Prawda

Sobota, 18 maja 2024 - 09:30

« Poprzedni Następny »


Pielęgnice z jeziora w Kamerunie prawdopodobnie nie podlegały specjacji sympatrycznej: Część  2


Jerry A. Coyne 2015-07-10

Wczoraj opisałem tłoniezbędne do zrozumienia nowej pracy w “Evolution” Christophera H. Martina i in. (odnośnik i link poniżej). Dzisiaj pokrótce opiszę ich odkrycia, które rzucają wątpliwość na nasz najlepszy przykład specjacji sympatrycznej.

Tym przykładem było istnienie skupisk ryb pielęgnic w małych jeziorach wulkanicznych w Kamerunie. Ponieważ dowody genetyczne Schliewena i in. (1994) pokazywały, że każde skupisko było monofiletyczne, to jest, wydawało się pochodzić od jednego wspólnego gatunku przodków, którzy zajęli te jeziora wulkaniczne jakiś czas temu (między 1 a 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Bermin), dawało to dowód, że powstanie 11 gatunków w Barombi Mbo i 9 w Bermin odbyło się sympatrycznie – bez geograficznej izolacji populacji.


Tutaj są dwie radiacje, o które chodzi, pokazujące lokalizację jezior wulkanicznych.


Autorzy powtórzyli analizę genetyczną tych dwóch pokazanych powyżej radiacji (a także innych, z innych jezior) produkując ponad 350 milionów sekwencji DNA. (Taki poziom analizy umożliwia nam nowa technika.) Na podstawie tego powtórzyli analizę filogenetyczną. Oto, co znaleźli.

  • “Monofiletyzm” (pochodzenie od wspólnego przodka) radiacji pokazanych powyżej jest słabszy niż sądzono przedtem. Autorzy wnioskują, że ten monofiletyzm, który jest kluczowym dowodem na specjację sympatryczną, nie jest wystarczająco “mocno poparty”.
  • Ponadto wydaje się, że istniała znaczna introgresja (ruch genów) nie tylko między pewnymi gatunkami w każdej z tych dwóch radiacji, ale także między gatunkami w jeziorze i różnymi “grupami zewnętrznymi” w rzekach poza jeziorami. Sugeruje to, że było wiele inwazji jezior przez przodków ryb jezior wulkanicznych, a to przemawia przeciwko jednemu wspólnemu przodkowi tworzącemu w jeziorze wiele gatunków. 

Jak zespół Martina odkrył tę introgresję? Przez patrzenie na asymetrię podobieństwa genetycznego między gatunkami w radiacji, a także między tymi gatunkami, a innymi spoza jeziora. Jak wyjaśniają:


Informacja o ukierunkowaniu introgresji pochodzi z asymetrii stosunków między populacjami przy założeniu drzewa. Na przykład, jeśli wyobrazimy sobie drzewo ((A,B)(C,D)) z następująca potem introgresją B w C, populacja C będzie wykazywała niezwykle wysoką kowariancję z A, ale B nie będzie wykazywała kowariancji z D.


Innymi słowy, jeśli drzewo pokazuje dwie siostrzane pary gatunków (gatunek A blisko spokrewniony z B, a gatunek C blisko spokrewniony z D), i grupę (A + B) bardziej odlegle spokrewnioną z grupą (C + D), można odkryć przesunięcia genów między B i C, które mieszczą się w różnych grupach, jeśli niektóre geny w C można także znaleźć w A. Pokazuje to podobieństwo między gatunkami z różnych grup, którego nie widać u gatunków B i D, także mieszczącymi się w różnych grupach. Ten wzór może zdarzyć się tylko, jeśli było przejście genów między gatunkami w różnych grupach, albo przed, albo podczas specjacji.


Nie będę wnikał we wszystkie drastyczne szczegóły, a prawdę mówiąc, pewne szczegóły tej metodologii umykają mi, ale wyniki są jasne: gatunki w jeziorach nie są przekonująco monofiletyczne, a także ryby wymieniały geny nie tylko wzajem ze sobą, ale z pewnymi gatunkami spoza jeziora.


Jak mogło się to zdarzyć? Na kilka sposobów, które wszystkie łamią koncepcję, że specjacja (tworzenie izolowanych reprodukcyjnie grup w jeziorze po inwazji jednego przodka) zaszła przy swobodnym przepływie genów. Po pierwsze, mogły być wielokrotne inwazje krateru ze strony pojedynczej linii rodowej, która zmieniała się genetycznie między inwazjami. Mogło by to znaczyć, że między inwazjami ewoluowała pewna izolacja reprodukcyjna, co wspierałoby specjację wśród ryb w jeziorze.


Ta izolacja reprodukcyjna mogła nie być pełna i gatunki w stadiach początkowych mogły wymieniać geny, ale stopniowo stawać się pełnymi gatunkami z powodu procesu wzmocnienia. W tym procesie gatunki, które już wyewoluowały pewien stopień izolacji reprodukcyjnej – w postaci problemów hybryd, takich jak bezpłodność lub niezdolność do życia – podlegają następnie doborowi naturalnemu ku rosnącej izolacji seksualnej, ponieważ te osobniki w każdym początkującym gatunku, które kojarzyły się z własnym rodzajem, pozostawiały więcej genów niż te, które kojarzyły się z innym rodzajem. Może to z czasem doprowadzić do izolacji reprodukcyjnej, ale także do wprowadzających w błąd pozorów monofiletyczności między gatunkami, spowodowanej wymianą genów. Nie jest to specjacja sympatryczna, ponieważ niezbędny był okres izolacji geograficznej, by wyewoluować geny „izolacji reprodukcyjnej”.


Scenariusz alternatywny dotyczy wielokrotnej kolonizacji jeziora albo przez różne gatunki przodków, albo, jak powyżej, przez różne odłamy jednej linii rodowej przodków w różnym czasie. Ci wielokrotni kolonizatorzy mogą potem stworzyć rój hybrydowy z obfitym mieszaniem się genów, a potem ten rój może podzielić się na różne gatunki w jeziorze wulkanicznym. Raz jeszcze jednak niezbędna jest specjacja allopatryczna.


W obu wypadkach wymiana genów, która zdarzyła się, kiedy w jeziorze formowały się nowe gatunki, daje pozór, że wszystkie są potomkami jednego przodka, który dostał się do jeziora tylko raz, w rzeczywistości jednak podczas tej specjacji była faza allopatryczna (izolacja geograficzna).


Niezależnie od tego, co się zdarzyło, sygnał o wymianie genów jest wyraźny i w zasadzie wyklucza radiacje w tych dwóch jeziorach wulkanicznych jako wynik czysto sympatrycznej specjacji. (Spieszę dodać, że część rozejścia się genetycznego między gatunkami z pewnością wyewoluowała w kraterze, ale izolacja reprodukcyjna wymagała także fazy allopatrycznej przynajmniej podczas pewnej części procesu).


Autorzy zauważają także, że jeziora wulkaniczne mają pewne nisze ekologiczne i, jeśli ryby kojarzą się tam, gdzie żyją, ułatwiłoby to specjację na małym obszarze, który jednak daje izolację przestrzenną między podlegającymi specjacji gatunkami. Cechy zwierząt i roślin, które dają automatyczny związek między lokalizacją a czasem kojarzenia się, nazywane są „cechami magicznymi”, ponieważ mają podwójny efekt. Na przykład, jedna ciężarna samica ryby może trzymać się przy dnie jeziora wulkanicznego i jej potomstwo tam wyklute wykazuje tendencję do pozostawania tam, jak również kojarzenia się z innymi w pobliżu, co prowadzi do pewnego rodzaju izolacji geograficznej oparte na ograniczonym przepływie genów między rybami, które lubią przebywać w różnych częściach jeziora. Wymaga to tylko, by ryba miała tendencję do kojarzenia się i posiadania potomstwa na pewnych obszarach, a potomstwo kojarzyło się z tymi, którzy są w pobliżu. Z czasem dałoby to selekcję do adaptowania się do środowiska i wygląd izolacji reprodukcyjnej jako skutek uboczny. Na poparcie tego autorzy notują, że wiele gatunków w tych dwóch radiacjach pokazanych powyżej jest „wyspecjalizowana środowiskowo”, znajdowana najczęściej w jednej konkretnej części jeziora.


Tak więc istnienie “cech magicznych” może ułatwiać specjację, ale nie jest to specjacja sympatryczna w ścisłym sensie, która jest tworzeniem nowych gatunków bez żadnej separacji fizycznej. Na zakończenie autorzy piszą:


Dostępne dowody sugerują, że wszystkie radiacje pielęgnic z jezior wulkanicznych podlegały specjacji przy pomocy podwójnych inwazji (Schliewen et al. 2006; Geiger et al. 2013) lub pozostały na etapie początkujących kompleksów gatunków (Elmer et al. 2010b; Martin 2012, 2013). Według tego, co wiemy, wszystkie przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza radiacjami pielęgnic z jezior wulkanicznych obejmują jakąś formę automatycznego powiązania między rozejściem się ekologicznym a czasem lub lokalizacją kojarzenia, znaną jako “automatyczne cechy magiczne” (patrz przegląd w Servedio et al. 2011).


Jakie są owe przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza pielęgnicami z jezior wulkanicznych? Jednym z nich są dwa siostrzane gatunki drzew palmowych, które rozdzieliły się na wyspie Lord Howe. (Patrz mój opis tej sytuacji w News and Views “Speciation in a small space“; odnośnik poniżej). W tym przypadku kilka palm z kolonizujących gatunków znalazło się w suchej glebie, co automatycznie powoduje wcześniejsze kwitnienie niż roślin w wilgotniejszej glebie (w suchej glebie muszą mieć nasiona tak szybko, jak to możliwe, ponieważ wysychająca gleba może zredukować zdolność do reprodukowania się). Tak więc te palmy produkujące pyłek i zalążki równocześnie miały większe prawdopodobieństwo kojarzenia się wzajem ze sobą niż z palmami tego samego gatunku, które rosły na wilgotniejszej glebie, a które kwitły później. To mogło z czasem dać zróżnicowaną ewolucję adaptacyjną oraz izolację reprodukcyjną. Życie na suchej glebie jest jednym przykładem cechy magicznej, w której środowisko i reprodukcja są automatycznie powiązane.


Martin i in. podają trzy inne przykłady specjacji sympatrycznej, które uważają za przekonujące. Jednym jest przypadek dwóch grup mszyc (Acyrthosiphon pisum), które żyją na lucernie i pomidorach w USA i mówi się o nich, że ich specjacja była sympatryczna (pola pomidorów często leżą obok pól lucerny). Allen Orr i ja pokazaliśmy jednak w Speciation, że nie jest to dobry przykład specjacji sympatrycznej, ponieważ rozejście się nastąpiło prawdopodobnie w Europie, gdzie mszyce żyją na wielu roślinach, a potem była podwójna kolonizacja USA.


Dwa inne przypadki dotyczą golców i myszy kolczastych z Kanionu Ewolucji w Izraelu, kanionu, który ma ekologicznie odrębne strony. Nie czytałem jeszcze tych prac, więc nie mogę ich komentować. Jasne jest jednak po artykule zespołu Martina, że najbardziej przekonujący przykład specjacji sympatrycznej, jaki mieliśmy, nie jest już dłużej tak przekonujący.


Co pozostaje? Rośliny z Lord Howe są dobrym przykładem specjacji na bardzo małej wyspie, ale należy zbadać, czy “cechy magiczne” mogły tam działać. Poza tymi roślinami jest kilka innych przypadków (inne ryby i osy figowe), które wspomnieliśmy w Speciation, ale dowody nie były zbyt mocne. Wszystkie dane sugerują, że choć specjacja sympatryczna ze swobodnym przepływem genów jest teoretycznie możliwa, niewiele jest dowodów, że zachodzi w naturze. Z pewnością są jakieś przypadki (wszystko, co jest możliwe, zdarzyło się przynajmniej raz w ewolucji) i oczywiście zdobycie dobrych dowodów dla tych przypadków będzie trudne. Możemy jednak powiedzieć, że nie ma wystarczających danych do często powtarzanego twierdzenia, że specjacja sympatryczna jest powszechna.

___________

Coyne, J. A. Speciation in a small space. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 108:12975-12976.

Martin, C. H., et al. (2015). Complex histories of repeated gene flow in Cameroon crater lake cichlids cast doubt on one of the clearest examples of sympatric speciation. Evolution 69(6): 1406-1422.

Schliewen, U. K., et al. (1994). Sympatric speciation suggested by monophyly of crater lake cichlids. Nature 368: 629-632.


Cameroon lake cichlids probably did not speciate sympatrically part 2

Why Evolution Is True, 26 czerwca 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Jerry A. Coyne

Profesor na wydziale ekologii i ewolucji University of Chicago, jego książka "Why Evolution is True" (Polskie wydanie: "Ewolucja jest faktem", Prószyński i Ska, 2009r.) została przełożona na kilkanaście języków, a przez Richarda Dawkinsa jest oceniana jako najlepsza książka o ewolucji.  Jerry Coyne jest jednym z najlepszych na świecie specjalistów od specjacji, rozdzielania się gatunków.  Jest wielkim miłośnikiem kotów i osobistym przyjacielem redaktor naczelnej.

Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1479 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Akupunktura kwantowa   Novella   2019-04-23
Akupunktura na pogotowiu też nie działa   Novella   2017-07-04
Alaska — nurniczki i obopólny dobór płciowy   Lyon   2019-08-20
Ale czy mogą cierpieć?   Dawkins   2018-07-07
Ale jak to bezbarwnikowy?   Łopatniuk   2019-06-01
Ale najpierw kawa   Tonhasca Júnior   2024-03-21
Ale tego wija lepiej zostaw w spokoju   Łopatniuk   2018-08-24
Alfred Sturtevant: bohater genetyki   Coyne   2017-02-06
Alternatywna medycyna zabija   Novella   2017-12-26
Americana   Tonhasca Júnior   2023-05-24
Amerykańscy aktywiści na rzecz niedożywienia w Ugandzie   Ongu   2016-03-01
Amfisbeny   Naskręcki   2014-06-16
Amonit (i masa innych stworzeń) znaleziona w birmańskim bursztynie   Coyne   2019-06-21
Anglia pozwala na uprawy poddane edycji genów   Novella   2023-04-03
Animula blandula, blastula vagularzecz o zarodkach wędrujących gdzie nie trzeba   Łopatniuk   2015-12-19
Antynauka czystego jedzenia   Novella   2017-11-08
Antynaukowe przesłanie „Frankensteina” zawsze było głupie   Ridley   2017-06-12
Antyszczepionkowcy - pielęgniarka lub lekarz nie powinni opiekować się dziećmi     2018-09-10
Apoptoza całego ciała   Dennett   2018-11-09
Aquilops, mały dinozaur, który wiele mógł   Farke   2015-01-15
Architektura żywych budowli   Yong   2014-06-20
Argument neuroróżnorodności na rzecz wolności słowa   Miller   2017-08-08
Artykuł w “Nature” sugeruje, że ludzie żyli w Ameryce Północnej 130 tysięcy lat temu   Mayer   2017-04-29
Artykuł w naukowym piśmie ”Nature” dyskredytuje naukę i „scjentyzm”, kwestionuje wartości Oświecenia   Coyne   2019-10-22
Artykuł w piśmie „Science”: rozszerzyć DEI w STEMM   Coyne   2024-04-19
Astrocyty tworzą nowe neurony po udarze   Łopatniuk   2015-03-04
Atak “doktorostwa Wolfson” na rodziców chłopca, który zmarł na koklusz     2018-09-20
Ateista z chwilową luką w pamięci i w szoku niewolnictwa   Dawkins   2018-09-21
Australijskie koty łożyskowe   Mayer   2015-12-17
Badacz: Ludzki zmysł węchu jest lepszy niż wszyscy myślą; może rywalizować z psim!   Coyne   2017-05-27
Badaczka z Leakey Foundation twierdzi, że kości orangutanów mówią nam, że biologiczna płeć jest spektrum, a nie binarna   Coyne   2023-06-30
Badania dowodzą, że fakty nie mają znaczenia: jak propaganda wykorzystuje i normalizuje antysemityzm     2022-08-03
Badania z poślizgiem   Łopatniuk   2016-12-31
Badanie akupunktury jako terapii na dławicę piersiową   Novella   2019-08-23
Badanie niewiernych norników wiąże geny z mózgiem i z zachowaniem   Yong   2015-12-29
Badanie zaszczepionych i nieszczepionych   Novella   2017-05-20
Bajka o kaczkach karolinkach   Coyne   2016-12-16
Bakterie, które zamieniają ameby w farmerów   Yong   2015-09-01
Bakteryjne ogniwa słoneczne   Novella   2017-09-09
Bakłażan Bt – fałszywa narracja przeciwko GMO   Novella   2016-12-05
Bakłażan GMO jest udokumentowaną wygraną ubogich farmerów   Conrow   2021-09-23
Bambusowi matematycy   Zimmer   2015-05-25
Banany edytowane przez CRISPR   Novella   2021-03-02
Barwny erudyta J.B.S. Haldane   Coyne   2020-08-28
BBC szerzy propagandę rolnictwa organicznego, a biedni na świecie cierpią   i Kathleen Hefferon   2023-10-13
BBC znowu błędnie przedstawia ewolucję, opisując nowe odkrycie wczesnych ssaków wyższych   Coyne   2017-11-14
Bekon bez azotynów   Novella   2018-01-25
Bez płuc i dobrze mu z tym   Naskręcki   2016-02-12
Bez serc, bez głowy   Łopatniuk   2016-07-30
Bezwstydne organiczne sianie strachu   Novella   2018-02-12
Bezzbożowa karma dla psa   Novella   2019-08-29
Biały jak śnieg, żółciutki jak kaczuszka   Łopatniuk   2019-09-04
Biodynamiczne rolnictwo i inne nonsensy   Novella   2017-06-28
Biolog ewolucyjny błądzi pisząc o doborze płciowym na łamach “New York Times”   Coyne   2017-05-17
Biologia męskiej agresji i dlaczego nie jest to tylko „socjalizacja”   Coyne   2019-12-24
Biologia rezygnacji z działania: kiedy kontynuować, a kiedy spasować   Coyne   2023-04-26
Biologia rozwoju ujawnia ewolucyjną historię   Novella   2019-10-15
Biomedyczne znaczenie płci (i jej binarnej natury)   Coyne   2022-09-22
Biotechnologia jest pilnie potrzebna w Afryce – dla gospodarki i środowiska   Ridley   2017-12-08
Biotechnologia może usunąć brudne stopy z ulubionego piwa Ugandy   Ongu   2016-06-14
Biotechnologia podnosi plony wysokobiałkowego afrykańskiego pochrzynu   Wetaya   2022-02-04
Bliskie spotkania z baronem MünchausenemPaulina Łopatniuk     2017-07-22
Bodźce do innowacji w końcu pokonają COVID-19   Ridley   2020-06-27
Brazylia liczy na technologię izraelską, by rozwiązać śmierdzący problem   Leichman   2017-05-04
Brian Charlesworth o błędach nowego artykułu rzekomo pokazującego, że fundamentalne założenie ewolucji neodarwinowskiej jest błędne   Coyne   2022-05-16
Brudna pardwa górska   Lyon   2018-12-24
Budzenie zmarłych   Novella   2018-05-21
Bądźcie sceptyczni wobec wideo pokazujących “skutki uboczne” szczepionki   Novella   2021-01-28
Bąkojady czyszczą nosorożce   Coyne   2023-01-18
Błędna historia antykolonializmu   Tupy   2021-04-21
Błędna krytyka genetycznych testów na pochodzenie   Coyne   2023-06-02
Błędne wyobrażenia o ewolucji   Coyne   2023-06-16
Błogosławieni ci, którzy wycofują   Jacoby   2019-10-19
Błysk światła w mroku   Sheagren   2020-06-12
Błąd atrybucji, sofizmat rozszerzenia (atakowanie chochoła) i zasada wielkoduszności   Novella   2018-03-14
Carl Sagan i wolność wątpienia   Jacoby   2022-07-18
Carl Zimmer o gatunkach i ochronie     2024-02-29
Centrala muszek owocowych: Bloomington Drosophila Stock Center   Coyne   2020-12-29
ChatGPT niemal zdaje lekarski egzamin końcowy   Novella   2023-02-21
Chcąc zadowolić antyaborcjonistów administracja Trumpa tnie finansowanie badań medycznych przy użyciu tkanki płodowej   Coyne   2019-06-11
Chemicznie zakamuflowana żaba     2015-12-12
Chiński dinozaur miał skrzydła jak nietoperz i pióra   Yong   2015-05-14
Choroba bananów, GMO i ewolucja produkcji żywności   Ongu   2017-08-19
Choroba zielonych mięśni   Łopatniuk   2019-09-14
Chromosom jak szczotka, czyli co robi Ki-67   Łopatniuk   2016-07-09
Chromosomy Y ludzi, neandertalczyków i denisowian   Novella   2020-10-08
Chwytówka modliszkowata ma chodzącą poczwarkę, która wspina się na drzewa przed przekształceniem   Coyne   2017-12-19
Ciemna materia genetyki psychiatrycznej   Zimmer   2014-01-06
Ciepło zabija. Zimno zabija wielu więcej   Jacoby   2023-01-09
Ciepło, zimno i śmierć w oczach mediów   Lomborg   2017-07-21
Cierpienie i pytanie, czy przestaniemy jeść mięso   Koraszewski   2021-07-14
Ciężarna wężyca przygotowuje się do macierzyństwa   Yong   2014-11-20
Ciąg dalszy sporu o dobór grupowy   Coyne   2015-04-22
Co byłoby, gdyby Wilkins i Franklin umieli ze sobą współpracować?   Cobb   2016-09-03
Co czyni nas ludźmi?   Dawkins   2014-01-07
Co kręci płaskoziemców   Novella   2019-03-02
Co mówi nam ruch płaskiej Ziemi     2018-05-17
Co mamy zrobić z neuroróżnorodnością?   Coyne   2015-07-02
Co nam daje psychologia ewolucyjna?   Flock   2018-11-01
Co nauka może powiedzieć pani Ocasio-Cortez o klimacie   Lomborg   2019-02-15

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk