Prawda

Niedziela, 14 sierpnia 2022 - 18:39

« Poprzedni Następny »


Nowy raport: Bakteria po stu milionach lat nadal żywa!


Jerry A. Coyne 2020-08-08


Osłupiałem. Nowy raport w piśmie “Nature Communications” pokazuje, że pewne bakterie mogą pozostawać w uśpieniu przez ponad 100 milionów lat w osadach morskich – niewiarygodna ilość czasu, by organizm pozostał “żywy” – jeśli można to nazwać “żywym”. Ja to robię: w końcu, zebrane i ożywione przez badaczy bakterie zachowały zdolność przemiany materii, pobierania organicznych substancji i rozmnażania się. Uśpienie, przynajmniej dla mnie, nie jest tym samym, co “śmierć”.


Kliknij na link pod zrzutem z ekranu, żeby przeczytać artykuł (pdf jest tutaj).




https://www.nature.com/articles/s41467-020-17330-1


Eksperyment był pracochłonny, ale wyniki są proste. Jeśli chcesz poznać wszystkie drastyczne szczegóły, artykuł jest dostępny.


W skrócie, autorzy pobrali próbki gliniastych osadów w różnym wieku z Kręgu Południowego Pacyfiku i zapewniają, że zrobili to w taki sposób, by wykluczyć zanieczyszczenie nowoczesnymi bakteriami. Wspierając swoje twierdzenie tym, że bakterie, które znaleźli wewnątrz rdzeni pobranych z dna morskiego, były rzeczywiście bakteriami in situ, argumentowali, że glina jest niemal nieprzepuszczalna dla bakterii, z bardzo małymi porami, a ponad pobranymi osadami była gruba, nieprzepuszczalna warstwa. I mieli bardzo rygorystyczne środki ostrożności, by zapobiec zanieczyszczeniu.  


Aby zobaczyć, czy jakieś bakterie w osadach są zdolne do biologicznej aktywności włącznie z reprodukcją, testowali “anabolizm” (syntezę cząsteczek) przez trzymanie bakterii z tlenem (bakteriom kontrolnym nie dano tlenu), jak też z radioaktywnie oznakowanymi cząsteczkami, które można było pobrać i zamienić w białka i inne cząsteczki. Dodane cząsteczki obejmowały 13C6-glukozy, 13C2-octanu, 13C3-kwasu pirogronowego, 13C-dwuwęglanu, 13C-15N-mieszanki aminokwasów [mieszanka 20 aminokwasów] i 15N-amonu. Inną kontrolą było zabijanie bakterii formaldehydem. Badacze mogli wtedy zobaczyć przez mikroskop fluorescencyjny i radioaktywną wizualizację, czy prekursorowe cząsteczki zostały pobrane przez bakterie.  


Wreszcie, badacze mogli izolować bakterie w różnych momentach czasowych (próbki sprawdzające aktywność, wzrost i obecność bakteryjną pobrano w trzecim i szóstym tygodniu oraz po 18 miesiącach), żeby zobaczyć, czy wzrasta bakteryjne miano, tj., czy się dzielą. Na koniec autorzy wyizolowali RNA (16S rRNA) z indywidualnych bakterii, namnożyli, zsekwencjonowali powoli ewoluujący RNA i zobaczyli, do jakich grup żyjących bakterii należały te prastare bakterie. (To zakłada, że nadal możemy rozpoznać grupy z nowoczesnych sekwencji, ale te cząsteczki ewoluują bardzo powoli.)


Wyniki:

1.) Aerobowe bakterie (bakterie, które potrzebują tlenu) nadal były zdolne do życia, rozpoczynając metabolizm i reprodukcję nawet, kiedy pochodził z osadów w wieku 101,5 milionów lat. Anaerobowym bakteriom, które nie potrzebują tlenu, nie poszło nawet w przybliżeniu tak dobrze i autorzy sądzą, że także niskie koncentracje tlenu w osadach przez czas geologiczny po prostu zabijają anaerobowe bakterie.


Tutaj jest ilustracja z artykułu, która pokazuje zdjęcia bakterii, z tymi samymi bakteriami badanymi następnie na pobór dodanych cząsteczek. Podpis jest skomplikowany, ale możecie zobaczyć, że szczególnie z dodanymi aminokwasami (i tlenem) komórki świecą się intensywnie (d i h są obrazami z mikroskopu elektronowego tych samych bakterii, pokazanych jako świecące w rzędach).


(from paper): Cells from incubations of U1365 9H-3 with 13C-bicarbonate and 15N ammonium (a–d) and 13C,15N-Amino acid mix (e–h). (a, e) SYBR Green I-stained cells under fluorescence microscopy. b, c, f, g Ratio images of 13C/12C (b, f) and 12C15N/12C14N ratios (c, g) of the same regions imaged in a, e, demonstrating locations of 13C and 15N incorporation. Color-scale ranges of the ratios are shown as numbers appearing at top and bottom of the color bar. The background membrane region, which is identified by fluorescence images, is excluded from the ratio calculation and shown as black background. d, h. Secondary electron (NanoSIMS) images of the same regions in a, e. Bars represent 5 µm. Similar images were processed for obtaining the dataset (Supplementary Data 1) of substrate incorporations for 6986 individual cells. 

(from paper): Cells from incubations of U1365 9H-3 with 13C-bicarbonate and 15N ammonium (a–d) and 13C,15N-Amino acid mix (e–h). (a, e) SYBR Green I-stained cells under fluorescence microscopy. b, c, f, g Ratio images of 13C/12C (b, f) and 12C15N/12C14N ratios (c, g) of the same regions imaged in a, e, demonstrating locations of 13C and 15N incorporation. Color-scale ranges of the ratios are shown as numbers appearing at top and bottom of the color bar. The background membrane region, which is identified by fluorescence images, is excluded from the ratio calculation and shown as black background. d, h. Secondary electron (NanoSIMS) images of the same regions in a, e. Bars represent 5 µm. Similar images were processed for obtaining the dataset (Supplementary Data 1) of substrate incorporations for 6986 individual cells.

 


2.) Bakterie dzieliły się, co mierzono wzrostem ich liczby w próbach w miarę upływu czasu.


3.) Było znacznie trudniej znaleźć metabolizująca anaerobowe bakterie niż aerobowe.
Te pierwsze były praktycznie martwe.


4.) Linie rodowe bakterii zidentyfikowanych w osadach
, sądzone na podstawie sekwencjonowania ich i porównania 16S rRNA do nowoczesnych próbek, obejmują Actinobacteria,  Bacteroidetes,  Firmicutes,  Alphaproteobacteria,  Betaproteobacteria,  GammaproteobacteriaDeltaproteobacteria, oraz sinice (“cyjanobakterie”). Byłoby ciekawe porównanie sekwencji tych wczesnych gatunków z ich nowoczesnymi krewnymi, żeby zobaczyć dokładnie, ile i jakiego rodzaju zachodziło ewolucji.  


5.) Jak przeżyły?
 Jedną hipotezą było, że przetrwały jako uśpione spory, co może trwać długo u bakterii. Wykluczono jednak tę możliwość, ponieważ żadna zidentyfikowana bakteria nie pochodziła z linii tworzących spory. Wydaje się, że bakterie po prostu przeszły w stan uśpienia, przeżywając bez żadnego – lub niemal żadnego – dającego się wykryć metabolizmu i bez rozmnażania się. 


To nasuwa pytanie: czy te rzeczy rzeczywiście były żywe 101,5 milionów lat temu? Nie widzę, dlaczego nie miałyby być, chyba że uważa się coś, co wchodzi w stan uśpienia, za martwe, a potem, jak Łazarz, zmartwychwstaje, kiedy uśpienie zostaje przełamane. Jeśli ufamy autorom, że podjęli wystarczające środki ostrożności, by zapobiec zanieczyszczeniu współczesnymi bakteriami, to mamy tutaj najstarsze żywe organizmy na Ziemi.  


h/t: Jeremy

_________________

Morono, Y., Ito, M., Hoshino, T. et al. Aerobic microbial life persists in oxic marine sediment as old as 101.5 million yearsNat Commun 11, 3626 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17330-1


New report: Bacteria can remain alive for over 100 million years!

Why Evolution Is True, 30 lipca 2020

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Jerry A. Coyne

Emerytowany profesor na wydziale ekologii i ewolucji University of Chicago, jego książka "Why Evolution is True" (Polskie wydanie: "Ewolucja jest faktem", Prószyński i Ska, 2009r.) została przełożona na kilkanaście języków, a przez Richarda Dawkinsa jest oceniana jako najlepsza książka o ewolucji.  Jerry Coyne jest jednym z najlepszych na świecie specjalistów od specjacji, rozdzielania się gatunków. Jest również jednym ze znanych "nowych ateistów" i autorem książki "Faith vs Fakt". Jest wielkim miłośnikiem kotów i osobistym przyjacielem redaktor naczelnej.
 

Skomentuj     Wyślij artykuł do znajomego:     Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1327 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Nie karm mózgu śmieciowym jedzeniem   Bhogal   2022-08-10
Kot Mehitabel pisze w “Science”   Coyne   2022-08-09
Nauka o wolności: rozmowa z Anną Kryłow   i Anna Kryłow   2022-08-06
Pierwsze dowody kopalne na opiekę nad lęgiem i niezwykły przypadek asymetrii kierunkowej   Coyne   2022-08-05
Badania dowodzą, że fakty nie mają znaczenia: jak propaganda wykorzystuje i normalizuje antysemityzm     2022-08-03
Horyzontalny transfer genów u owadów: jest rozpowszechniony, ale co to znaczy?   Coyne   2022-08-02
Dokonane w Afryce badanie genomu fasolnika egipskiego oznacza krok naprzód w dywersyfikacji światowego zaopatrzenia w żywność   Karavolias   2022-08-01
Grupy anty-GMO przegrywają sprawę sądową w Nigerii    i Nkechi Isaak   2022-07-30
Raz jeszcze: czy rasy są tylko społecznym konstruktem bez naukowego lub biologicznego znaczenia?   Coyne   2022-07-28
„New Yorker” pisze o hoacynie, sugeruje, że koncepcja Darwina drzew ewolucyjnych może być urojeniem   Coyne   2022-07-25
Nazistowscy lekarze i dzisiejsi antysemici: redefinicja etyki, żeby usprawiedliwić prześladowania Żydów     2022-07-18
Carl Sagan i wolność wątpienia   Jacoby   2022-07-18
Jak Darwin spowodował globalne ocieplenie swoją teorią doboru płciowego   Coyne   2022-07-16
Dieta mieszana misiów i innych   Júnior   2022-07-14
Londyńskie Natural History Museum popełnia błąd naturalistyczny - wielokrotnie   Coyne   2022-07-11
Nigeria gotowa na spełnienie oczekiwań rolników     2022-07-08
Szczepionki przeciwko grypie związane ze zmniejszonym ryzykiem choroby Alzheimera   Novella   2022-07-07
Nowoczesność Darwina: w O powstawaniu jest antycypacja neutralnej teorii i przerywanej równowagi   Coyne   2022-07-06
Pinker: “Wojna o ewolucję jest także wojną kulturową”   Coyne   2022-07-05
Raz jeszcze: błędny artykuł o tym, dlaczego teoria ewolucji jest przestarzała   Coyne   2022-07-04
Niech Moc będzie z pszczołą   Júnior   2022-06-28
Dramatyczny wzrost cen paliw kopalnych jest bolesny, ale daje niewielkie korzyści w walce z globalnym ociepleniem   Lomborg   2022-06-25
Efekt grupy – paskudny błąd poznawczy   Novella   2022-06-22
Nasiona z edytowanymi genomami będą miały przystępną cenę   Maina   2022-06-15
„Zapylisz mnie!”: nachalni bohaterowie świata roślin   Júnior   2022-06-11
Agroekologia zmienia biednych farmerów w biedniejszych   Muhumuza   2022-06-09
Kartofel z Matką Boską w jednej klapie i Karolem Marksem w drugiej   Koraszewski   2022-06-06
Jak nasze wspomnienia są powiązane   Novella   2022-06-04
Wielka Brytania dąży do zezwolenia na edytowanie genów   Novella   2022-06-02
„Grubogłowi przedsiębiorcy pogrzebowi w noc żywych trupów”   Júnior   2022-05-31
Coraz mniejsza część głównych plonów roślin jadalnych na świecie idzie na wyżywienie głodnych, a coraz więcej wykorzystuje się do celów niespożywczych     2022-05-28
Naukowiec z Ghany: “Afryka potrzebuje GMO bardziej niż reszta świata”   Gakpo   2022-05-26
GMO i edytowanie genów: jaka jest różnica?   Karavolias   2022-05-23
Toksyczny nektar, czyli ostrożnie z tureckim miodem   Júnior   2022-05-20
Kolejna nieudana i podyktowana ideologią próba wykazania, że płeć u ludzi nie jest binarna   Coyne   2022-05-18
Brian Charlesworth o błędach nowego artykułu rzekomo pokazującego, że fundamentalne założenie ewolucji neodarwinowskiej jest błędne   Coyne   2022-05-16
Trutnie i inni fruwający panowie   Junior   2022-05-13
Wygnanie z uniwersyteckiego świata – dwa lata później   Winegard   2022-05-10
Życie kwitnące po śmierci   Junior   2022-05-05
Organiczne środki owadobójcze są szkodliwe dla pożytecznych owadów     2022-04-30
Oxitec rozszerza próby z komarami GMO, by zredukować szerzenie się malarii   Conrow   2022-04-28
Słowa w wosku zapisane   Tonhasca Junior   2022-04-26
Rodzice, szkoła, państwo: kultura niskich oczekiwań   Koraszewski   2022-04-25
Nowoczesne ulepszanie roślin uprawnych przyjmuje historyczne podejście   Karavolias   2022-04-20
Pierwsza spożywcza roślina GMO w Ghanie   Baffour-Awuah   2022-04-16
Indie zwalniają edytowanie genów z wymaganej dla GMO oceny bezpieczeństwa   Paranjape   2022-04-11
Metamorfozy    Júnior   2022-04-09
Rolnicy nie mogą uprawiać tego, na co ich nie stać   Ongu   2022-04-07
Rośliny zmodyfikowane: odkłamać opinię o GMO   Conrow   2022-04-07
Odmowa szczelinowania jest szaleństwem   Ridley   2022-04-02
Jak wirusy chorób układu oddechowego ewoluują, by stać się łagodniejsze   Ridley   2022-03-22
Czy globalne ocieplenie może być dla nas dobre?   Ridley   2022-03-03
Południowa Afryka powinna przemyśleć regulacje dotyczące genetycznie modyfikowanych roślin   i Priyen Pillay   2022-03-01
Dlaczego środowiskowcy stanowią większą przeszkodę dla skutecznej polityki klimatycznej niż negacjoniści?   Boudry   2022-02-21
O figach i osach   Júnior   2022-02-18
Pień liczący 40 tysięcy lat przekazany Maorysom zamiast nauce   Coyne   2022-02-14
Propaganda anty-GMO obraża drobnych farmerów w Afryce i w Azji   Gakpo   2022-02-08
Jak “tubylcza medycyna” różni się od medycyny   Coyne   2022-02-07
Biotechnologia podnosi plony wysokobiałkowego afrykańskiego pochrzynu   Wetaya   2022-02-04
Spadanie w przepaść   Turski   2022-01-27
Czy koniki morskie coś nam mówią o LGBT? Błąd naturalistyczny popełniony przez Sussex Wildlife Trust   Coyne   2022-01-25
Ojczyznę wolną (od GMO) zachowują pany   Koraszewski   2022-01-22
Namawianie roślin, żeby podjęły ryzyko   Karavolias   2022-01-20
Czy uczenie się metodą prób i błędów jest „nauką”?   Coyne   2022-01-14
Czy gaz i energia jądrowa są “zielone”   Novella   2022-01-12
Ptasia grypa w czasach ludzkiej zarazy   Collins   2022-01-11
Rasa jest kontinuum. Płeć jest cholernie binarna   Dawkins   2022-01-10
Komiczne krzyki o klimatycznej Apokalipsie –— 50 lat nieuzasadnionego siania paniki   Lomborg   2022-01-06
Gnidy, o których PIS ci nie powie   Koraszewski   2022-01-05
Niebezpieczeństwo upolitycznienia nauki   Krylov   2022-01-01
Specjalne przesłanie do muzułmanów na całym świecie   Pandavar   2021-12-28
Nowe badania pokazują, że kraje rozwijające się płacą wysoką cenę za ograniczanie upraw roślin GMO   Maina   2021-12-25
Jajo, które wywołało sensację   Koraszewski   2021-12-24
Pięć powodów zakończenia debaty o GMO   Evanea   2021-12-16
Richard Dawkins pisze do “przyjaciół nauki i rozumu” w Nowej Zelandii   Coyne   2021-12-14
 Syntetyczna biologia oferuje obietnicę rozwiązania globalnego problemu z plastikiem   Agaba   2021-12-13
Nigeria wzywa Afrykę, by szła w jej ślady w sprawie GM wspięgi wężowatej   Opoku Gakpo   2021-12-09
Małe nietoperze idą do przedszkola   Koraszewski   2021-12-06
Afrykańscy naukowcy wzywają do polityki poparcia biologii syntetycznej i innych innowacji   Agaba   2021-12-02
Uprawy GMO zredukowały zatrucia farmerów pestycydami   Maina   2021-11-27
Czy genetyka może pomóc wyeliminować nierówność?   Coyne   2021-11-26
Matematyka i prawdziwa historia katastrofy klimatycznej   Lomborg   2021-11-24
Nigeria daje zielone światło kukurydzy GMO   Conrow   2021-11-22
Ugandyjscy studenci nalegają na powszechne stosowanie biotechnologii i uchwalenie prawa o biobezpieczeństwie   Agaba   2021-11-17
Organiczny eksperyment Sri Lanki   Novella   2021-11-16
Ruanda skwapliwie przyjmuje biotechnologię poprzez ekspansję OFAB   Meeme   2021-11-12
Sprzeciw wobec anulowania Huxleya   Coyne   2021-11-05
Farmerka z Kenii zbiera obfity plon z bawełny GM   Meeme   2021-11-04
Czarni uczeni i nauka o rasizmie   Koraszewski   2021-11-03
Kłusownictwo narzuca na słonie dobór w kierunku ewolucji słoni bez ciosów   Coyne   2021-11-01
Marnujemy naszą wielką szansę na edytowanie genów   Ridely   2021-10-29
“Czarne tygrysy” w małym indyjskim rezerwacie sugerują losowy dryf genetyczny   Coyne   2021-10-26
Wytwarzanie białek w roślinach przez rolnictwo molekularne   Novella   2021-10-20
Strzelby, zarazki, maszyny to zdecydowanie antyrasistowska książka. Dlaczego lewica jej nie kocha?   Barnett   2021-10-13
Nigeryjscy farmerzy nie mogą się doczekać wystarczających ilości GM nasion wspięgi wężowatej   Gakpo   2021-10-12
Dobór płciowy versus dobór naturalny: na przykładzie chrząszczy   Coyne   2021-10-08
Edytowanie genów kluczem do ulepszenia podstawowych upraw w Afryce   Abugu   2021-10-01
Bakłażan GMO jest udokumentowaną wygraną ubogich farmerów   Conrow   2021-09-23
O Jezu, wskrzeszają mamuta!   Koraszewski   2021-09-17
Wszystkie antyizraelskie wiadomości zasługują na publikację   Bard   2021-09-04

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa



 Palestyńskie weto



Wzmacnianie układu odpornościowego



Wykluczenie Tajwanu z WHO



Drzazgę źle się czyta



Sześć lat



Pochodzenie



Papież Franciszek



Schadenfreude



Pseudonaukowa histeria...


Panstwo etc



Biły się dwa bogi


 Forma przejściowa


Wstęga Möbiusa


Przemysł produkcji kłamstw


Jesteś tym, co czytasz,


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Malgorzata, Andrzej, Marcin, Henryk