędzi myślenia   Dennett   2014-11-19
Skrzydlaci oszuści i straż obywatelska   Young   2014-01-02
Tako rzecze antyszczepionkowa “wojowniczka mama”, Brittney Kara: jeśli szczepionki są tak wspaniałe, to dlaczego nie wspomina ich Biblia?     2018-04-26
Twardy kwiat do zgryzienia    Tonhasca Júnior   2023-02-22
Wielkoskrzydłe   Naskręcki   2014-04-02
Wierzący nagradzani za życia   Coyne   2014-12-21
Wpaść w amok. Empiryczna analiza szaleńczych zabójstw pokazuje, że wyłaniają się dwa różne wzorce.   King   2023-06-03
Wątpliwi pomocnicy    Tonhasca Júnior   2023-04-08
Świetna ewolucyjna innowacjaktóra okazała się zgubna   Yong   2015-12-10
Dlaczego odmawiamy dostrzegania jaśniejszej strony, choć powinniśmy   Pinker   2018-04-17
Krew, znój, łzy i pot   Tonhasca Júnior   2023-01-19
Mądrość w pułapce autorytetu   Witkowski   2020-04-18
Po prostu nie mogę się doczekać, aby znów wyruszyć w trasę   Tonhasca Júnior   2022-10-27
Pochwała jednoznaczności   Witkowski   2019-10-29
Z perspektywy naszego kurnika   Witkowski   2020-01-16
A co to takie włochate?   Łopatniuk   2016-04-02
A genomy ciągle kurczą się…   Zimmer   2016-11-22
A teraz dobre wiadomości: Sprawy naprawdę idą w dobrym kierunku   Pinker   2015-11-24
A polać wielką wodą…   Cipiur   2019-05-18
A.N. Wilson znowu kopie Darwina, tym razem w “Times”   Coyne   2017-09-07
Adam i Ewa: dwoje, czy więcej niż dwoje przodków?   Coyne   2017-01-07
Afrykańscy naukowcy wzywają do polityki poparcia biologii syntetycznej i innych innowacji   Agaba   2021-12-02
Agroekologia zmienia biednych farmerów w biedniejszych   Muhumuza   2022-06-09
AI – asystent lekarza   Novella   2020-12-09
AI: gorąca randka z “Sydneyem ”   Gotefridi   2023-03-15
Akademicki skandal: troje badaczy umyślnie publikowało fałszywe artykuły o „badaniach żałości”, by pokazać fatalne standardy akademickie w naukach społecznych   Coyne   2018-10-12
Akcja afirmatywna w wieloetnicznym narodzie   Hyams   2020-07-17
Aktywacja telomerazy mogłaby prowadzić do leczenia samej starości   Ridley   2015-10-27
Aktywiści anty-GMO w Afryce szerzą mity i strach, ale nie przedstawiają żadnych naukowych dowodów   Abutu   2023-08-14
Aktywność umysłowa nie zapobiega osłabieniu umysłowej sprawności   Novella   2018-12-15
Akupunktura jadu pszczelego: śmiercionośne znachorstwo, które może zabić     2018-04-23
Akupunktura kontra nauka, wersja lingwistyczna     2017-06-01
Akupunktura kwantowa   Novella   2019-04-23

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk