Prawda

Środa, 24 kwietnia 2024 - 21:09

« Poprzedni Następny »


Pielęgnice z jeziora w Kamerunie prawdopodobnie nie podlegały specjacji sympatrycznej: Część  2


Jerry A. Coyne 2015-07-10

Wczoraj opisałem tłoniezbędne do zrozumienia nowej pracy w “Evolution” Christophera H. Martina i in. (odnośnik i link poniżej). Dzisiaj pokrótce opiszę ich odkrycia, które rzucają wątpliwość na nasz najlepszy przykład specjacji sympatrycznej.

Tym przykładem było istnienie skupisk ryb pielęgnic w małych jeziorach wulkanicznych w Kamerunie. Ponieważ dowody genetyczne Schliewena i in. (1994) pokazywały, że każde skupisko było monofiletyczne, to jest, wydawało się pochodzić od jednego wspólnego gatunku przodków, którzy zajęli te jeziora wulkaniczne jakiś czas temu (między 1 a 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Barombi Mbo i 100 tysięcy do 2,5 miliona lat temu dla jeziora Bermin), dawało to dowód, że powstanie 11 gatunków w Barombi Mbo i 9 w Bermin odbyło się sympatrycznie – bez geograficznej izolacji populacji.


Tutaj są dwie radiacje, o które chodzi, pokazujące lokalizację jezior wulkanicznych.


Autorzy powtórzyli analizę genetyczną tych dwóch pokazanych powyżej radiacji (a także innych, z innych jezior) produkując ponad 350 milionów sekwencji DNA. (Taki poziom analizy umożliwia nam nowa technika.) Na podstawie tego powtórzyli analizę filogenetyczną. Oto, co znaleźli.

  • “Monofiletyzm” (pochodzenie od wspólnego przodka) radiacji pokazanych powyżej jest słabszy niż sądzono przedtem. Autorzy wnioskują, że ten monofiletyzm, który jest kluczowym dowodem na specjację sympatryczną, nie jest wystarczająco “mocno poparty”.
  • Ponadto wydaje się, że istniała znaczna introgresja (ruch genów) nie tylko między pewnymi gatunkami w każdej z tych dwóch radiacji, ale także między gatunkami w jeziorze i różnymi “grupami zewnętrznymi” w rzekach poza jeziorami. Sugeruje to, że było wiele inwazji jezior przez przodków ryb jezior wulkanicznych, a to przemawia przeciwko jednemu wspólnemu przodkowi tworzącemu w jeziorze wiele gatunków. 

Jak zespół Martina odkrył tę introgresję? Przez patrzenie na asymetrię podobieństwa genetycznego między gatunkami w radiacji, a także między tymi gatunkami, a innymi spoza jeziora. Jak wyjaśniają:


Informacja o ukierunkowaniu introgresji pochodzi z asymetrii stosunków między populacjami przy założeniu drzewa. Na przykład, jeśli wyobrazimy sobie drzewo ((A,B)(C,D)) z następująca potem introgresją B w C, populacja C będzie wykazywała niezwykle wysoką kowariancję z A, ale B nie będzie wykazywała kowariancji z D.


Innymi słowy, jeśli drzewo pokazuje dwie siostrzane pary gatunków (gatunek A blisko spokrewniony z B, a gatunek C blisko spokrewniony z D), i grupę (A + B) bardziej odlegle spokrewnioną z grupą (C + D), można odkryć przesunięcia genów między B i C, które mieszczą się w różnych grupach, jeśli niektóre geny w C można także znaleźć w A. Pokazuje to podobieństwo między gatunkami z różnych grup, którego nie widać u gatunków B i D, także mieszczącymi się w różnych grupach. Ten wzór może zdarzyć się tylko, jeśli było przejście genów między gatunkami w różnych grupach, albo przed, albo podczas specjacji.


Nie będę wnikał we wszystkie drastyczne szczegóły, a prawdę mówiąc, pewne szczegóły tej metodologii umykają mi, ale wyniki są jasne: gatunki w jeziorach nie są przekonująco monofiletyczne, a także ryby wymieniały geny nie tylko wzajem ze sobą, ale z pewnymi gatunkami spoza jeziora.


Jak mogło się to zdarzyć? Na kilka sposobów, które wszystkie łamią koncepcję, że specjacja (tworzenie izolowanych reprodukcyjnie grup w jeziorze po inwazji jednego przodka) zaszła przy swobodnym przepływie genów. Po pierwsze, mogły być wielokrotne inwazje krateru ze strony pojedynczej linii rodowej, która zmieniała się genetycznie między inwazjami. Mogło by to znaczyć, że między inwazjami ewoluowała pewna izolacja reprodukcyjna, co wspierałoby specjację wśród ryb w jeziorze.


Ta izolacja reprodukcyjna mogła nie być pełna i gatunki w stadiach początkowych mogły wymieniać geny, ale stopniowo stawać się pełnymi gatunkami z powodu procesu wzmocnienia. W tym procesie gatunki, które już wyewoluowały pewien stopień izolacji reprodukcyjnej – w postaci problemów hybryd, takich jak bezpłodność lub niezdolność do życia – podlegają następnie doborowi naturalnemu ku rosnącej izolacji seksualnej, ponieważ te osobniki w każdym początkującym gatunku, które kojarzyły się z własnym rodzajem, pozostawiały więcej genów niż te, które kojarzyły się z innym rodzajem. Może to z czasem doprowadzić do izolacji reprodukcyjnej, ale także do wprowadzających w błąd pozorów monofiletyczności między gatunkami, spowodowanej wymianą genów. Nie jest to specjacja sympatryczna, ponieważ niezbędny był okres izolacji geograficznej, by wyewoluować geny „izolacji reprodukcyjnej”.


Scenariusz alternatywny dotyczy wielokrotnej kolonizacji jeziora albo przez różne gatunki przodków, albo, jak powyżej, przez różne odłamy jednej linii rodowej przodków w różnym czasie. Ci wielokrotni kolonizatorzy mogą potem stworzyć rój hybrydowy z obfitym mieszaniem się genów, a potem ten rój może podzielić się na różne gatunki w jeziorze wulkanicznym. Raz jeszcze jednak niezbędna jest specjacja allopatryczna.


W obu wypadkach wymiana genów, która zdarzyła się, kiedy w jeziorze formowały się nowe gatunki, daje pozór, że wszystkie są potomkami jednego przodka, który dostał się do jeziora tylko raz, w rzeczywistości jednak podczas tej specjacji była faza allopatryczna (izolacja geograficzna).


Niezależnie od tego, co się zdarzyło, sygnał o wymianie genów jest wyraźny i w zasadzie wyklucza radiacje w tych dwóch jeziorach wulkanicznych jako wynik czysto sympatrycznej specjacji. (Spieszę dodać, że część rozejścia się genetycznego między gatunkami z pewnością wyewoluowała w kraterze, ale izolacja reprodukcyjna wymagała także fazy allopatrycznej przynajmniej podczas pewnej części procesu).


Autorzy zauważają także, że jeziora wulkaniczne mają pewne nisze ekologiczne i, jeśli ryby kojarzą się tam, gdzie żyją, ułatwiłoby to specjację na małym obszarze, który jednak daje izolację przestrzenną między podlegającymi specjacji gatunkami. Cechy zwierząt i roślin, które dają automatyczny związek między lokalizacją a czasem kojarzenia się, nazywane są „cechami magicznymi”, ponieważ mają podwójny efekt. Na przykład, jedna ciężarna samica ryby może trzymać się przy dnie jeziora wulkanicznego i jej potomstwo tam wyklute wykazuje tendencję do pozostawania tam, jak również kojarzenia się z innymi w pobliżu, co prowadzi do pewnego rodzaju izolacji geograficznej oparte na ograniczonym przepływie genów między rybami, które lubią przebywać w różnych częściach jeziora. Wymaga to tylko, by ryba miała tendencję do kojarzenia się i posiadania potomstwa na pewnych obszarach, a potomstwo kojarzyło się z tymi, którzy są w pobliżu. Z czasem dałoby to selekcję do adaptowania się do środowiska i wygląd izolacji reprodukcyjnej jako skutek uboczny. Na poparcie tego autorzy notują, że wiele gatunków w tych dwóch radiacjach pokazanych powyżej jest „wyspecjalizowana środowiskowo”, znajdowana najczęściej w jednej konkretnej części jeziora.


Tak więc istnienie “cech magicznych” może ułatwiać specjację, ale nie jest to specjacja sympatryczna w ścisłym sensie, która jest tworzeniem nowych gatunków bez żadnej separacji fizycznej. Na zakończenie autorzy piszą:


Dostępne dowody sugerują, że wszystkie radiacje pielęgnic z jezior wulkanicznych podlegały specjacji przy pomocy podwójnych inwazji (Schliewen et al. 2006; Geiger et al. 2013) lub pozostały na etapie początkujących kompleksów gatunków (Elmer et al. 2010b; Martin 2012, 2013). Według tego, co wiemy, wszystkie przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza radiacjami pielęgnic z jezior wulkanicznych obejmują jakąś formę automatycznego powiązania między rozejściem się ekologicznym a czasem lub lokalizacją kojarzenia, znaną jako “automatyczne cechy magiczne” (patrz przegląd w Servedio et al. 2011).


Jakie są owe przekonujące przykłady specjacji sympatrycznej poza pielęgnicami z jezior wulkanicznych? Jednym z nich są dwa siostrzane gatunki drzew palmowych, które rozdzieliły się na wyspie Lord Howe. (Patrz mój opis tej sytuacji w News and Views “Speciation in a small space“; odnośnik poniżej). W tym przypadku kilka palm z kolonizujących gatunków znalazło się w suchej glebie, co automatycznie powoduje wcześniejsze kwitnienie niż roślin w wilgotniejszej glebie (w suchej glebie muszą mieć nasiona tak szybko, jak to możliwe, ponieważ wysychająca gleba może zredukować zdolność do reprodukowania się). Tak więc te palmy produkujące pyłek i zalążki równocześnie miały większe prawdopodobieństwo kojarzenia się wzajem ze sobą niż z palmami tego samego gatunku, które rosły na wilgotniejszej glebie, a które kwitły później. To mogło z czasem dać zróżnicowaną ewolucję adaptacyjną oraz izolację reprodukcyjną. Życie na suchej glebie jest jednym przykładem cechy magicznej, w której środowisko i reprodukcja są automatycznie powiązane.


Martin i in. podają trzy inne przykłady specjacji sympatrycznej, które uważają za przekonujące. Jednym jest przypadek dwóch grup mszyc (Acyrthosiphon pisum), które żyją na lucernie i pomidorach w USA i mówi się o nich, że ich specjacja była sympatryczna (pola pomidorów często leżą obok pól lucerny). Allen Orr i ja pokazaliśmy jednak w Speciation, że nie jest to dobry przykład specjacji sympatrycznej, ponieważ rozejście się nastąpiło prawdopodobnie w Europie, gdzie mszyce żyją na wielu roślinach, a potem była podwójna kolonizacja USA.


Dwa inne przypadki dotyczą golców i myszy kolczastych z Kanionu Ewolucji w Izraelu, kanionu, który ma ekologicznie odrębne strony. Nie czytałem jeszcze tych prac, więc nie mogę ich komentować. Jasne jest jednak po artykule zespołu Martina, że najbardziej przekonujący przykład specjacji sympatrycznej, jaki mieliśmy, nie jest już dłużej tak przekonujący.


Co pozostaje? Rośliny z Lord Howe są dobrym przykładem specjacji na bardzo małej wyspie, ale należy zbadać, czy “cechy magiczne” mogły tam działać. Poza tymi roślinami jest kilka innych przypadków (inne ryby i osy figowe), które wspomnieliśmy w Speciation, ale dowody nie były zbyt mocne. Wszystkie dane sugerują, że choć specjacja sympatryczna ze swobodnym przepływem genów jest teoretycznie możliwa, niewiele jest dowodów, że zachodzi w naturze. Z pewnością są jakieś przypadki (wszystko, co jest możliwe, zdarzyło się przynajmniej raz w ewolucji) i oczywiście zdobycie dobrych dowodów dla tych przypadków będzie trudne. Możemy jednak powiedzieć, że nie ma wystarczających danych do często powtarzanego twierdzenia, że specjacja sympatryczna jest powszechna.

___________

Coyne, J. A. Speciation in a small space. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 108:12975-12976.

Martin, C. H., et al. (2015). Complex histories of repeated gene flow in Cameroon crater lake cichlids cast doubt on one of the clearest examples of sympatric speciation. Evolution 69(6): 1406-1422.

Schliewen, U. K., et al. (1994). Sympatric speciation suggested by monophyly of crater lake cichlids. Nature 368: 629-632.


Cameroon lake cichlids probably did not speciate sympatrically part 2

Why Evolution Is True, 26 czerwca 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Jerry A. Coyne

Profesor na wydziale ekologii i ewolucji University of Chicago, jego książka "Why Evolution is True" (Polskie wydanie: "Ewolucja jest faktem", Prószyński i Ska, 2009r.) została przełożona na kilkanaście języków, a przez Richarda Dawkinsa jest oceniana jako najlepsza książka o ewolucji.  Jerry Coyne jest jednym z najlepszych na świecie specjalistów od specjacji, rozdzielania się gatunków.  Jest wielkim miłośnikiem kotów i osobistym przyjacielem redaktor naczelnej.

Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1474 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Artykuł w piśmie „Science”: rozszerzyć DEI w STEMM   Coyne   2024-04-19
Dlaczego organizacje naukowe powinny zachować neutralność polityczną?   Coyne   2024-04-11
Darwin znowu się myli! Artykuł pokazuje, że jego hipoteza o „samcach większych u ssaków” wydaje się błędna   Coyne   2024-04-06
Czasami gwoździe, koparki, straż, czasami lalki, wstążki, makijaż   Tonhasca Júnior   2024-04-03
Po raz kolejny twierdzenie, że płeć nie jest binarna, ale bez żadnych nowych argumentów   Coyne   2024-03-29
Jak małpy człekokształtne (włącznie z ludźmi) straciły swoje ogony   Coyne   2024-03-26
Ale najpierw kawa   Tonhasca Júnior   2024-03-21
Ideolodzy: dlaczego nauczanie genetyki musi mieć charakter społeczno-polityczny   Coyne   2024-03-19
Przepływ genów od neandertalczyków i denisowian do ludzi „współczesnych” i odwrotnie   Coyne   2024-03-14
Wejdź – skoro nalegasz   Tonhasca Júnior   2024-03-09
Czy “bezpłciowe” bakterie tworzą biologiczne gatunki?   Coyne   2024-03-06
Carl Zimmer o gatunkach i ochronie     2024-02-29
Kolejna błędna próba skorygowania ewolucji   Coyne   2024-02-22
Ryjący w ziemi przedsiębiorcy   Tonhasca Júnior   2024-02-15
Olbrzymie armie o niezliczonych umiejętnościach    Tonhasca Júnior   2024-02-08
Wejdź, powiedziała, dam ci schronienie przed burzą   Tonhasca Júnior   2024-01-15
Czy ludzie wyewoluowali w wodzie?   Coyne   2024-01-08
Jak upadają wielcy   Tonhasca Júnior   2024-01-04
Oczy reniferów zmieniają kolor, żeby łatwiej im było dostrzec jadalne porosty   Coyne   2023-12-30
Życzliwi przestępcy   Tonhasca Júnior   2023-12-28
Conor Friedesdorf (i Alexander Barvinok) o ideologicznym przymusie na amerykańskich uczelniach   Coyne   2023-12-26
Zdumiewający manipulatorzy   Tonhasca Júnior   2023-12-25
Nie gryzie się ręki, która cię zapyla   Tonhasca Júnior   2023-10-19
Rewolucja komunikacyjna   Hannam   2023-10-18
BBC szerzy propagandę rolnictwa organicznego, a biedni na świecie cierpią   i Kathleen Hefferon   2023-10-13
Niezwykły przypadek koewolucji i specyficzności zapylacz/storczyk   Coyne   2023-10-07
Płeć męska lub żeńska: nie ma nic pomiędzy   Elliot   2023-10-03
Myślenie intuicyjne i analityczne   Novella   2023-09-29
„Kryzys klimatyczny” to mistyfikacja   Williams   2023-09-25
Jak (i dlaczego) ośmiornica edytuje swój RNA   Lewis   2023-09-23
„Najbardziej znany zabójca ludzi”: jakie są prawdziwe początki XIV-wiecznej Czarnej Śmierci?   Lewis   2023-09-15
Do jakiego stopnia pary mają wspólne cechy?   Novella   2023-09-14
Kenia daje zielone światło 58 projektom GMO – naukowcy na całym świecie kontynuują badania w dziedzinie biotechnologii, mimo procesów sądowych i dezinformacji   Ombogo   2023-09-08
Lancet atakuje anty-przebudzenie, a czytelnik odpowiada   Coyne   2023-08-24
Więcej wyrafinowanej teologii: uczony religijny zastanawia się, czy neandertalczycy mieli nieśmiertelne dusze   Coyne   2023-08-16
Aktywiści anty-GMO w Afryce szerzą mity i strach, ale nie przedstawiają żadnych naukowych dowodów   Abutu   2023-08-14
Mało znana strona ryjkowców   Tonhasca Júnior   2023-08-11
Dlaczego nie można być osobą transrasową?   Coyne   2023-08-10
Walka z malarią za pomocą inżynierii genetycznej   Novella   2023-08-08
Jak restrykcje Unii Europejskiej podsycały głosy przeciwko GMO, jak również głód na globalnym Południu, a zwłaszcza w Afryce   Oria   2023-08-02
Nieznośni mali pomocnicy   Tonhasca Junior   2023-07-29
Macedońskie skarby   Tonhasca Júnior   2023-07-26
GMO i motyle   Novella   2023-07-25
Narzucanie ideologii naturze: Kew Garden celebruje „rośliny queer”   Coyne   2023-07-24
Smak miesiąca   Tonhasca Júnior   2023-07-20
Kłopoty na wylocie   Szczęsny   2023-07-18
Ideologiczne podważanie biologii   i Luana S. Maroja   2023-07-17
Role mężczyzn i kobiet w polowaniu, raz jeszcze   Coyne   2023-07-15
David Hillis o specjacji   Coyne   2023-07-13
Niechętni dawcy i pracowici biorcy   Tonhasca Júnior   2023-07-08
Grube problemy z jelitem   Szczęsny   2023-07-07
Badaczka z Leakey Foundation twierdzi, że kości orangutanów mówią nam, że biologiczna płeć jest spektrum, a nie binarna   Coyne   2023-06-30
Przez dziurkę od klucza   Szczęsny   2023-06-24
Nowa (nie podparta żadnymi dowodami) hipoteza, która eliminuje role płciowe w społecznościach łowców-zbieraczy   Coyne   2023-06-22
Błędne wyobrażenia o ewolucji   Coyne   2023-06-16
Influencerzy z podziemia   Tonhasca Júnior   2023-06-13
Jak wyewoluowało ubarwienie ostrzegawcze?   Coyne   2023-06-12
„San Francisco Chronicle” bardzo myli się w sprawie biologicznej płci   Coyne   2023-06-09
Kolczasty problem   Tonhasca Júnior   2023-06-06
Wpaść w amok. Empiryczna analiza szaleńczych zabójstw pokazuje, że wyłaniają się dwa różne wzorce.   King   2023-06-03
Błędna krytyka genetycznych testów na pochodzenie   Coyne   2023-06-02
Zdatny do lotu   Tonhasca Júnior   2023-06-01
‘Raniąca’ idea merytorycznych podstaw nauki    i Jerry Coyne   2023-05-29
Główny problem w filogenezie zwierząt wydaje się być rozwiązany   Coyne   2023-05-26
Americana   Tonhasca Júnior   2023-05-24
Czy uprawa jabłek odzwierciedla bigoterię?   Coyne   2023-05-18
Kenia: Musimy zająć się brakiem bezpieczeństwa żywnościowego, ale najpierw musimy położyć kres dezinformacji na temat upraw modyfikowanych genetycznie   Oria   2023-05-16
Czytanie myśli z fMRI i AI   Novella   2023-05-05
Jest lepiej niż myślisz   Lomborg   2023-05-03
Dwudziestu dziewięciunaukowców publikuje artykuł w obronie merytorycznych podstaw w nauce     2023-05-01
Niewygodna historia   Ferguson   2023-04-28
Biologia rezygnacji z działania: kiedy kontynuować, a kiedy spasować   Coyne   2023-04-26
Porywacze ciał   Tonhasca Júnior   2023-04-25
Porażka jest kluczowym składnikiem innowacji   Ridley   2023-04-22
Używanie roślin jako biofrabryk   Novella   2023-04-14
Dawno zmarli przemawiają do nas   Tonhasca Júnior   2023-04-12
Wątpliwi pomocnicy    Tonhasca Júnior   2023-04-08
Uganda: aktywiści przeciwni biotechnologii szerzą dezinformację   Wetaya   2023-04-05
Anglia pozwala na uprawy poddane edycji genów   Novella   2023-04-03
Recenzja z książki  Can “The Whole World” Be Wrong?   Rose   2023-04-01
Psychologia ewolucyjna dla początkujących   Coyne   2023-03-27
“Konwergentna” ewolucja mrówek grzybiarek Starego i Nowego świata   Coyne   2023-03-23
Gigantyczna armia małych zabójców   Tonhasca Júnior   2023-03-22
Colin Wright broni binarności płci u zwierząt   Coyne   2023-03-15
AI: gorąca randka z “Sydneyem ”   Gotefridi   2023-03-15
Zmienić język w ekologii i biologii ewolucyjnej! Przykład anemii sierpowatej   Coyne   2023-03-13
Wzrost liczby nieobecnych ojców i towarzyszące temu społeczne problemy   Geary   2023-03-11
No pasarán    Tonhasca Júnior   2023-03-04
Dezinformacja o GMO: Kenijczykom będzie trudno podejmować racjonalne decyzje i to może kosztować życie   Mykonyo   2023-02-24
Twardy kwiat do zgryzienia    Tonhasca Júnior   2023-02-22
ChatGPT niemal zdaje lekarski egzamin końcowy   Novella   2023-02-21
“Rogi” trylobitów mogły być używane jako broń w walkach między samcami   Coyne   2023-02-15
Postmodernizm obnażony   Dawkins   2023-02-14
Powody naszych wierzeń. Jak i dlaczego irracjonalność trzyma nas w swoich szponach i jak możemy z tym walczyć?   Pinker   2023-02-13
Kiedy zapada noc i ziemia jest ciemna   Tonhasca Júnior   2023-02-10
W nowej książce jest słuszna krytyka idei, że są lepsze i gorsze gatunki, ale jest także błędne twierdzenie, że gatunki nie są realne   Coyne   2023-02-06
Kolczatki wydmuchują bąbelki śluzu z nosa, żeby się ochłodzić   Coyne   2023-02-02
Mali i zręczni influencerzy   Tonhasca Júnior   2023-01-31
Dowody na ewolucję: Bezwłose zwierzęta mają martwe geny na sierść   Coyne   2023-01-23
Krew, znój, łzy i pot   Tonhasca Júnior   2023-01-19

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk