Prawda

Niedziela, 28 kwietnia 2024 - 16:22

« Poprzedni Następny »


Symbiotyczna katastrofa długoletniej cykady


Ed Yong 2015-06-02


Mniej więcej teraz w rozmaitych stanach USA, olbrzymie roje cykad zaczynają gramolić się z ziemi. Te owady o czarnym ciele i czerwonych oczach pozostawały pod ziemią przez 13 lub 17 lat, pijąc soki z korzeni drzew. Kiedy po raz pierwszy stykają się ze światłem dziennym, poświęcają się tygodniom gorączkowego seksu i kakofonicznej pieśni, potem masowo umierają. Podziobią je ptaki, dorwą wiewiórki, rozgniotą buty i opony, ale nic z tego nie naruszy ich astronomicznej liczebności – i, być może, o to chodzi w ich długich pobytach pod ziemią i równoczesnym wyłonieniu się.

Dziwaczny styl życia cykady pozostawił ją także z innym dziedzictwem. Chodzi o bakterię, która żyje w ich ciałach i jest tak dziwaczna, że kiedy John McCutcheonodkrył ją po raz pierwszy, sądził, że popełnił jakiś błąd techniczny.


Wiele owadów gości w swoich komórkach bakterie. Te „endosymbionty” są szczególnie częste wśród ożywiających się sokiem drzewnym owadów, takich jak cykady, i pomagają gospodarzom na tworzenie składników odżywczych, których nie mogą otrzymać ze swojego pokarmu. Niemal zawsze mają wyjątkowo małe genomy. Kiedy osiądą wewnątrz komórki owada, zostają izolowane od innych bakterii i ograniczone do małych populacji. Pozbawia je to możliwości tasowania lub nabywania genów i pozwala na nabudowanie się szkodliwych mutacji w ich DNA. Jeden po drugim ich geny rozłamują się i znikają, pozostawiając je ze skurczonymi, minimalnymi genomami.


McCutcheon jest jednym z niewielkiej grupy naukowców, którzy przez ostatnich 15 lat odszyfrowywali dziwaczne genomy wielu symbiontów owadzich. Kiedy rozpoczął pracę we własnym laboratorium na University of Montana, postanowił przyjrzeć się Magicicada tredicim – jednemu z 13-letnich gatunków cykady. Zrobił to, co robi się zazwyczaj: dokonał sekcji narządów, w których żyją bakterie, wydobył ich DNA, pociął je na fragmenty, zsekwencjonował odcinki i użył komputera, żeby zestawić te porcje w spójną całość.


Tylko że to nie działało. Sekwencje po prostu nie chciały ułożyć się elegancko. Wyglądało to, jakby ktoś wziął kilka podobnych, ale niepełnych układanek i wymieszał wszystkie kawałki razem. „To był taki bałagan – opowiada. – Myślałem, że coś poszło nie tak technicznie, ale nie umiałem zrozumieć, co”.


Skonsternowany przeszedł do innej cykady – południowoamerykańskiego gatunku o nazwie Tettigades undata. Znalazł tam jeszcze więcej dziwaczności. Zawierała ona bakterię o nazwie Hodgkinia, która jakoś rozdzieliła się na dwa odrębne gatunki wewnątrz swojego owadziego gospodarza. Jak pisałem w zeszłym roku, te gatunki potomne były jak dwie połówki swojego przodka. Każda straciła inne geny, więc indywidualnie każda jest bladym cieniem oryginalnej Hodgkinia, ale razem wzięte doskonale się uzupełniają.


Kiedy McCutcheon zrozumiał, co dzieje się w T.undata, nagle zrozumiał również, co dzieje się w 13-letniej cykadzie. Ona także zawierała symbionty Hodgkinia, które rozdzieliły się na odrębne linie rodowe – i to nie tylko dwie.


Doktoranci Matthew Campbell i James Van Leuven pokazali w końcu, że DNA z symbiontów cykady tworzy co najmniej 17 odrębnych kręgów. Nie jest jasne, czy każdy z nich przedstawia chromosom Hodgkinia, czy też cały własny genom Hodgkinia, ale przynajmniej cztery z nich znajdują się w różnych komórkach. Można zobaczyć to na ilustracji poniżej, gdzie kropki niebieskie, zielone, fioletowe i pomarańczowe reprezentują komórki, które mają tylko jeden z tych 17 kręgów.



Podobnie jak we wcześniejszym odkryciu, te kręgi uzupełniają się wzajemnie; dzielą zestawy genów do tworzenia składników odżywczych, które ważne są dla gospodarza, ale żaden z nich nie ma pełnego zestawu. Znajdują się także u innych gatunków cykad wieloletnich. I są, być może, tylko czubkiem góry lodowej: zespół z pewnością zidentyfikował 17 kręgów, ale prawdopodobnie owady mają ich więcej. „Gdybym miał zgadywać, powiedziałbym, że jest ich między 20 a 50 – mówi McCutcheon. – To niewiarygodne. To bałagan”.


Z punktu widzenia Hodginia jedna linia wyraźnie rozdzieliła się na kilka i jest to nieodwracalne. „To jest podstawowa definicja specjacji – mówi McCutcheon. – Dzieje się to w populacji bezpłciowej, ale linia jest rozłamana i nie powraca”. Jeśli jednak spojrzeć na to z punktu widzenia cykady, kolektywne symbionty nadal robią to samo, co oryginał. I chociaż porozdzielały swoje geny do oddzielnych komórek, cała ilość bakteryjnego DNA wzrosła. Każda część zmalała, ale kolektywnie ich genom powiększył się.


Czy więc kręgi Hodgkinia są różnymi gatunkami lub liniami? Czy genomem Hodgkinia jest suma kręgów w jednej cykadzie, czy też każda odrębna linia ma własny genom? Naprawdę trudno powiedzieć. „Problem polega na tym, że kiedy piszemy artykuł, musimy użyć słów, a słowa coś znaczą – mówi McCutcheon. – Jest bardzo trudno ponaklejać etykietki na to wszystko, a nie dam po prostu nowych nazw jak popadnie, bo nie sądzę, byśmy to wystarczająco dobrze rozumieli”.


Są tam także inne tajemnice. Cykada ma także innego bakteryjnego symbionta o nazwie Sulcia, który nie wykazuje żadnych oznak tej absurdalnej fragmentaryzacji. Jest tylko jedna Sulcia i jest taka sama we wszystkich komórkach cykady. Dlaczego ten mikrob pozostał w całości, podczas gdy jego sąsiad porozdzierał się? Nikt nie wie. Sensownym domysłem jest, że Hodgkinia ewoluuje dużo szybciej niż Sulcia i szybciej nabudowuje mutacje, które unieruchamiają jej geny.


A także, dlaczego Hodgkinia rozeszła się na wiele linii w cykadach, ale nie zrobiły tego inne symbionty w swoich gospodarzach? McCutcheon sądzi, że odpowiedź leży w długim życiu tych owadów. Większość pijących soki owadów ma szczęście, jeśli dożyje swoich pierwszych urodzin. Prowadzą krótkie, szybkie życie i jeśli ich symbionty nabywają szkodliwych mutacji, one i ich gospodarze padają ofiarą doboru naturalnego. W odróżnieniu od tego cykady żyją 2 do 19 lat i przez większość czasu ledwie się poruszają i niewiele rosną. Podczas tych powolnych lat ich symbionty nie są ważne i mają swobodę kumulowania szkodliwych mutacji, co nie wpływa na ich gospodarza ani nie podpada pod dobór naturalny – przynajmniej na krótką metę.


Długoterminowe perspektywy mogą nie być tak różowe. Partnerstwo z mikrobami często dostarcza zwierzętom niewiarygodnych i cennych sprawności – w tym wypadku, zdolności odżywiania się sokiem roślinnym bez niedoborów ważnych składników odżywczych. Ale wielka okazja niesie za sobą wielkie ryzyko. Kiedy gospodarz i bakteria stają się wzajem zależne od siebie, mogą wpaść w rodzaj pułapki symbiotycznej – lub, jak ujmuje to Nancy Moran, mogą wspólnie “spadać po spirali w norę króliczą”.


Weźmy Hodgkinia. Jeśli będzie dalej dzielić się na fragmenty i degenerować się, w końcu może być niezdolna do odżywiania cykady. “To wygląda, jakby wypadała z torów – mówi  McCutcheon. – To jak obserwowanie katastrofy kolejowej lub wypadku wymierania w zwolnionym tempie. Zmieniło to mój sposób myślenia o symbiozie”.


Źródło:
Campbell, Van Leuven, Meister, Carey, Simon, and McCutcheon. 2015. Genome expansion via lineage splitting and genome reduction in the cicada endosymbiont Hodgkinia. PNAS http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1421386112


The Slow Motion Symbiotic Train Wwreck of the 13-year Cicada

Not Exactly Rocket Science, 18 maja 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Ed Yong 


Mieszka w Londynie i pracuje w Cancer Research UK. Jego blog „Not Exactly Rocket Science” jest próbą zainteresowania nauką szerszej rzeszy czytelników poprzez unikanie żargonu i przystępną prezentację.
Strona www autora


Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1475 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Kameleon przekazuje różne informacje różnymi częściami ciała   Yong   2013-12-14
Paradoksalne cechy genetyki inteligencji   Ridley   2013-12-18
Wielki skandal z biopaliwami   Lomborg   2013-12-19
Przedwczesna wiadomość o śmierci samolubnego genu   Coyne   2013-12-22
Czy jest życie na Europie?   Ridley   2013-12-22
Nowa data udomowienia kotów: około 5300 lat temu – i to w Chinach   Coyne   2013-12-26
Na Zeusa, natura jest przeżarta rują i korupcją   Koraszewski   2013-12-26
Proces cywilizacji   Ridley   2013-12-28
Jak karakara wygrywa z osami   Cobb   2013-12-29
Żebropławy, czyli dziwactwa ewolucji   Coyne   2013-12-30
Czy może istnieć sztuka bez artysty?    Wadhawan   2013-12-30
Zderzenie mentalności   Koraszewski   2014-01-01
Skrzydlaci oszuści i straż obywatelska   Young   2014-01-02
Delfiny umyślnie narkotyzują się truciznami rozdymków   Coyne   2014-01-04
Długi cień anglosfery   Ridley   2014-01-05
Ciemna materia genetyki psychiatrycznej   Zimmer   2014-01-06
Co czyni nas ludźmi?   Dawkins   2014-01-07
Twoja choroba na szalce   Yong   2014-01-08
Czy mamut włochaty potrzebuje adwokata?   Zimmer   2014-01-09
Pradawne rośliny kwitnące znalezione w bursztynie   Coyne   2014-01-10
Ratując gatunek możesz go niechcący skazać   Yong   2014-01-11
Ewolucja ukryta w pełnym świetle   Zimmer   2014-01-13
Koniec humanistyki?   Coyne   2014-01-15
Jak poruszasz nogą, która kiedyś była płetwą?   Yong   2014-01-16
Jak wyszliśmy na ląd, kość za kością   Zimmer   2014-01-19
Twoja wewnętrzna mucha   Cobb   2014-01-22
Ukwiał żyje w antarktycznym lodzie!   Coyne   2014-01-25
Dlaczego poligamia zanika?   Ridley   2014-01-26
Wspólne pochodzenie sygnałów płodności   Cobb   2014-01-28
Ewolucja i Bóg   Coyne   2014-01-29
O delfinach, dużych mózgach i skokach logiki   Yong   2014-01-30
Dziennikarski „statek upiorów” Greg Mayer   Mayer   2014-01-31
Dlaczego leniwce wypróżniają się na ziemi?   Bruce Lyon   2014-02-02
Moda na kopanie nauki   Coyne   2014-02-03
Neandertalczycy: bliscy obcy   Zimmer   2014-02-05
O pochodzeniu dobra i zła   Coyne   2014-02-05
Sposób znajdowania genów choroby   Yong   2014-02-07
Czy humaniści boją się nauki?   Coyne   2014-02-07
Kiedy zróżnicowały się współczesne ssaki łożyskowe?   Mayer   2014-02-10
O przyjaznej samolubności   Koraszewski   2014-02-12
Skąd wiesz, że znalazłeś je wszystkie?   Zimmer   2014-02-15
Nauka odkrywa nową niewiedzę o przeszłości   Ridley   2014-02-18
Żyjące gniazdo?   Zimmer   2014-02-19
Planeta tykwy pospolitej   Zimmer   2014-02-21
Nowe niezwykłe skamieniałości typu “Łupki z Burgess”   Coyne   2014-02-22
Dziennik z Mozambiku: Pardalota   Naskręcki   2014-02-23
Wskrzeszona odpowiedź z kredy na “chorobę królów”   Yong   2014-02-26
Dziennik z Mozambiku: Sybilla     2014-03-01
Spojrzeć ślepym okiem   Yong   2014-03-02
Intelektualne danie dnia  The Big Think   Coyne   2014-03-04
Przeczołgać się przez mózg i nie zgubić się   Zimmer   2014-03-05
Gdzie podziewają się żółwiki podczas zgubionych lat?   Yong   2014-03-10
Supergen, który maluje kłamcę   Yong   2014-03-14
Idea, którą pora oddać na złom   Koraszewski   2014-03-15
Zwycięstwa bez chwały   Ridley   2014-03-17
Twarde jak skała   Naskręcki   2014-03-18
Pasożyty informacyjne   Zimmer   2014-03-19
Seymour Benzer: humor, historia i genetyka   Cobb   2014-03-21
Kto to był Per Brinck?   Naskręcki   2014-03-23
Potrafimy rozróżnić między przynajmniej bilionem zapachów   Yong   2014-03-25
Godzina Ziemi czyli o celebrowaniu ciemności   Lomborg   2014-03-27
Słonie słyszą więcej niż ludzie   Yong   2014-03-30
Niebo gwiaździste nade mną, małpa włochata we mnie   Koraszewski   2014-03-31
Wielkoskrzydłe   Naskręcki   2014-04-02
Najstarsze żyjące organizmy   Coyne   2014-04-03
Jak zmienić bakterie jelitowe w dziennikarzy   Yong   2014-04-06
Eureka! Sprytne wrony to odkryły   Coyne   2014-04-07
Sukces upraw GM w Indiach   Lomborg   2014-04-09
Wirus, który sterylizuje owady, ale je pobudza   Yong   2014-04-12
Przystosować się do zmiany klimatu   Ridley   2014-04-14
Jeden oddech, który zmienił planetę   Naskręcki   2014-04-16
Najgorsze w karmieniu komarów jest czekanie   Yong   2014-04-17
Kłopotliwa podróż w przyszłość   Ridley   2014-04-19
Pierwsze spojrzenie na mikroby współczesnych łowców zbieraczy     2014-04-23
Seksizm w nauce o jaskiniowych owadach   Coyne   2014-04-26
Musza bakteria zaprasza inne muszki na uczty owocowe   Yong   2014-04-27
Zachwycający rabuś, który liczy sto milionów lat   Cobb   2014-04-28
Mądrość (małych) tłumów   Zimmer   2014-04-29
Tak bada się ewolucję inteligencji u zwierząt   Yong   2014-05-02
Fantastyczna mimikra tropikalnego pnącza   Coyne   2014-05-03
Dlaczego większość zasobównie wyczerpuje się   Ridley   2014-05-04
Pomidory tworzą pestycydy z zapachu swoich sąsiadów   Yong   2014-05-07
Potrawy z pasożytów   Zimmer   2014-05-08
Technologia jest często matką nauki, a nie odwrotnie   Ridley   2014-05-09
Montezuma i jego flirty   Coyne   2014-05-11
Insekt dziedziczy mikroby z plemnika taty   Yong   2014-05-12
Polowanie na nietoperze   Naskręcki   2014-05-14
Zmień swoje geny przez zmianę swojego życia   Coyne   2014-05-15
Obrona śmieciowego DNA   Zimmer   2014-05-17
Gdzie są badania zwierzęcych wagin?   Yong   2014-05-20
Niemal ssaki   Naskręcki   2014-05-21
Zobaczyć jak splątane są gałęzie drzewa   Zimmer   2014-05-23
Dlaczego ramiona ośmiornicy nie plączą się   Yong   2014-05-24
Niezwykły pasikonik szklany   Naskręcki   2014-05-27
Wąż zgubiony i ponownie odnaleziony   Mayer   2014-05-28
Niespodziewani krewni mamutaków   Yong   2014-05-30
Trochę lepszy  świat   Ridley   2014-05-31
Tam, gdzie są ptaki   Mayer   2014-06-01
Ewolucja, ptaki i kwiaty   Coyne   2014-06-02
Jestem spełniony   Naskręcki   2014-06-04

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk