Prawda

Sobota, 4 maja 2024 - 20:15

« Poprzedni Następny »


Pielęgnice z jeziora w Kamerunie prawdopodobnie nie podlegały specjacji sympatrycznej: Część  2


Jerry A. Coyne 2015-07-10

Wczoraj opisałem tłoniezbędne do zrozumienia nowej pracy w “Evolution” Christophera H. Martina i in. (odnośnik i link poniżej). Dzisiaj pokrótce opiszę ich odkrycia, które rzucają wątpliwość na nasz najlepszy przykład specjacji sympatrycznej.

Tym przykładem było istnienie skupisk ryb pielęgnic w małych jeziorach wulkanicznych w Kamerunie. Ponieważ dowody genetyczne Schliewena i in. (1994) pokazywały, że każde skupisko było monofiletyczne, to jest, wydawało się pochodzić od jednego wspólnego gatunku przodków, którzy zajęli te jeziora wulkaniczne jakiś czas temu (między 1 a 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Bermin), dawało to dowód, że powstanie 11 gatunków w Barombi Mbo i 9 w Bermin odbyło się sympatrycznie – bez geograficznej izolacji populacji.


Tutaj są dwie radiacje, o które chodzi, pokazujące lokalizację jezior wulkanicznych.


Autorzy powtórzyli analizę genetyczną tych dwóch pokazanych powyżej radiacji (a także innych, z innych jezior) produkując ponad 350 milionów sekwencji DNA. (Taki poziom analizy umożliwia nam nowa technika.) Na podstawie tego powtórzyli analizę filogenetyczną. Oto, co znaleźli.

  • “Monofiletyzm” (pochodzenie od wspólnego przodka) radiacji pokazanych powyżej jest słabszy niż sądzono przedtem. Autorzy wnioskują, że ten monofiletyzm, który jest kluczowym dowodem na specjację sympatryczną, nie jest wystarczająco “mocno poparty”.
  • Ponadto wydaje się, że istniała znaczna introgresja (ruch genów) nie tylko między pewnymi gatunkami w każdej z tych dwóch radiacji, ale także między gatunkami w jeziorze i różnymi “grupami zewnętrznymi” w rzekach poza jeziorami. Sugeruje to, że było wiele inwazji jezior przez przodków ryb jezior wulkanicznych, a to przemawia przeciwko jednemu wspólnemu przodkowi tworzącemu w jeziorze wiele gatunków. 

Jak zespół Martina odkrył tę introgresję? Przez patrzenie na asymetrię podobieństwa genetycznego między gatunkami w radiacji, a także między tymi gatunkami, a innymi spoza jeziora. Jak wyjaśniają:


Informacja o ukierunkowaniu introgresji pochodzi z asymetrii stosunków między populacjami przy założeniu drzewa. Na przykład, jeśli wyobrazimy sobie drzewo ((A,B)(C,D)) z następująca potem introgresją B w C, populacja C będzie wykazywała niezwykle wysoką kowariancję z A, ale B nie będzie wykazywała kowariancji z D.


Innymi słowy, jeśli drzewo pokazuje dwie siostrzane pary gatunków (gatunek A blisko spokrewniony z B, a gatunek C blisko spokrewniony z D), i grupę (A + B) bardziej odlegle spokrewnioną z grupą (C + D), można odkryć przesunięcia genów między B i C, które mieszczą się w różnych grupach, jeśli niektóre geny w C można także znaleźć w A. Pokazuje to podobieństwo między gatunkami z różnych grup, którego nie widać u gatunków B i D, także mieszczącymi się w różnych grupach. Ten wzór może zdarzyć się tylko, jeśli było przejście genów między gatunkami w różnych grupach, albo przed, albo podczas specjacji.


Nie będę wnikał we wszystkie drastyczne szczegóły, a prawdę mówiąc, pewne szczegóły tej metodologii umykają mi, ale wyniki są jasne: gatunki w jeziorach nie są przekonująco monofiletyczne, a także ryby wymieniały geny nie tylko wzajem ze sobą, ale z pewnymi gatunkami spoza jeziora.


Jak mogło się to zdarzyć? Na kilka sposobów, które wszystkie łamią koncepcję, że specjacja (tworzenie izolowanych reprodukcyjnie grup w jeziorze po inwazji jednego przodka) zaszła przy swobodnym przepływie genów. Po pierwsze, mogły być wielokrotne inwazje krateru ze strony pojedynczej linii rodowej, która zmieniała się genetycznie między inwazjami. Mogło by to znaczyć, że między inwazjami ewoluowała pewna izolacja reprodukcyjna, co wspierałoby specjację wśród ryb w jeziorze.


Ta izolacja reprodukcyjna mogła nie być pełna i gatunki w stadiach początkowych mogły wymieniać geny, ale stopniowo stawać się pełnymi gatunkami z powodu procesu wzmocnienia. W tym procesie gatunki, które już wyewoluowały pewien stopień izolacji reprodukcyjnej – w postaci problemów hybryd, takich jak bezpłodność lub niezdolność do życia – podlegają następnie doborowi naturalnemu ku rosnącej izolacji seksualnej, ponieważ te osobniki w każdym początkującym gatunku, które kojarzyły się z własnym rodzajem, pozostawiały więcej genów niż te, które kojarzyły się z innym rodzajem. Może to z czasem doprowadzić do izolacji reprodukcyjnej, ale także do wprowadzających w błąd pozorów monofiletyczności między gatunkami, spowodowanej wymianą genów. Nie jest to specjacja sympatryczna, ponieważ niezbędny był okres izolacji geograficznej, by wyewoluować geny „izolacji reprodukcyjnej”.


Scenariusz alternatywny dotyczy wielokrotnej kolonizacji jeziora albo przez różne gatunki przodków, albo, jak powyżej, przez różne odłamy jednej linii rodowej przodków w różnym czasie. Ci wielokrotni kolonizatorzy mogą potem stworzyć rój hybrydowy z obfitym mieszaniem się genów, a potem ten rój może podzielić się na różne gatunki w jeziorze wulkanicznym. Raz jeszcze jednak niezbędna jest specjacja allopatryczna.


W obu wypadkach wymiana genów, która zdarzyła się, kiedy w jeziorze formowały się nowe gatunki, daje pozór, że wszystkie są potomkami jednego przodka, który dostał się do jeziora tylko raz, w rzeczywistości jednak podczas tej specjacji była faza allopatryczna (izolacja geograficzna).


Niezależnie od tego, co się zdarzyło, sygnał o wymianie genów jest wyraźny i w zasadzie wyklucza radiacje w tych dwóch jeziorach wulkanicznych jako wynik czysto sympatrycznej specjacji. (Spieszę dodać, że część rozejścia się genetycznego między gatunkami z pewnością wyewoluowała w kraterze, ale izolacja reprodukcyjna wymagała także fazy allopatrycznej przynajmniej podczas pewnej części procesu).


Autorzy zauważają także, że jeziora wulkaniczne mają pewne nisze ekologiczne i, jeśli ryby kojarzą się tam, gdzie żyją, ułatwiłoby to specjację na małym obszarze, który jednak daje izolację przestrzenną między podlegającymi specjacji gatunkami. Cechy zwierząt i roślin, które dają automatyczny związek między lokalizacją a czasem kojarzenia się, nazywane są „cechami magicznymi”, ponieważ mają podwójny efekt. Na przykład, jedna ciężarna samica ryby może trzymać się przy dnie jeziora wulkanicznego i jej potomstwo tam wyklute wykazuje tendencję do pozostawania tam, jak również kojarzenia się z innymi w pobliżu, co prowadzi do pewnego rodzaju izolacji geograficznej oparte na ograniczonym przepływie genów między rybami, które lubią przebywać w różnych częściach jeziora. Wymaga to tylko, by ryba miała tendencję do kojarzenia się i posiadania potomstwa na pewnych obszarach, a potomstwo kojarzyło się z tymi, którzy są w pobliżu. Z czasem dałoby to selekcję do adaptowania się do środowiska i wygląd izolacji reprodukcyjnej jako skutek uboczny. Na poparcie tego autorzy notują, że wiele gatunków w tych dwóch radiacjach pokazanych powyżej jest „wyspecjalizowana środowiskowo”, znajdowana najczęściej w jednej konkretnej części jeziora.


Tak więc istnienie “cech magicznych” może ułatwiać specjację, ale nie jest to specjacja sympatryczna w ścisłym sensie, która jest tworzeniem nowych gatunków bez żadnej separacji fizycznej. Na zakończenie autorzy piszą:


Dostępne dowody sugerują, że wszystkie radiacje pielęgnic z jezior wulkanicznych podlegały specjacji przy pomocy podwójnych inwazji (Schliewen et al. 2006; Geiger et al. 2013) lub pozostały na etapie początkujących kompleksów gatunków (Elmer et al. 2010b; Martin 2012, 2013). Według tego, co wiemy, wszystkie przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza radiacjami pielęgnic z jezior wulkanicznych obejmują jakąś formę automatycznego powiązania między rozejściem się ekologicznym a czasem lub lokalizacją kojarzenia, znaną jako “automatyczne cechy magiczne” (patrz przegląd w Servedio et al. 2011).


Jakie są owe przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza pielęgnicami z jezior wulkanicznych? Jednym z nich są dwa siostrzane gatunki drzew palmowych, które rozdzieliły się na wyspie Lord Howe. (Patrz mój opis tej sytuacji w News and Views “Speciation in a small space“; odnośnik poniżej). W tym przypadku kilka palm z kolonizujących gatunków znalazło się w suchej glebie, co automatycznie powoduje wcześniejsze kwitnienie niż roślin w wilgotniejszej glebie (w suchej glebie muszą mieć nasiona tak szybko, jak to możliwe, ponieważ wysychająca gleba może zredukować zdolność do reprodukowania się). Tak więc te palmy produkujące pyłek i zalążki równocześnie miały większe prawdopodobieństwo kojarzenia się wzajem ze sobą niż z palmami tego samego gatunku, które rosły na wilgotniejszej glebie, a które kwitły później. To mogło z czasem dać zróżnicowaną ewolucję adaptacyjną oraz izolację reprodukcyjną. Życie na suchej glebie jest jednym przykładem cechy magicznej, w której środowisko i reprodukcja są automatycznie powiązane.


Martin i in. podają trzy inne przykłady specjacji sympatrycznej, które uważają za przekonujące. Jednym jest przypadek dwóch grup mszyc (Acyrthosiphon pisum), które żyją na lucernie i pomidorach w USA i mówi się o nich, że ich specjacja była sympatryczna (pola pomidorów często leżą obok pól lucerny). Allen Orr i ja pokazaliśmy jednak w Speciation, że nie jest to dobry przykład specjacji sympatrycznej, ponieważ rozejście się nastąpiło prawdopodobnie w Europie, gdzie mszyce żyją na wielu roślinach, a potem była podwójna kolonizacja USA.


Dwa inne przypadki dotyczą golców i myszy kolczastych z Kanionu Ewolucji w Izraelu, kanionu, który ma ekologicznie odrębne strony. Nie czytałem jeszcze tych prac, więc nie mogę ich komentować. Jasne jest jednak po artykule zespołu Martina, że najbardziej przekonujący przykład specjacji sympatrycznej, jaki mieliśmy, nie jest już dłużej tak przekonujący.


Co pozostaje? Rośliny z Lord Howe są dobrym przykładem specjacji na bardzo małej wyspie, ale należy zbadać, czy “cechy magiczne” mogły tam działać. Poza tymi roślinami jest kilka innych przypadków (inne ryby i osy figowe), które wspomnieliśmy w Speciation, ale dowody nie były zbyt mocne. Wszystkie dane sugerują, że choć specjacja sympatryczna ze swobodnym przepływem genów jest teoretycznie możliwa, niewiele jest dowodów, że zachodzi w naturze. Z pewnością są jakieś przypadki (wszystko, co jest możliwe, zdarzyło się przynajmniej raz w ewolucji) i oczywiście zdobycie dobrych dowodów dla tych przypadków będzie trudne. Możemy jednak powiedzieć, że nie ma wystarczających danych do często powtarzanego twierdzenia, że specjacja sympatryczna jest powszechna.

___________

Coyne, J. A. Speciation in a small space. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 108:12975-12976.

Martin, C. H., et al. (2015). Complex histories of repeated gene flow in Cameroon crater lake cichlids cast doubt on one of the clearest examples of sympatric speciation. Evolution 69(6): 1406-1422.

Schliewen, U. K., et al. (1994). Sympatric speciation suggested by monophyly of crater lake cichlids. Nature 368: 629-632.


Cameroon lake cichlids probably did not speciate sympatrically part 2

Why Evolution Is True, 26 czerwca 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Jerry A. Coyne

Profesor na wydziale ekologii i ewolucji University of Chicago, jego książka "Why Evolution is True" (Polskie wydanie: "Ewolucja jest faktem", Prószyński i Ska, 2009r.) została przełożona na kilkanaście języków, a przez Richarda Dawkinsa jest oceniana jako najlepsza książka o ewolucji.  Jerry Coyne jest jednym z najlepszych na świecie specjalistów od specjacji, rozdzielania się gatunków.  Jest wielkim miłośnikiem kotów i osobistym przyjacielem redaktor naczelnej.

Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1476 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Kameleon przekazuje różne informacje różnymi częściami ciała   Yong   2013-12-14
Paradoksalne cechy genetyki inteligencji   Ridley   2013-12-18
Wielki skandal z biopaliwami   Lomborg   2013-12-19
Przedwczesna wiadomość o śmierci samolubnego genu   Coyne   2013-12-22
Czy jest życie na Europie?   Ridley   2013-12-22
Nowa data udomowienia kotów: około 5300 lat temu – i to w Chinach   Coyne   2013-12-26
Na Zeusa, natura jest przeżarta rują i korupcją   Koraszewski   2013-12-26
Proces cywilizacji   Ridley   2013-12-28
Jak karakara wygrywa z osami   Cobb   2013-12-29
Żebropławy, czyli dziwactwa ewolucji   Coyne   2013-12-30
Czy może istnieć sztuka bez artysty?    Wadhawan   2013-12-30
Zderzenie mentalności   Koraszewski   2014-01-01
Skrzydlaci oszuści i straż obywatelska   Young   2014-01-02
Delfiny umyślnie narkotyzują się truciznami rozdymków   Coyne   2014-01-04
Długi cień anglosfery   Ridley   2014-01-05
Ciemna materia genetyki psychiatrycznej   Zimmer   2014-01-06
Co czyni nas ludźmi?   Dawkins   2014-01-07
Twoja choroba na szalce   Yong   2014-01-08
Czy mamut włochaty potrzebuje adwokata?   Zimmer   2014-01-09
Pradawne rośliny kwitnące znalezione w bursztynie   Coyne   2014-01-10
Ratując gatunek możesz go niechcący skazać   Yong   2014-01-11
Ewolucja ukryta w pełnym świetle   Zimmer   2014-01-13
Koniec humanistyki?   Coyne   2014-01-15
Jak poruszasz nogą, która kiedyś była płetwą?   Yong   2014-01-16
Jak wyszliśmy na ląd, kość za kością   Zimmer   2014-01-19
Twoja wewnętrzna mucha   Cobb   2014-01-22
Ukwiał żyje w antarktycznym lodzie!   Coyne   2014-01-25
Dlaczego poligamia zanika?   Ridley   2014-01-26
Wspólne pochodzenie sygnałów płodności   Cobb   2014-01-28
Ewolucja i Bóg   Coyne   2014-01-29
O delfinach, dużych mózgach i skokach logiki   Yong   2014-01-30
Dziennikarski „statek upiorów” Greg Mayer   Mayer   2014-01-31
Dlaczego leniwce wypróżniają się na ziemi?   Bruce Lyon   2014-02-02
Moda na kopanie nauki   Coyne   2014-02-03
Neandertalczycy: bliscy obcy   Zimmer   2014-02-05
O pochodzeniu dobra i zła   Coyne   2014-02-05
Sposób znajdowania genów choroby   Yong   2014-02-07
Czy humaniści boją się nauki?   Coyne   2014-02-07
Kiedy zróżnicowały się współczesne ssaki łożyskowe?   Mayer   2014-02-10
O przyjaznej samolubności   Koraszewski   2014-02-12
Skąd wiesz, że znalazłeś je wszystkie?   Zimmer   2014-02-15
Nauka odkrywa nową niewiedzę o przeszłości   Ridley   2014-02-18
Żyjące gniazdo?   Zimmer   2014-02-19
Planeta tykwy pospolitej   Zimmer   2014-02-21
Nowe niezwykłe skamieniałości typu “Łupki z Burgess”   Coyne   2014-02-22
Dziennik z Mozambiku: Pardalota   Naskręcki   2014-02-23
Wskrzeszona odpowiedź z kredy na “chorobę królów”   Yong   2014-02-26
Dziennik z Mozambiku: Sybilla     2014-03-01
Spojrzeć ślepym okiem   Yong   2014-03-02
Intelektualne danie dnia  The Big Think   Coyne   2014-03-04
Przeczołgać się przez mózg i nie zgubić się   Zimmer   2014-03-05
Gdzie podziewają się żółwiki podczas zgubionych lat?   Yong   2014-03-10
Supergen, który maluje kłamcę   Yong   2014-03-14
Idea, którą pora oddać na złom   Koraszewski   2014-03-15
Zwycięstwa bez chwały   Ridley   2014-03-17
Twarde jak skała   Naskręcki   2014-03-18
Pasożyty informacyjne   Zimmer   2014-03-19
Seymour Benzer: humor, historia i genetyka   Cobb   2014-03-21
Kto to był Per Brinck?   Naskręcki   2014-03-23
Potrafimy rozróżnić między przynajmniej bilionem zapachów   Yong   2014-03-25
Godzina Ziemi czyli o celebrowaniu ciemności   Lomborg   2014-03-27
Słonie słyszą więcej niż ludzie   Yong   2014-03-30
Niebo gwiaździste nade mną, małpa włochata we mnie   Koraszewski   2014-03-31
Wielkoskrzydłe   Naskręcki   2014-04-02
Najstarsze żyjące organizmy   Coyne   2014-04-03
Jak zmienić bakterie jelitowe w dziennikarzy   Yong   2014-04-06
Eureka! Sprytne wrony to odkryły   Coyne   2014-04-07
Sukces upraw GM w Indiach   Lomborg   2014-04-09
Wirus, który sterylizuje owady, ale je pobudza   Yong   2014-04-12
Przystosować się do zmiany klimatu   Ridley   2014-04-14
Jeden oddech, który zmienił planetę   Naskręcki   2014-04-16
Najgorsze w karmieniu komarów jest czekanie   Yong   2014-04-17
Kłopotliwa podróż w przyszłość   Ridley   2014-04-19
Pierwsze spojrzenie na mikroby współczesnych łowców zbieraczy     2014-04-23
Seksizm w nauce o jaskiniowych owadach   Coyne   2014-04-26
Musza bakteria zaprasza inne muszki na uczty owocowe   Yong   2014-04-27
Zachwycający rabuś, który liczy sto milionów lat   Cobb   2014-04-28
Mądrość (małych) tłumów   Zimmer   2014-04-29
Tak bada się ewolucję inteligencji u zwierząt   Yong   2014-05-02
Fantastyczna mimikra tropikalnego pnącza   Coyne   2014-05-03
Dlaczego większość zasobównie wyczerpuje się   Ridley   2014-05-04
Pomidory tworzą pestycydy z zapachu swoich sąsiadów   Yong   2014-05-07
Potrawy z pasożytów   Zimmer   2014-05-08
Technologia jest często matką nauki, a nie odwrotnie   Ridley   2014-05-09
Montezuma i jego flirty   Coyne   2014-05-11
Insekt dziedziczy mikroby z plemnika taty   Yong   2014-05-12
Polowanie na nietoperze   Naskręcki   2014-05-14
Zmień swoje geny przez zmianę swojego życia   Coyne   2014-05-15
Obrona śmieciowego DNA   Zimmer   2014-05-17
Gdzie są badania zwierzęcych wagin?   Yong   2014-05-20
Niemal ssaki   Naskręcki   2014-05-21
Zobaczyć jak splątane są gałęzie drzewa   Zimmer   2014-05-23
Dlaczego ramiona ośmiornicy nie plączą się   Yong   2014-05-24
Niezwykły pasikonik szklany   Naskręcki   2014-05-27
Wąż zgubiony i ponownie odnaleziony   Mayer   2014-05-28
Niespodziewani krewni mamutaków   Yong   2014-05-30
Trochę lepszy  świat   Ridley   2014-05-31
Tam, gdzie są ptaki   Mayer   2014-06-01
Ewolucja, ptaki i kwiaty   Coyne   2014-06-02
Jestem spełniony   Naskręcki   2014-06-04

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk