Prawda

Niedziela, 19 maja 2024 - 01:08

« Poprzedni Następny »


Specjacja sympatryczna we wnętrzu cykady


Ed Yong 2014-10-10


Łatwo sobie wyobrazić sytuację, że bariera fizyczna, taka jak rzeka lub góry, może powodować tworzenie się nowych gatunków. W sytuacji gdy po dwóch stronach przegrody zostaną odizolowane, dwie populacje tego samego gatunku nie będą mogły się wspólnie rozmnażać. Zaczną ewoluować według swoich odrębnych ścieżek, dopóki różnice nie staną się tak wyraźne, że uniemożliwią rozmnażanie osobnikom z tych gatunków nawet, gdy się spotkają. W ten sposób z jednego gatunku powstaną dwa.

Jest także wiele przykładów, gdy nowe gatunki powstały bez żadnej bariery - gdy jedna populacja podzieliła się na dwie nawet w sytuacji, gdy jej członkowie zajmowali tę samą przestrzeń. Nazywamy takie zjawisko specjacją sympatryczną (z greckiego „z tej samej ojczyzny”). Nazwa powstała ponad wiek temu lecz była kontrowersyjna przez prawie cały czas. Naukowcy wykrywali jednak coraz więcej przykładów potwierdzających słuszność tej koncepcji, gdy nowe osy, muchy, ryby i drzewa ewoluowały inaczej żyjąc obok siebie. W zeszłym tygodniu, pojawiła się wiadomość, o nowym gatunku mrówki tzw. deadbeat ant , który oddzielił się od macierzystego gatunku, żyjąc cały czas w tej samej kolonii.


Poprzedni, intrygujący przykład, opisali James Van Leuven i John McCutcheon z Universytetu Montana. Dotyczy bakterii zwanej Hodgkinia, która podzieliła się na dwa oddzielne gatunki, żyjąc w komórkach owada. Nie występowała tam żadna bariera. Sardynki w puszce nie są tak stłoczone jak bakterie Hodgkinia. Bakterie były upakowane w takie same dokładnie mikroskopowe struktury, lecz w jakiś sposób udało im się rozdzielić na dwa różne gatunki.


Dwa potomne gatunki stanowią, jak gdyby, dwie połowy swojego przodka. Każdy z nich utracił geny oryginalnej bakterii Hodgkinia, lecz utraciły inne geny. Każdy gatunek kompensuje utratę, jaka nastąpiła u siostrzanego gatunku. Są one dokładnie komplementarne - po połączeniu można uzyskać (prawie) kompletny genom ich przodka.


Van Leuven i McCutcheon dokonali swojego odkrycia badając cykady - owady znane z ogłuszających dźwięków. Około pięć lat temu wykazali, że w jednym gatunku cykady wewnątrz komórek żyją dwa rodzaje bakterii - Sulcia i Hodgkinia. Jest to normalne, wiele owadów ma pomocników w postaci wewnętrznych bakterii lub „endosymbiontów”. U owadów ssących sok roślin jak cykady, takie mikroby działają jak suplementy diety, tworząc substancje odżywcze, których te owady nie mają w swojej diecie.


Sprawy zaczęły wyglądać dziwnie, gdy Van Leuven iMcCutcheon przeanalizowali DNA cykady południowo-amerykańskiej zwanej Tettigades undata. Zbadali wiele fragmentów DNA bakterii Hodgkinia, lecz, po próbach, nie mogli połączyć ich w pojedynczy genom. Zawsze tworzyły dwa oddzielne genomy. Dla ułatwienia, będę je nazywał H1 i H2.


Wspomniane dwa genomy należą do rożnych bakterii; nigdy nie odkryto ich w tej samej komórce. Zespół badaczy potwierdził, to za pomocą cząsteczek fluorescencyjnych przeznaczonych do znakowania każdego genomu - żółtych dla H1 oraz niebieskich dla H2. Wyniki można zobaczyć na fotografii poniżej. Każda mała kropka odpowiada oddzielnej bakterii a każda z nich zawiera genom H1 lub H2 lecz nigdy nie ma ich obu. (Zielone kropki oznaczają Sulcia, a fioletowe należą do cykady)


Dwa gatunki Hodgkinii (niebieskie i żółte kropki) w komórkach cykady. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.
Dwa gatunki Hodgkinii (niebieskie i żółte kropki) w komórkach cykady. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.

Opisane bakterie pochodzą od wspólnego przodka, którego nazwałem H0, pochodzącego sprzed około 5 milionów lat. Badacze zdobyli dobre wyobrażenie, jak wyglądał ten przodek, dzięki dokładnemu zbadaniu pokrewnych gatunków cykad, które mają jeden genom Hodgkinii zawierający 137 geny. 20 z nich występuje w H1 lecz nie ma ich w H2, natomiast 44 są w H2 lecz nie ma ich w H1. Wszystkie (oprócz jednego) znaleziono w jednym lub u obu gatunków potomnych.


Taki wzór bardzo przypomina sytuację, gdy gatunek duplikuje swój cały genom, tak jak zdarzało się wiele razy w procesie ewolucji kwiatów, ryb i innych organizmów. Nagle gatunek ma dwie kopie każdego genu. Ponieważ jest mu potrzebna tylko jedna kopia, w drugiej pojawiają się mutacje prowadzące do nieaktywności i niszczą ją, co się często zdarza. W wyniku tego powstaje genom z prawie taką samą liczbą genów, lecz umieszczoną na podwójnej ilości materiału.


I to właśnie zobaczyli Van Leuven i McCutcheon u swoich cykad, oryginalną bakterię Hodgkinia zdublowaną do dwóch niezależnych genomów, z których jedna tworzy kopię zapasową oryginalnego genomu. Lecz w przypadkach duplikacji całego genomu, zdublowane DNA nadal jest częścią tego samego genomu. Nie w tym przypadku; w tym przypadku H1 i H2 są całkiem oddzielnymi bytami. Proces, w wyniku którego powstały, jest podobny do rozdzielania monet wzdłuż ich brzegu, tak żeby uzyskać monety tylko z reszką oraz tylko z orłem. Przy takim postępowaniu nie powstaje nowy obraz. H1 i H2 nie mają funkcji innych od tych, które posiada H0.


Jest to całkowicie jasne, gdy przyjrzymy się genom. H0 umożliwia przyswajanie przez gospodarza, czyli cykadę składników odżywczych takich jak witamina B12 i metionina. W to zadanie jest zaangażowanych wiele genów, po jednym dla każdego kroku w łańcuchu reakcji chemicznych ostatecznie produkujących podane substancje. Jeżeli chodzi o H1 i H2 jest tak samo, lecz żaden z tych genomów nie ma kompletnego zestawu genów dla pełnego łańcucha. Żaden z nich sam nie może zapewnić cykadom wymaganych czynników odżywczych. Muszą działać razem, przesuwając substancje chemiczne wzdłuż, jak gdyby, linii produkcyjnej przechodzącej pomiędzy dwoma sąsiednimi fabrykami.


Jak taki skomplikowany układ wyewoluował? Jak z populacji H0 powstały żyjące obok siebie komórki H1 i H2?


Bardzo trudne jest uzyskanie pewności, lecz McCutcheon wpadł na koncepcję, którą przedstawiono na rysunku poniżej. Każda bakteria Hodgkinia zawiera tysiące kopii swojego genomu (zielone kółka) w tej samej komórce (czarny obwód). W pewnym punkcie, u jednej bakterii następuje mutacja w jednym z jej genomów, która powoduje uszkodzenie jednego genu (zaznaczonego na żółto). U drugiej bakterii następuje mutacja, znowu w jednym z jej genomów, która powoduje uszkodzenie innego genu (zaznaczonego na niebiesko).


Jak z jednego gatunku bakterii Hodgkinia powstają dwa?. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.
Jak z jednego gatunku bakterii Hodgkinia powstają dwa?. Zdjęcie: Van Leuven et al, 2014.

Przy takiej dużej ilości genomów znajdującej się w każdej z komórek powstałe mutacje nie mają znaczenia. Są niewidoczne dla naturalnej selekcji i swobodnie się rozprzestrzeniają. Przy podziale bakterii, przyszłe pokolenia potomne mogą mieć dwa genomy z mutacją, następnie cztery, potem osiem (C).


W końcu występuje pewnego rodzaju wąskie gardło (D) - pewne zdarzenie powodujące powstanie linii komórek, w których wszystkie genomy zawierają żółtą mutację lub niebieską. Żadna z tych dwóch linii nie jest przydatna cykadom pojedynczo, ponieważ żadna z nich nie może zapewnić pełnego zestawu koniecznych czynników odżywczych dla tych owadów. Muszą działać razem, tak więc obie muszą występować w pobliżu. Każda z nich zaczyna tracić coraz więcej genów, lecz zawsze w sposób komplementarny. W końcu przekształcają się w H1 i H2.


Prawdopodobnie pomocne jest, że cykady żyją do 17 lat – to  długo jak na owady, lecz cała  nieskończoność dla bakterii. Przez większość tego czasu cykady mieszkają pod ziemią jako niedojrzałe nimfy (larwy), które ledwie rosną. W ciągu tych lat, symbionty nie mają większego znaczenia. Mogą one zmieniać się, ewoluować, a nawet tworzyć szkodliwe mutacje, nie wpływając na życie swoich gospodarzy. Te same wybryki symbiontów byłyby większym problemem u krótko-żyjących owadów takich jak mszyce, wtedy zarówno gospodarze, jak i mikroby z uszkodzonym genomem byłyby szybko wyeliminowane przez dobór naturalny. Nie jest to prawdopodobnie przypadkiem, że - jak pisze McCutcheon: „U najdłużej żyjących cykad genomy bakterii Hodgkinia skoczyły na głębokie wody”:


„Uważamy, że jest to bardzo wyraźny przypadek nieadaptacyjnej ewolucji”. Hodgkinia niczego nie zyskuje dzięki rozszczepieniu na dwa gatunki tak samo jak cykada. Jest to wynik losowych zdarzeń. Można to potraktować jako bardzo ważne przypomnienie faktu, że ewolucja nie jest dążeniem w kierunku lepszych i bardziej skutecznych form. Czasami, prowadzi do większej złożoności dzięki swojemu działaniu. Jak mówi McCutcheon „nowa symbioza nie jest w żaden sposób lepsza od prostszej wersji. Jest tylko bardziej skomplikowana i się zaklinowała”


Odniesienie:
Van Leuven, Meister, Simon & McCutcheon. 2014. Sympatric Speciation in a Bacterial Endosymbiont Results in Two Genomes with the Functionality of One. Cell. http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2014.07.047

Inne przykład dziwnych symbiontów owadów:  Snug as a Bug in a Bug in a Bug

 

One species becomes two inside an insect

Tłumaczenie: Elżbieta Pląskowska



Ed Yong 


Mieszka w Londynie i pracuje w Cancer Research UK. Jego blog „Not Exactly Rocket Science” jest próbą zainteresowania nauką szerszej rzeszy czytelników poprzez unikanie żargonu i przystępną prezentację.
Strona www autora


Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1479 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Rośliny zmodyfikowane: odkłamać opinię o GMO   Conrow   2022-04-07
Odmowa szczelinowania jest szaleństwem   Ridley   2022-04-02
Jak wirusy chorób układu oddechowego ewoluują, by stać się łagodniejsze   Ridley   2022-03-22
Czy globalne ocieplenie może być dla nas dobre?   Ridley   2022-03-03
Południowa Afryka powinna przemyśleć regulacje dotyczące genetycznie modyfikowanych roślin   i Priyen Pillay   2022-03-01
Dlaczego środowiskowcy stanowią większą przeszkodę dla skutecznej polityki klimatycznej niż negacjoniści?   Boudry   2022-02-21
O figach i osach   Júnior   2022-02-18
Pień liczący 40 tysięcy lat przekazany Maorysom zamiast nauce   Coyne   2022-02-14
Propaganda anty-GMO obraża drobnych farmerów w Afryce i w Azji   Gakpo   2022-02-08
Jak “tubylcza medycyna” różni się od medycyny   Coyne   2022-02-07
Biotechnologia podnosi plony wysokobiałkowego afrykańskiego pochrzynu   Wetaya   2022-02-04
Spadanie w przepaść   Turski   2022-01-27
Czy koniki morskie coś nam mówią o LGBT? Błąd naturalistyczny popełniony przez Sussex Wildlife Trust   Coyne   2022-01-25
Ojczyznę wolną (od GMO) zachowują pany   Koraszewski   2022-01-22
Namawianie roślin, żeby podjęły ryzyko   Karavolias   2022-01-20
Czy uczenie się metodą prób i błędów jest „nauką”?   Coyne   2022-01-14
Czy gaz i energia jądrowa są “zielone”   Novella   2022-01-12
Ptasia grypa w czasach ludzkiej zarazy   Collins   2022-01-11
Rasa jest kontinuum. Płeć jest cholernie binarna   Dawkins   2022-01-10
Komiczne krzyki o klimatycznej Apokalipsie –— 50 lat nieuzasadnionego siania paniki   Lomborg   2022-01-06
Gnidy, o których PIS ci nie powie   Koraszewski   2022-01-05
Niebezpieczeństwo upolitycznienia nauki   Krylov   2022-01-01
Specjalne przesłanie do muzułmanów na całym świecie   Pandavar   2021-12-28
Nowe badania pokazują, że kraje rozwijające się płacą wysoką cenę za ograniczanie upraw roślin GMO   Maina   2021-12-25
Jajo, które wywołało sensację   Koraszewski   2021-12-24
Pięć powodów zakończenia debaty o GMO   Evanea   2021-12-16
Richard Dawkins pisze do “przyjaciół nauki i rozumu” w Nowej Zelandii   Coyne   2021-12-14
 Syntetyczna biologia oferuje obietnicę rozwiązania globalnego problemu z plastikiem   Agaba   2021-12-13
Nigeria wzywa Afrykę, by szła w jej ślady w sprawie GM wspięgi wężowatej   Opoku Gakpo   2021-12-09
Małe nietoperze idą do przedszkola   Koraszewski   2021-12-06
Afrykańscy naukowcy wzywają do polityki poparcia biologii syntetycznej i innych innowacji   Agaba   2021-12-02
Uprawy GMO zredukowały zatrucia farmerów pestycydami   Maina   2021-11-27
Czy genetyka może pomóc wyeliminować nierówność?   Coyne   2021-11-26
Matematyka i prawdziwa historia katastrofy klimatycznej   Lomborg   2021-11-24
Nigeria daje zielone światło kukurydzy GMO   Conrow   2021-11-22
Ugandyjscy studenci nalegają na powszechne stosowanie biotechnologii i uchwalenie prawa o biobezpieczeństwie   Agaba   2021-11-17
Organiczny eksperyment Sri Lanki   Novella   2021-11-16
Ruanda skwapliwie przyjmuje biotechnologię poprzez ekspansję OFAB   Meeme   2021-11-12
Sprzeciw wobec anulowania Huxleya   Coyne   2021-11-05
Farmerka z Kenii zbiera obfity plon z bawełny GM   Meeme   2021-11-04
Czarni uczeni i nauka o rasizmie   Koraszewski   2021-11-03
Kłusownictwo narzuca na słonie dobór w kierunku ewolucji słoni bez ciosów   Coyne   2021-11-01
Marnujemy naszą wielką szansę na edytowanie genów   Ridely   2021-10-29
“Czarne tygrysy” w małym indyjskim rezerwacie sugerują losowy dryf genetyczny   Coyne   2021-10-26
Wytwarzanie białek w roślinach przez rolnictwo molekularne   Novella   2021-10-20
Strzelby, zarazki, maszyny to zdecydowanie antyrasistowska książka. Dlaczego lewica jej nie kocha?   Barnett   2021-10-13
Nigeryjscy farmerzy nie mogą się doczekać wystarczających ilości GM nasion wspięgi wężowatej   Gakpo   2021-10-12
Dobór płciowy versus dobór naturalny: na przykładzie chrząszczy   Coyne   2021-10-08
Edytowanie genów kluczem do ulepszenia podstawowych upraw w Afryce   Abugu   2021-10-01
Bakłażan GMO jest udokumentowaną wygraną ubogich farmerów   Conrow   2021-09-23
O Jezu, wskrzeszają mamuta!   Koraszewski   2021-09-17
Wszystkie antyizraelskie wiadomości zasługują na publikację   Bard   2021-09-04
Tożsamość etniczna i rasa   Coyne   2021-08-30
Środowiskowcy mylili się – nie stoimy przed apokalipsą owadów   Ridley   2021-08-13
Czy znaleziono najstarszy dowód na istnienie zwierzęcia? Nowa gąbko-podobna skamieniałość liczy 890 milionów lat   Coyne   2021-08-11
Psy rozumieją ludzi   Novella   2021-08-06
Nowy start nauki o życiu w epoce genu   Ridley   2021-08-05
Użycie ognia przez homininy: przykład szybkiej ewolucji kulturowej?   Coyne   2021-08-04
Historia pandemii jest historią zaprzeczania   Jackoby   2021-07-27
Nieuchwytny neuron babci   Novella   2021-07-22
Cierpienie i pytanie, czy przestaniemy jeść mięso   Koraszewski   2021-07-14
Czy nadchodzi hydroponika?   Novella   2021-07-13
Raport Unii Europejskiej o glifosacie   Novella   2021-07-10
Dlaczego ideologii nie należy mieszać z nauką   Coyne   2021-06-30
Nagonka na Izrael grasuje w stowarzyszeniach nauk ścisłych, medycyny i edukacji   Chesler   2021-06-24
Szczęśliwi pracoholicy   Witkowski   2021-06-03
Propaganda w wykonaniu nauczycieli akademickich   Chesler   2021-06-02
Ewolucja wielokomórkowości   Novella   2021-05-07
Polityczna polaryzacja jest przesadzona   Novella   2021-05-04
Wrotki były kiedyś sztandarową grupą istot bez seksu, a teraz sądzi się, że ukradkiem odstawiają szybkie numerki   Coyne   2021-04-22
Błędna historia antykolonializmu   Tupy   2021-04-21
Mayflower wyrusza w podróż raz jeszcze   Koraszewski   2021-04-19
Genetyczny przełącznik CRISPR   Novella   2021-04-16
Wielkie zdarzenie oksydacyjne   Novela   2021-04-09
Kiedy panika klimatyczna zlewa się z kulturą anulowania   Lomborg   2021-04-06
Czy wykształceni ludzie są bardziej antysemiccy?   Albert Cheng i Ian Kingsbury   2021-04-05
Nieoczekiwana historia i cudowny sukces szczepionek   Ridley   2021-03-31
Innowacja jest geograficznie zlokalizowanym i chwilowym zjawiskiem   Ridley   2021-03-29
Czy gąbki są najbliższymi krewnymi pozostałych zwierząt?   Coyne   2021-03-26
Kilka lekcji z rosyjskiej rewolucji. Jak kuszący radykalny nihilizm prowadzi do ekstremizmu   Geifman   2021-03-22
Wracamy do raju?   Łukaszewski   2021-03-18
Ślimakowi morskiemu odrasta tułów z odciętej głowy, czyli “autotomia z kleptoplastią”   Coyne   2021-03-15
Ewolucyjne korzyści udawania ofiary   Clark   2021-03-11
Ludzie i wymieranie megafauny   Novella   2021-03-10
Banany edytowane przez CRISPR   Novella   2021-03-02
Nikczemne grzyby naśladują kwiaty trawy, by ułatwić własne rozmnażanie się   Coyne   2021-02-26
Co zabiło megafaunę Ameryki Północnej?   Novella   2021-02-25
Stresy i nowe szczepy wirusa   Ridley   2021-02-12
EWOLUCJA wirusa Covid-19   Coyne   2021-02-10
Czy „toksyczna kobiecość” jest główną przyczyną bojów o społeczną sprawiedliwość?   Coyne   2021-02-08
Najmniejszy gad (i owodniowiec) świata: BARDZO mały kameleon   Coyne   2021-02-05
Dlaczego kocimiętka i matatabi doprowadzają koty do szaleństwa? Grupa badaczy mówi, że te rośliny mogą chronić je przed komarami   Coyne   2021-02-02
Bądźcie sceptyczni wobec wideo pokazujących “skutki uboczne” szczepionki   Novella   2021-01-28
Szaleństwo odnawialnej energii   Ridley   2021-01-23
Głębia ludzkiej historii   Novella   2021-01-19
Dlaczego szczepionki mRNA mogą zrewolucjonizować medycynę?   Ridley   2021-01-02
Szczepionka mRNA na koronawirusa: świadectwo ludzkiej pomysłowości i mocy nauki   Coyne   2021-01-01
Dziwaczny rodzaj rasistowskiego patriarchatu   Arora   2020-12-31
Centrala muszek owocowych: Bloomington Drosophila Stock Center   Coyne   2020-12-29
Pierwszy raport o używaniu narzędzi przez pszczoły: rodzimy gatunek używa grudek łajna, by odeprzeć drapieżne szerszenie   Coyne   2020-12-23

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk