Prawda

Sobota, 18 maja 2024 - 14:18

« Poprzedni Następny »


Pielęgnice z jeziora w Kamerunie prawdopodobnie nie podlegały specjacji sympatrycznej: Część  2


Jerry A. Coyne 2015-07-10

Wczoraj opisałem tłoniezbędne do zrozumienia nowej pracy w “Evolution” Christophera H. Martina i in. (odnośnik i link poniżej). Dzisiaj pokrótce opiszę ich odkrycia, które rzucają wątpliwość na nasz najlepszy przykład specjacji sympatrycznej.

Tym przykładem było istnienie skupisk ryb pielęgnic w małych jeziorach wulkanicznych w Kamerunie. Ponieważ dowody genetyczne Schliewena i in. (1994) pokazywały, że każde skupisko było monofiletyczne, to jest, wydawało się pochodzić od jednego wspólnego gatunku przodków, którzy zajęli te jeziora wulkaniczne jakiś czas temu (między 1 a 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Bermin), dawało to dowód, że powstanie 11 gatunków w Barombi Mbo i 9 w Bermin odbyło się sympatrycznie – bez geograficznej izolacji populacji.


Tutaj są dwie radiacje, o które chodzi, pokazujące lokalizację jezior wulkanicznych.


Autorzy powtórzyli analizę genetyczną tych dwóch pokazanych powyżej radiacji (a także innych, z innych jezior) produkując ponad 350 milionów sekwencji DNA. (Taki poziom analizy umożliwia nam nowa technika.) Na podstawie tego powtórzyli analizę filogenetyczną. Oto, co znaleźli.

  • “Monofiletyzm” (pochodzenie od wspólnego przodka) radiacji pokazanych powyżej jest słabszy niż sądzono przedtem. Autorzy wnioskują, że ten monofiletyzm, który jest kluczowym dowodem na specjację sympatryczną, nie jest wystarczająco “mocno poparty”.
  • Ponadto wydaje się, że istniała znaczna introgresja (ruch genów) nie tylko między pewnymi gatunkami w każdej z tych dwóch radiacji, ale także między gatunkami w jeziorze i różnymi “grupami zewnętrznymi” w rzekach poza jeziorami. Sugeruje to, że było wiele inwazji jezior przez przodków ryb jezior wulkanicznych, a to przemawia przeciwko jednemu wspólnemu przodkowi tworzącemu w jeziorze wiele gatunków. 

Jak zespół Martina odkrył tę introgresję? Przez patrzenie na asymetrię podobieństwa genetycznego między gatunkami w radiacji, a także między tymi gatunkami, a innymi spoza jeziora. Jak wyjaśniają:


Informacja o ukierunkowaniu introgresji pochodzi z asymetrii stosunków między populacjami przy założeniu drzewa. Na przykład, jeśli wyobrazimy sobie drzewo ((A,B)(C,D)) z następująca potem introgresją B w C, populacja C będzie wykazywała niezwykle wysoką kowariancję z A, ale B nie będzie wykazywała kowariancji z D.


Innymi słowy, jeśli drzewo pokazuje dwie siostrzane pary gatunków (gatunek A blisko spokrewniony z B, a gatunek C blisko spokrewniony z D), i grupę (A + B) bardziej odlegle spokrewnioną z grupą (C + D), można odkryć przesunięcia genów między B i C, które mieszczą się w różnych grupach, jeśli niektóre geny w C można także znaleźć w A. Pokazuje to podobieństwo między gatunkami z różnych grup, którego nie widać u gatunków B i D, także mieszczącymi się w różnych grupach. Ten wzór może zdarzyć się tylko, jeśli było przejście genów między gatunkami w różnych grupach, albo przed, albo podczas specjacji.


Nie będę wnikał we wszystkie drastyczne szczegóły, a prawdę mówiąc, pewne szczegóły tej metodologii umykają mi, ale wyniki są jasne: gatunki w jeziorach nie są przekonująco monofiletyczne, a także ryby wymieniały geny nie tylko wzajem ze sobą, ale z pewnymi gatunkami spoza jeziora.


Jak mogło się to zdarzyć? Na kilka sposobów, które wszystkie łamią koncepcję, że specjacja (tworzenie izolowanych reprodukcyjnie grup w jeziorze po inwazji jednego przodka) zaszła przy swobodnym przepływie genów. Po pierwsze, mogły być wielokrotne inwazje krateru ze strony pojedynczej linii rodowej, która zmieniała się genetycznie między inwazjami. Mogło by to znaczyć, że między inwazjami ewoluowała pewna izolacja reprodukcyjna, co wspierałoby specjację wśród ryb w jeziorze.


Ta izolacja reprodukcyjna mogła nie być pełna i gatunki w stadiach początkowych mogły wymieniać geny, ale stopniowo stawać się pełnymi gatunkami z powodu procesu wzmocnienia. W tym procesie gatunki, które już wyewoluowały pewien stopień izolacji reprodukcyjnej – w postaci problemów hybryd, takich jak bezpłodność lub niezdolność do życia – podlegają następnie doborowi naturalnemu ku rosnącej izolacji seksualnej, ponieważ te osobniki w każdym początkującym gatunku, które kojarzyły się z własnym rodzajem, pozostawiały więcej genów niż te, które kojarzyły się z innym rodzajem. Może to z czasem doprowadzić do izolacji reprodukcyjnej, ale także do wprowadzających w błąd pozorów monofiletyczności między gatunkami, spowodowanej wymianą genów. Nie jest to specjacja sympatryczna, ponieważ niezbędny był okres izolacji geograficznej, by wyewoluować geny „izolacji reprodukcyjnej”.


Scenariusz alternatywny dotyczy wielokrotnej kolonizacji jeziora albo przez różne gatunki przodków, albo, jak powyżej, przez różne odłamy jednej linii rodowej przodków w różnym czasie. Ci wielokrotni kolonizatorzy mogą potem stworzyć rój hybrydowy z obfitym mieszaniem się genów, a potem ten rój może podzielić się na różne gatunki w jeziorze wulkanicznym. Raz jeszcze jednak niezbędna jest specjacja allopatryczna.


W obu wypadkach wymiana genów, która zdarzyła się, kiedy w jeziorze formowały się nowe gatunki, daje pozór, że wszystkie są potomkami jednego przodka, który dostał się do jeziora tylko raz, w rzeczywistości jednak podczas tej specjacji była faza allopatryczna (izolacja geograficzna).


Niezależnie od tego, co się zdarzyło, sygnał o wymianie genów jest wyraźny i w zasadzie wyklucza radiacje w tych dwóch jeziorach wulkanicznych jako wynik czysto sympatrycznej specjacji. (Spieszę dodać, że część rozejścia się genetycznego między gatunkami z pewnością wyewoluowała w kraterze, ale izolacja reprodukcyjna wymagała także fazy allopatrycznej przynajmniej podczas pewnej części procesu).


Autorzy zauważają także, że jeziora wulkaniczne mają pewne nisze ekologiczne i, jeśli ryby kojarzą się tam, gdzie żyją, ułatwiłoby to specjację na małym obszarze, który jednak daje izolację przestrzenną między podlegającymi specjacji gatunkami. Cechy zwierząt i roślin, które dają automatyczny związek między lokalizacją a czasem kojarzenia się, nazywane są „cechami magicznymi”, ponieważ mają podwójny efekt. Na przykład, jedna ciężarna samica ryby może trzymać się przy dnie jeziora wulkanicznego i jej potomstwo tam wyklute wykazuje tendencję do pozostawania tam, jak również kojarzenia się z innymi w pobliżu, co prowadzi do pewnego rodzaju izolacji geograficznej oparte na ograniczonym przepływie genów między rybami, które lubią przebywać w różnych częściach jeziora. Wymaga to tylko, by ryba miała tendencję do kojarzenia się i posiadania potomstwa na pewnych obszarach, a potomstwo kojarzyło się z tymi, którzy są w pobliżu. Z czasem dałoby to selekcję do adaptowania się do środowiska i wygląd izolacji reprodukcyjnej jako skutek uboczny. Na poparcie tego autorzy notują, że wiele gatunków w tych dwóch radiacjach pokazanych powyżej jest „wyspecjalizowana środowiskowo”, znajdowana najczęściej w jednej konkretnej części jeziora.


Tak więc istnienie “cech magicznych” może ułatwiać specjację, ale nie jest to specjacja sympatryczna w ścisłym sensie, która jest tworzeniem nowych gatunków bez żadnej separacji fizycznej. Na zakończenie autorzy piszą:


Dostępne dowody sugerują, że wszystkie radiacje pielęgnic z jezior wulkanicznych podlegały specjacji przy pomocy podwójnych inwazji (Schliewen et al. 2006; Geiger et al. 2013) lub pozostały na etapie początkujących kompleksów gatunków (Elmer et al. 2010b; Martin 2012, 2013). Według tego, co wiemy, wszystkie przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza radiacjami pielęgnic z jezior wulkanicznych obejmują jakąś formę automatycznego powiązania między rozejściem się ekologicznym a czasem lub lokalizacją kojarzenia, znaną jako “automatyczne cechy magiczne” (patrz przegląd w Servedio et al. 2011).


Jakie są owe przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza pielęgnicami z jezior wulkanicznych? Jednym z nich są dwa siostrzane gatunki drzew palmowych, które rozdzieliły się na wyspie Lord Howe. (Patrz mój opis tej sytuacji w News and Views “Speciation in a small space“; odnośnik poniżej). W tym przypadku kilka palm z kolonizujących gatunków znalazło się w suchej glebie, co automatycznie powoduje wcześniejsze kwitnienie niż roślin w wilgotniejszej glebie (w suchej glebie muszą mieć nasiona tak szybko, jak to możliwe, ponieważ wysychająca gleba może zredukować zdolność do reprodukowania się). Tak więc te palmy produkujące pyłek i zalążki równocześnie miały większe prawdopodobieństwo kojarzenia się wzajem ze sobą niż z palmami tego samego gatunku, które rosły na wilgotniejszej glebie, a które kwitły później. To mogło z czasem dać zróżnicowaną ewolucję adaptacyjną oraz izolację reprodukcyjną. Życie na suchej glebie jest jednym przykładem cechy magicznej, w której środowisko i reprodukcja są automatycznie powiązane.


Martin i in. podają trzy inne przykłady specjacji sympatrycznej, które uważają za przekonujące. Jednym jest przypadek dwóch grup mszyc (Acyrthosiphon pisum), które żyją na lucernie i pomidorach w USA i mówi się o nich, że ich specjacja była sympatryczna (pola pomidorów często leżą obok pól lucerny). Allen Orr i ja pokazaliśmy jednak w Speciation, że nie jest to dobry przykład specjacji sympatrycznej, ponieważ rozejście się nastąpiło prawdopodobnie w Europie, gdzie mszyce żyją na wielu roślinach, a potem była podwójna kolonizacja USA.


Dwa inne przypadki dotyczą golców i myszy kolczastych z Kanionu Ewolucji w Izraelu, kanionu, który ma ekologicznie odrębne strony. Nie czytałem jeszcze tych prac, więc nie mogę ich komentować. Jasne jest jednak po artykule zespołu Martina, że najbardziej przekonujący przykład specjacji sympatrycznej, jaki mieliśmy, nie jest już dłużej tak przekonujący.


Co pozostaje? Rośliny z Lord Howe są dobrym przykładem specjacji na bardzo małej wyspie, ale należy zbadać, czy “cechy magiczne” mogły tam działać. Poza tymi roślinami jest kilka innych przypadków (inne ryby i osy figowe), które wspomnieliśmy w Speciation, ale dowody nie były zbyt mocne. Wszystkie dane sugerują, że choć specjacja sympatryczna ze swobodnym przepływem genów jest teoretycznie możliwa, niewiele jest dowodów, że zachodzi w naturze. Z pewnością są jakieś przypadki (wszystko, co jest możliwe, zdarzyło się przynajmniej raz w ewolucji) i oczywiście zdobycie dobrych dowodów dla tych przypadków będzie trudne. Możemy jednak powiedzieć, że nie ma wystarczających danych do często powtarzanego twierdzenia, że specjacja sympatryczna jest powszechna.

___________

Coyne, J. A. Speciation in a small space. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 108:12975-12976.

Martin, C. H., et al. (2015). Complex histories of repeated gene flow in Cameroon crater lake cichlids cast doubt on one of the clearest examples of sympatric speciation. Evolution 69(6): 1406-1422.

Schliewen, U. K., et al. (1994). Sympatric speciation suggested by monophyly of crater lake cichlids. Nature 368: 629-632.


Cameroon lake cichlids probably did not speciate sympatrically part 2

Why Evolution Is True, 26 czerwca 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Jerry A. Coyne

Profesor na wydziale ekologii i ewolucji University of Chicago, jego książka "Why Evolution is True" (Polskie wydanie: "Ewolucja jest faktem", Prószyński i Ska, 2009r.) została przełożona na kilkanaście języków, a przez Richarda Dawkinsa jest oceniana jako najlepsza książka o ewolucji.  Jerry Coyne jest jednym z najlepszych na świecie specjalistów od specjacji, rozdzielania się gatunków.  Jest wielkim miłośnikiem kotów i osobistym przyjacielem redaktor naczelnej.

Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1479 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Tajemnice życia płodowego   Zimmer   2014-06-07
Czy ludzkość zmierza w kierunku kanibalizmu?   Lomborg   2014-06-09
Milczenie świerszczy   Yong   2014-06-11
Maccartyzm w klimatologii   Lomborg   2014-06-12
Życie w powiększeniu   Zimmer   2014-06-13
Pół miliarda lat samobójstw   Yong   2014-06-14
Amfisbeny   Naskręcki   2014-06-16
Pająk upodabnia się do ptasich odchodów   Coyne   2014-06-17
Tajemny składnik młodej krwi: oksytocyna?   Zimmer   2014-06-18
Architektura żywych budowli   Yong   2014-06-20
Krótko żyjące zwierzęta i bardzo stare rośliny   Zimmer   2014-06-21
Pająki społeczne wybierają swoje kariery   Yong   2014-06-23
Skrzydlata rzeka   Zimmer   2014-06-25
Dziwaczne, wysysające krew czerwie jurajskie   Cobb   2014-06-28
Zaproszenie na wspólne polowanie   Yong   2014-06-30
Marnie napisany artykuł o uroczym gryzoniu   Coyne   2014-07-03
Jak przypadek pomógł znaleźć sposób na suszę   Klein Leichman   2014-07-04
Przespać atak antybiotyku   Yong   2014-07-06
Uprawy GM są dobre dla środowiska     2014-07-08
Trawa w uchu. Ale po co?   Coyne   2014-07-09
Zoo w gębie   Zimmer   2014-07-10
Suplementem diety wampira   Yong   2014-07-11
Seks z wymarłym ludem dał gen życia na wysokości   Yong   2014-07-15
Lot przez przestrzeń wewnętrzną   Zimmer   2014-07-17
Osa, która zatyka wejście do gniazda trupami mrówek   Yong   2014-07-18
Czym jest nauka i dlaczego ma nas obchodzić?   Sokal   2014-07-22
Nowy, opierzony i czteroskrzydły dinosaur   Coyne   2014-07-23
Oglądanie oceanu brzęczącym nosem   Zimmer   2014-07-26
OLBRZYMI owad wodny (i kilka innych)   Coyne   2014-07-28
Najbardziej zdumiewające oczy w przyrodzie   Yong   2014-07-29
Czy jaszczurka “widzi” skórą   Yong   2014-08-02
Nowy opierzony dinozaur sugeruje, że większość dinozaurów miała pióra   Coyne   2014-08-03
Ewolucja łożyska a seksualna zimna wojna   Yong   2014-08-04
Energia odnawialna nie działa   Ridley   2014-08-07
Czy istnieje darwinowskie wyjaśnienie ludzkiej kreatywności?   Dennett   2014-08-08
Gry zespołowe plemników   Yong   2014-08-09
Oko ciemieniowe hatterii   Mayer   2014-08-10
Osobisty mikrobiom w cyfrach   Zimmer   2014-08-14
Izraelska koszulka EKG monitoruje serca, ratuje życie   Shamah   2014-08-17
Grantowie na Galápagos i ich hybrydowe gatunki   Coyne   2014-08-18
Ośmiornica dba o swoje jaja przez 53 miesiące, a potem umiera   Yong   2014-08-20
Cuda genetyki: arbuz bez pestek   Coyne   2014-08-25
Utracony sposób tworzenia ciał przed istnieniem  szkieletów i muszli   Yong   2014-08-26
Usunięcie obrzydzenia z medycyny mikrobiomowej   Zimmer   2014-08-28
Tysiąc współpracujących, samorganizujących się robotów   Yong   2014-08-30
Nogoprządki   Naskręcki   2014-09-01
Drzewo zapachów   Zimmer   2014-09-02
Sposób szczura na trujący pokarm   Yong   2014-09-05
Raczkowanie w ewolucji   Zimmer   2014-09-06
Zmieniająca kolor płachta zainspirowana skórą ośmiornicy   Yong   2014-09-08
Erotyczna doniosłość bioder walenia   Zimmer   2014-09-11
Co słychać w sprawie globalnego ocieplenia?   Ridley   2014-09-14
Foki mogły przenieść gruźlicę do Nowego Świata   Yong   2014-09-16
Jak kolibry odzyskały utracone przez ptaki odczuwanie słodyczy   Yong   2014-09-19
Ochrona zagrożonych węży wymaga ochrony węży jadowitych   Yong   2014-09-22
Uo, zaklinacz deszczu   Naskręcki   2014-09-23
Co wypadające dyski mówią nam o 700 milionach lat ewolucji   Zimmer   2014-09-24
O korzyściach przypadkowego kolekcjonowania okazów   Naskręcki   2014-09-28
Pradawnym płazom odrastały kończyny   Coyne   2014-09-29
Trawienny drapacz chmur   Yong   2014-09-30
Ofiary naszych ułomności   Naskręcki   2014-10-02
Jak dotarliśmy do teraźniejszości   Ridley   2014-10-05
Dlaczego kod genetyczny nie jest uniwersalny   Cobb   2014-10-06
Ukryte przed wzrokiem zoo w Central Park   Zimmer   2014-10-09
Specjacja sympatryczna we wnętrzu cykady   Yong   2014-10-10
Nocny stukot małych kopyt   Naskręcki   2014-10-12
Wojna domowa w ludzkim genomie     2014-10-13
Penetrujący jaskinie robot-wąż wzorowany na grzechotnikach rogatych   Yong   2014-10-19
Dowody ewolucji: wideo i nieco dłuższy wywód   Coyne   2014-10-22
O wyższości lepszego nad gorszym   Zimmer   2014-10-26
Powódź pożyczonych genów u powstania maleńkich ekstremistów   Yong   2014-10-30
Tak, neandertalczycy to my!   Mayer   2014-11-04
Zgarbowate   Naskręcki   2014-11-10
Facet od nauki przeciwko GMO   Coyne   2014-11-12
Figę dostaje ten kto rano wstaje   Yong   2014-11-13
Mrówki, altruizm i poświęcenie   Ridley   2014-11-14
Norowirus: doskonały patogen wyłania się z cienia   Zimmer   2014-11-15
Siedem narzędzi myślenia   Dennett   2014-11-19
Ciężarna wężyca przygotowuje się do macierzyństwa   Yong   2014-11-20
Naturalność życia rodzinnego?   Zimmer   2014-11-25
Genetyka kocich łat   Coyne   2014-11-26
Świat RNA   Cobb   2014-11-27
Dymorfizm płciowy i ideologia   Coyne   2014-12-01
Gdy mutację przeciwstawić infekcji – od anemii sierpowatej do Eboli   Lewis   2014-12-02
Nasze wewnętrzne pióra   Zimmer   2014-12-03
Nie wszystkie muchy latają   Naskręcki   2014-12-04
Jest tuż za tobą! Czy to duch, czy robot?   Yong   2014-12-06
Najstarsza jak dotąd identyfikacja medycyny sądowej   Coyne   2014-12-10
Samoloty bez pilotów i samochody bez kierowców   Ridley   2014-12-11
Tworzenie dowodów w oparciu o politykę   Ridley   2014-12-16
Pisklę przypominające wyglądem i zachowaniem trującą gąsienicę   Coyne   2014-12-18
Wierzący nagradzani za życia   Coyne   2014-12-21
Nietoperze owocożerne także mają sonar (ale niezbyt dobry)   Yong   2014-12-22
Implanty WiFi do mózgu dla rąk robota   Zimmer   2014-12-25
Naukowcy wprowadzają nową tradycję kulturową dzikim sikorkom   Yong   2014-12-26
List do władz Uniwersytetu  Harvarda   Pinker   2014-12-26
Dlaczego zwierzęta są urocze?   Coyne   2014-12-30
Dlaczego te dziwaczne owady sygnalizują ostrzeżenie po ataku?   Yong   2014-12-31
Leniwce i pancerniki widzą czarno-biały świat   Yong   2015-01-06
Ogony CAT osłabiają centralny dogmat – dlaczego ma to znaczenie i dlaczego nie ma   Cobb   2015-01-08

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk