Prawda

Piątek, 10 maja 2024 - 12:30

« Poprzedni Następny »


Symbiotyczna katastrofa długoletniej cykady


Ed Yong 2015-06-02


Mniej więcej teraz w rozmaitych stanach USA, olbrzymie roje cykad zaczynają gramolić się z ziemi. Te owady o czarnym ciele i czerwonych oczach pozostawały pod ziemią przez 13 lub 17 lat, pijąc soki z korzeni drzew. Kiedy po raz pierwszy stykają się ze światłem dziennym, poświęcają się tygodniom gorączkowego seksu i kakofonicznej pieśni, potem masowo umierają. Podziobią je ptaki, dorwą wiewiórki, rozgniotą buty i opony, ale nic z tego nie naruszy ich astronomicznej liczebności – i, być może, o to chodzi w ich długich pobytach pod ziemią i równoczesnym wyłonieniu się.

Dziwaczny styl życia cykady pozostawił ją także z innym dziedzictwem. Chodzi o bakterię, która żyje w ich ciałach i jest tak dziwaczna, że kiedy John McCutcheonodkrył ją po raz pierwszy, sądził, że popełnił jakiś błąd techniczny.


Wiele owadów gości w swoich komórkach bakterie. Te „endosymbionty” są szczególnie częste wśród ożywiających się sokiem drzewnym owadów, takich jak cykady, i pomagają gospodarzom na tworzenie składników odżywczych, których nie mogą otrzymać ze swojego pokarmu. Niemal zawsze mają wyjątkowo małe genomy. Kiedy osiądą wewnątrz komórki owada, zostają izolowane od innych bakterii i ograniczone do małych populacji. Pozbawia je to możliwości tasowania lub nabywania genów i pozwala na nabudowanie się szkodliwych mutacji w ich DNA. Jeden po drugim ich geny rozłamują się i znikają, pozostawiając je ze skurczonymi, minimalnymi genomami.


McCutcheon jest jednym z niewielkiej grupy naukowców, którzy przez ostatnich 15 lat odszyfrowywali dziwaczne genomy wielu symbiontów owadzich. Kiedy rozpoczął pracę we własnym laboratorium na University of Montana, postanowił przyjrzeć się Magicicada tredicim – jednemu z 13-letnich gatunków cykady. Zrobił to, co robi się zazwyczaj: dokonał sekcji narządów, w których żyją bakterie, wydobył ich DNA, pociął je na fragmenty, zsekwencjonował odcinki i użył komputera, żeby zestawić te porcje w spójną całość.


Tylko że to nie działało. Sekwencje po prostu nie chciały ułożyć się elegancko. Wyglądało to, jakby ktoś wziął kilka podobnych, ale niepełnych układanek i wymieszał wszystkie kawałki razem. „To był taki bałagan – opowiada. – Myślałem, że coś poszło nie tak technicznie, ale nie umiałem zrozumieć, co”.


Skonsternowany przeszedł do innej cykady – południowoamerykańskiego gatunku o nazwie Tettigades undata. Znalazł tam jeszcze więcej dziwaczności. Zawierała ona bakterię o nazwie Hodgkinia, która jakoś rozdzieliła się na dwa odrębne gatunki wewnątrz swojego owadziego gospodarza. Jak pisałem w zeszłym roku, te gatunki potomne były jak dwie połówki swojego przodka. Każda straciła inne geny, więc indywidualnie każda jest bladym cieniem oryginalnej Hodgkinia, ale razem wzięte doskonale się uzupełniają.


Kiedy McCutcheon zrozumiał, co dzieje się w T.undata, nagle zrozumiał również, co dzieje się w 13-letniej cykadzie. Ona także zawierała symbionty Hodgkinia, które rozdzieliły się na odrębne linie rodowe – i to nie tylko dwie.


Doktoranci Matthew Campbell i James Van Leuven pokazali w końcu, że DNA z symbiontów cykady tworzy co najmniej 17 odrębnych kręgów. Nie jest jasne, czy każdy z nich przedstawia chromosom Hodgkinia, czy też cały własny genom Hodgkinia, ale przynajmniej cztery z nich znajdują się w różnych komórkach. Można zobaczyć to na ilustracji poniżej, gdzie kropki niebieskie, zielone, fioletowe i pomarańczowe reprezentują komórki, które mają tylko jeden z tych 17 kręgów.



Podobnie jak we wcześniejszym odkryciu, te kręgi uzupełniają się wzajemnie; dzielą zestawy genów do tworzenia składników odżywczych, które ważne są dla gospodarza, ale żaden z nich nie ma pełnego zestawu. Znajdują się także u innych gatunków cykad wieloletnich. I są, być może, tylko czubkiem góry lodowej: zespół z pewnością zidentyfikował 17 kręgów, ale prawdopodobnie owady mają ich więcej. „Gdybym miał zgadywać, powiedziałbym, że jest ich między 20 a 50 – mówi McCutcheon. – To niewiarygodne. To bałagan”.


Z punktu widzenia Hodginia jedna linia wyraźnie rozdzieliła się na kilka i jest to nieodwracalne. „To jest podstawowa definicja specjacji – mówi McCutcheon. – Dzieje się to w populacji bezpłciowej, ale linia jest rozłamana i nie powraca”. Jeśli jednak spojrzeć na to z punktu widzenia cykady, kolektywne symbionty nadal robią to samo, co oryginał. I chociaż porozdzielały swoje geny do oddzielnych komórek, cała ilość bakteryjnego DNA wzrosła. Każda część zmalała, ale kolektywnie ich genom powiększył się.


Czy więc kręgi Hodgkinia są różnymi gatunkami lub liniami? Czy genomem Hodgkinia jest suma kręgów w jednej cykadzie, czy też każda odrębna linia ma własny genom? Naprawdę trudno powiedzieć. „Problem polega na tym, że kiedy piszemy artykuł, musimy użyć słów, a słowa coś znaczą – mówi McCutcheon. – Jest bardzo trudno ponaklejać etykietki na to wszystko, a nie dam po prostu nowych nazw jak popadnie, bo nie sądzę, byśmy to wystarczająco dobrze rozumieli”.


Są tam także inne tajemnice. Cykada ma także innego bakteryjnego symbionta o nazwie Sulcia, który nie wykazuje żadnych oznak tej absurdalnej fragmentaryzacji. Jest tylko jedna Sulcia i jest taka sama we wszystkich komórkach cykady. Dlaczego ten mikrob pozostał w całości, podczas gdy jego sąsiad porozdzierał się? Nikt nie wie. Sensownym domysłem jest, że Hodgkinia ewoluuje dużo szybciej niż Sulcia i szybciej nabudowuje mutacje, które unieruchamiają jej geny.


A także, dlaczego Hodgkinia rozeszła się na wiele linii w cykadach, ale nie zrobiły tego inne symbionty w swoich gospodarzach? McCutcheon sądzi, że odpowiedź leży w długim życiu tych owadów. Większość pijących soki owadów ma szczęście, jeśli dożyje swoich pierwszych urodzin. Prowadzą krótkie, szybkie życie i jeśli ich symbionty nabywają szkodliwych mutacji, one i ich gospodarze padają ofiarą doboru naturalnego. W odróżnieniu od tego cykady żyją 2 do 19 lat i przez większość czasu ledwie się poruszają i niewiele rosną. Podczas tych powolnych lat ich symbionty nie są ważne i mają swobodę kumulowania szkodliwych mutacji, co nie wpływa na ich gospodarza ani nie podpada pod dobór naturalny – przynajmniej na krótką metę.


Długoterminowe perspektywy mogą nie być tak różowe. Partnerstwo z mikrobami często dostarcza zwierzętom niewiarygodnych i cennych sprawności – w tym wypadku, zdolności odżywiania się sokiem roślinnym bez niedoborów ważnych składników odżywczych. Ale wielka okazja niesie za sobą wielkie ryzyko. Kiedy gospodarz i bakteria stają się wzajem zależne od siebie, mogą wpaść w rodzaj pułapki symbiotycznej – lub, jak ujmuje to Nancy Moran, mogą wspólnie “spadać po spirali w norę króliczą”.


Weźmy Hodgkinia. Jeśli będzie dalej dzielić się na fragmenty i degenerować się, w końcu może być niezdolna do odżywiania cykady. “To wygląda, jakby wypadała z torów – mówi  McCutcheon. – To jak obserwowanie katastrofy kolejowej lub wypadku wymierania w zwolnionym tempie. Zmieniło to mój sposób myślenia o symbiozie”.


Źródło:
Campbell, Van Leuven, Meister, Carey, Simon, and McCutcheon. 2015. Genome expansion via lineage splitting and genome reduction in the cicada endosymbiont Hodgkinia. PNAS http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1421386112


The Slow Motion Symbiotic Train Wwreck of the 13-year Cicada

Not Exactly Rocket Science, 18 maja 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Ed Yong 


Mieszka w Londynie i pracuje w Cancer Research UK. Jego blog „Not Exactly Rocket Science” jest próbą zainteresowania nauką szerszej rzeszy czytelników poprzez unikanie żargonu i przystępną prezentację.
Strona www autora


Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1477 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Jak wirusy chorób układu oddechowego ewoluują, by stać się łagodniejsze   Ridley   2022-03-22
Czy globalne ocieplenie może być dla nas dobre?   Ridley   2022-03-03
Południowa Afryka powinna przemyśleć regulacje dotyczące genetycznie modyfikowanych roślin   i Priyen Pillay   2022-03-01
Dlaczego środowiskowcy stanowią większą przeszkodę dla skutecznej polityki klimatycznej niż negacjoniści?   Boudry   2022-02-21
O figach i osach   Júnior   2022-02-18
Pień liczący 40 tysięcy lat przekazany Maorysom zamiast nauce   Coyne   2022-02-14
Propaganda anty-GMO obraża drobnych farmerów w Afryce i w Azji   Gakpo   2022-02-08
Jak “tubylcza medycyna” różni się od medycyny   Coyne   2022-02-07
Biotechnologia podnosi plony wysokobiałkowego afrykańskiego pochrzynu   Wetaya   2022-02-04
Spadanie w przepaść   Turski   2022-01-27
Czy koniki morskie coś nam mówią o LGBT? Błąd naturalistyczny popełniony przez Sussex Wildlife Trust   Coyne   2022-01-25
Ojczyznę wolną (od GMO) zachowują pany   Koraszewski   2022-01-22
Namawianie roślin, żeby podjęły ryzyko   Karavolias   2022-01-20
Czy uczenie się metodą prób i błędów jest „nauką”?   Coyne   2022-01-14
Czy gaz i energia jądrowa są “zielone”   Novella   2022-01-12
Ptasia grypa w czasach ludzkiej zarazy   Collins   2022-01-11
Rasa jest kontinuum. Płeć jest cholernie binarna   Dawkins   2022-01-10
Komiczne krzyki o klimatycznej Apokalipsie –— 50 lat nieuzasadnionego siania paniki   Lomborg   2022-01-06
Gnidy, o których PIS ci nie powie   Koraszewski   2022-01-05
Niebezpieczeństwo upolitycznienia nauki   Krylov   2022-01-01
Specjalne przesłanie do muzułmanów na całym świecie   Pandavar   2021-12-28
Nowe badania pokazują, że kraje rozwijające się płacą wysoką cenę za ograniczanie upraw roślin GMO   Maina   2021-12-25
Jajo, które wywołało sensację   Koraszewski   2021-12-24
Pięć powodów zakończenia debaty o GMO   Evanea   2021-12-16
Richard Dawkins pisze do “przyjaciół nauki i rozumu” w Nowej Zelandii   Coyne   2021-12-14
 Syntetyczna biologia oferuje obietnicę rozwiązania globalnego problemu z plastikiem   Agaba   2021-12-13
Nigeria wzywa Afrykę, by szła w jej ślady w sprawie GM wspięgi wężowatej   Opoku Gakpo   2021-12-09
Małe nietoperze idą do przedszkola   Koraszewski   2021-12-06
Afrykańscy naukowcy wzywają do polityki poparcia biologii syntetycznej i innych innowacji   Agaba   2021-12-02
Uprawy GMO zredukowały zatrucia farmerów pestycydami   Maina   2021-11-27
Czy genetyka może pomóc wyeliminować nierówność?   Coyne   2021-11-26
Matematyka i prawdziwa historia katastrofy klimatycznej   Lomborg   2021-11-24
Nigeria daje zielone światło kukurydzy GMO   Conrow   2021-11-22
Ugandyjscy studenci nalegają na powszechne stosowanie biotechnologii i uchwalenie prawa o biobezpieczeństwie   Agaba   2021-11-17
Organiczny eksperyment Sri Lanki   Novella   2021-11-16
Ruanda skwapliwie przyjmuje biotechnologię poprzez ekspansję OFAB   Meeme   2021-11-12
Sprzeciw wobec anulowania Huxleya   Coyne   2021-11-05
Farmerka z Kenii zbiera obfity plon z bawełny GM   Meeme   2021-11-04
Czarni uczeni i nauka o rasizmie   Koraszewski   2021-11-03
Kłusownictwo narzuca na słonie dobór w kierunku ewolucji słoni bez ciosów   Coyne   2021-11-01
Marnujemy naszą wielką szansę na edytowanie genów   Ridely   2021-10-29
“Czarne tygrysy” w małym indyjskim rezerwacie sugerują losowy dryf genetyczny   Coyne   2021-10-26
Wytwarzanie białek w roślinach przez rolnictwo molekularne   Novella   2021-10-20
Strzelby, zarazki, maszyny to zdecydowanie antyrasistowska książka. Dlaczego lewica jej nie kocha?   Barnett   2021-10-13
Nigeryjscy farmerzy nie mogą się doczekać wystarczających ilości GM nasion wspięgi wężowatej   Gakpo   2021-10-12
Dobór płciowy versus dobór naturalny: na przykładzie chrząszczy   Coyne   2021-10-08
Edytowanie genów kluczem do ulepszenia podstawowych upraw w Afryce   Abugu   2021-10-01
Bakłażan GMO jest udokumentowaną wygraną ubogich farmerów   Conrow   2021-09-23
O Jezu, wskrzeszają mamuta!   Koraszewski   2021-09-17
Wszystkie antyizraelskie wiadomości zasługują na publikację   Bard   2021-09-04
Tożsamość etniczna i rasa   Coyne   2021-08-30
Środowiskowcy mylili się – nie stoimy przed apokalipsą owadów   Ridley   2021-08-13
Czy znaleziono najstarszy dowód na istnienie zwierzęcia? Nowa gąbko-podobna skamieniałość liczy 890 milionów lat   Coyne   2021-08-11
Psy rozumieją ludzi   Novella   2021-08-06
Nowy start nauki o życiu w epoce genu   Ridley   2021-08-05
Użycie ognia przez homininy: przykład szybkiej ewolucji kulturowej?   Coyne   2021-08-04
Historia pandemii jest historią zaprzeczania   Jackoby   2021-07-27
Nieuchwytny neuron babci   Novella   2021-07-22
Cierpienie i pytanie, czy przestaniemy jeść mięso   Koraszewski   2021-07-14
Czy nadchodzi hydroponika?   Novella   2021-07-13
Raport Unii Europejskiej o glifosacie   Novella   2021-07-10
Dlaczego ideologii nie należy mieszać z nauką   Coyne   2021-06-30
Nagonka na Izrael grasuje w stowarzyszeniach nauk ścisłych, medycyny i edukacji   Chesler   2021-06-24
Szczęśliwi pracoholicy   Witkowski   2021-06-03
Propaganda w wykonaniu nauczycieli akademickich   Chesler   2021-06-02
Ewolucja wielokomórkowości   Novella   2021-05-07
Polityczna polaryzacja jest przesadzona   Novella   2021-05-04
Wrotki były kiedyś sztandarową grupą istot bez seksu, a teraz sądzi się, że ukradkiem odstawiają szybkie numerki   Coyne   2021-04-22
Błędna historia antykolonializmu   Tupy   2021-04-21
Mayflower wyrusza w podróż raz jeszcze   Koraszewski   2021-04-19
Genetyczny przełącznik CRISPR   Novella   2021-04-16
Wielkie zdarzenie oksydacyjne   Novela   2021-04-09
Kiedy panika klimatyczna zlewa się z kulturą anulowania   Lomborg   2021-04-06
Czy wykształceni ludzie są bardziej antysemiccy?   Albert Cheng i Ian Kingsbury   2021-04-05
Nieoczekiwana historia i cudowny sukces szczepionek   Ridley   2021-03-31
Innowacja jest geograficznie zlokalizowanym i chwilowym zjawiskiem   Ridley   2021-03-29
Czy gąbki są najbliższymi krewnymi pozostałych zwierząt?   Coyne   2021-03-26
Kilka lekcji z rosyjskiej rewolucji. Jak kuszący radykalny nihilizm prowadzi do ekstremizmu   Geifman   2021-03-22
Wracamy do raju?   Łukaszewski   2021-03-18
Ślimakowi morskiemu odrasta tułów z odciętej głowy, czyli “autotomia z kleptoplastią”   Coyne   2021-03-15
Ewolucyjne korzyści udawania ofiary   Clark   2021-03-11
Ludzie i wymieranie megafauny   Novella   2021-03-10
Banany edytowane przez CRISPR   Novella   2021-03-02
Nikczemne grzyby naśladują kwiaty trawy, by ułatwić własne rozmnażanie się   Coyne   2021-02-26
Co zabiło megafaunę Ameryki Północnej?   Novella   2021-02-25
Stresy i nowe szczepy wirusa   Ridley   2021-02-12
EWOLUCJA wirusa Covid-19   Coyne   2021-02-10
Czy „toksyczna kobiecość” jest główną przyczyną bojów o społeczną sprawiedliwość?   Coyne   2021-02-08
Najmniejszy gad (i owodniowiec) świata: BARDZO mały kameleon   Coyne   2021-02-05
Dlaczego kocimiętka i matatabi doprowadzają koty do szaleństwa? Grupa badaczy mówi, że te rośliny mogą chronić je przed komarami   Coyne   2021-02-02
Bądźcie sceptyczni wobec wideo pokazujących “skutki uboczne” szczepionki   Novella   2021-01-28
Szaleństwo odnawialnej energii   Ridley   2021-01-23
Głębia ludzkiej historii   Novella   2021-01-19
Dlaczego szczepionki mRNA mogą zrewolucjonizować medycynę?   Ridley   2021-01-02
Szczepionka mRNA na koronawirusa: świadectwo ludzkiej pomysłowości i mocy nauki   Coyne   2021-01-01
Dziwaczny rodzaj rasistowskiego patriarchatu   Arora   2020-12-31
Centrala muszek owocowych: Bloomington Drosophila Stock Center   Coyne   2020-12-29
Pierwszy raport o używaniu narzędzi przez pszczoły: rodzimy gatunek używa grudek łajna, by odeprzeć drapieżne szerszenie   Coyne   2020-12-23
Nie – żadne chi nie istnieje   Novella   2020-12-21
Moc nauki dostarczyła najlepszej możliwej wiadomości w tym koszmarnym roku   Ridley   2020-12-18

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk