Prawda

Niedziela, 12 maja 2024 - 22:51

« Poprzedni Następny »


Symbiotyczna katastrofa długoletniej cykady


Ed Yong 2015-06-02


Mniej więcej teraz w rozmaitych stanach USA, olbrzymie roje cykad zaczynają gramolić się z ziemi. Te owady o czarnym ciele i czerwonych oczach pozostawały pod ziemią przez 13 lub 17 lat, pijąc soki z korzeni drzew. Kiedy po raz pierwszy stykają się ze światłem dziennym, poświęcają się tygodniom gorączkowego seksu i kakofonicznej pieśni, potem masowo umierają. Podziobią je ptaki, dorwą wiewiórki, rozgniotą buty i opony, ale nic z tego nie naruszy ich astronomicznej liczebności – i, być może, o to chodzi w ich długich pobytach pod ziemią i równoczesnym wyłonieniu się.

Dziwaczny styl życia cykady pozostawił ją także z innym dziedzictwem. Chodzi o bakterię, która żyje w ich ciałach i jest tak dziwaczna, że kiedy John McCutcheonodkrył ją po raz pierwszy, sądził, że popełnił jakiś błąd techniczny.


Wiele owadów gości w swoich komórkach bakterie. Te „endosymbionty” są szczególnie częste wśród ożywiających się sokiem drzewnym owadów, takich jak cykady, i pomagają gospodarzom na tworzenie składników odżywczych, których nie mogą otrzymać ze swojego pokarmu. Niemal zawsze mają wyjątkowo małe genomy. Kiedy osiądą wewnątrz komórki owada, zostają izolowane od innych bakterii i ograniczone do małych populacji. Pozbawia je to możliwości tasowania lub nabywania genów i pozwala na nabudowanie się szkodliwych mutacji w ich DNA. Jeden po drugim ich geny rozłamują się i znikają, pozostawiając je ze skurczonymi, minimalnymi genomami.


McCutcheon jest jednym z niewielkiej grupy naukowców, którzy przez ostatnich 15 lat odszyfrowywali dziwaczne genomy wielu symbiontów owadzich. Kiedy rozpoczął pracę we własnym laboratorium na University of Montana, postanowił przyjrzeć się Magicicada tredicim – jednemu z 13-letnich gatunków cykady. Zrobił to, co robi się zazwyczaj: dokonał sekcji narządów, w których żyją bakterie, wydobył ich DNA, pociął je na fragmenty, zsekwencjonował odcinki i użył komputera, żeby zestawić te porcje w spójną całość.


Tylko że to nie działało. Sekwencje po prostu nie chciały ułożyć się elegancko. Wyglądało to, jakby ktoś wziął kilka podobnych, ale niepełnych układanek i wymieszał wszystkie kawałki razem. „To był taki bałagan – opowiada. – Myślałem, że coś poszło nie tak technicznie, ale nie umiałem zrozumieć, co”.


Skonsternowany przeszedł do innej cykady – południowoamerykańskiego gatunku o nazwie Tettigades undata. Znalazł tam jeszcze więcej dziwaczności. Zawierała ona bakterię o nazwie Hodgkinia, która jakoś rozdzieliła się na dwa odrębne gatunki wewnątrz swojego owadziego gospodarza. Jak pisałem w zeszłym roku, te gatunki potomne były jak dwie połówki swojego przodka. Każda straciła inne geny, więc indywidualnie każda jest bladym cieniem oryginalnej Hodgkinia, ale razem wzięte doskonale się uzupełniają.


Kiedy McCutcheon zrozumiał, co dzieje się w T.undata, nagle zrozumiał również, co dzieje się w 13-letniej cykadzie. Ona także zawierała symbionty Hodgkinia, które rozdzieliły się na odrębne linie rodowe – i to nie tylko dwie.


Doktoranci Matthew Campbell i James Van Leuven pokazali w końcu, że DNA z symbiontów cykady tworzy co najmniej 17 odrębnych kręgów. Nie jest jasne, czy każdy z nich przedstawia chromosom Hodgkinia, czy też cały własny genom Hodgkinia, ale przynajmniej cztery z nich znajdują się w różnych komórkach. Można zobaczyć to na ilustracji poniżej, gdzie kropki niebieskie, zielone, fioletowe i pomarańczowe reprezentują komórki, które mają tylko jeden z tych 17 kręgów.



Podobnie jak we wcześniejszym odkryciu, te kręgi uzupełniają się wzajemnie; dzielą zestawy genów do tworzenia składników odżywczych, które ważne są dla gospodarza, ale żaden z nich nie ma pełnego zestawu. Znajdują się także u innych gatunków cykad wieloletnich. I są, być może, tylko czubkiem góry lodowej: zespół z pewnością zidentyfikował 17 kręgów, ale prawdopodobnie owady mają ich więcej. „Gdybym miał zgadywać, powiedziałbym, że jest ich między 20 a 50 – mówi McCutcheon. – To niewiarygodne. To bałagan”.


Z punktu widzenia Hodginia jedna linia wyraźnie rozdzieliła się na kilka i jest to nieodwracalne. „To jest podstawowa definicja specjacji – mówi McCutcheon. – Dzieje się to w populacji bezpłciowej, ale linia jest rozłamana i nie powraca”. Jeśli jednak spojrzeć na to z punktu widzenia cykady, kolektywne symbionty nadal robią to samo, co oryginał. I chociaż porozdzielały swoje geny do oddzielnych komórek, cała ilość bakteryjnego DNA wzrosła. Każda część zmalała, ale kolektywnie ich genom powiększył się.


Czy więc kręgi Hodgkinia są różnymi gatunkami lub liniami? Czy genomem Hodgkinia jest suma kręgów w jednej cykadzie, czy też każda odrębna linia ma własny genom? Naprawdę trudno powiedzieć. „Problem polega na tym, że kiedy piszemy artykuł, musimy użyć słów, a słowa coś znaczą – mówi McCutcheon. – Jest bardzo trudno ponaklejać etykietki na to wszystko, a nie dam po prostu nowych nazw jak popadnie, bo nie sądzę, byśmy to wystarczająco dobrze rozumieli”.


Są tam także inne tajemnice. Cykada ma także innego bakteryjnego symbionta o nazwie Sulcia, który nie wykazuje żadnych oznak tej absurdalnej fragmentaryzacji. Jest tylko jedna Sulcia i jest taka sama we wszystkich komórkach cykady. Dlaczego ten mikrob pozostał w całości, podczas gdy jego sąsiad porozdzierał się? Nikt nie wie. Sensownym domysłem jest, że Hodgkinia ewoluuje dużo szybciej niż Sulcia i szybciej nabudowuje mutacje, które unieruchamiają jej geny.


A także, dlaczego Hodgkinia rozeszła się na wiele linii w cykadach, ale nie zrobiły tego inne symbionty w swoich gospodarzach? McCutcheon sądzi, że odpowiedź leży w długim życiu tych owadów. Większość pijących soki owadów ma szczęście, jeśli dożyje swoich pierwszych urodzin. Prowadzą krótkie, szybkie życie i jeśli ich symbionty nabywają szkodliwych mutacji, one i ich gospodarze padają ofiarą doboru naturalnego. W odróżnieniu od tego cykady żyją 2 do 19 lat i przez większość czasu ledwie się poruszają i niewiele rosną. Podczas tych powolnych lat ich symbionty nie są ważne i mają swobodę kumulowania szkodliwych mutacji, co nie wpływa na ich gospodarza ani nie podpada pod dobór naturalny – przynajmniej na krótką metę.


Długoterminowe perspektywy mogą nie być tak różowe. Partnerstwo z mikrobami często dostarcza zwierzętom niewiarygodnych i cennych sprawności – w tym wypadku, zdolności odżywiania się sokiem roślinnym bez niedoborów ważnych składników odżywczych. Ale wielka okazja niesie za sobą wielkie ryzyko. Kiedy gospodarz i bakteria stają się wzajem zależne od siebie, mogą wpaść w rodzaj pułapki symbiotycznej – lub, jak ujmuje to Nancy Moran, mogą wspólnie “spadać po spirali w norę króliczą”.


Weźmy Hodgkinia. Jeśli będzie dalej dzielić się na fragmenty i degenerować się, w końcu może być niezdolna do odżywiania cykady. “To wygląda, jakby wypadała z torów – mówi  McCutcheon. – To jak obserwowanie katastrofy kolejowej lub wypadku wymierania w zwolnionym tempie. Zmieniło to mój sposób myślenia o symbiozie”.


Źródło:
Campbell, Van Leuven, Meister, Carey, Simon, and McCutcheon. 2015. Genome expansion via lineage splitting and genome reduction in the cicada endosymbiont Hodgkinia. PNAS http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1421386112


The Slow Motion Symbiotic Train Wwreck of the 13-year Cicada

Not Exactly Rocket Science, 18 maja 2015

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Ed Yong 


Mieszka w Londynie i pracuje w Cancer Research UK. Jego blog „Not Exactly Rocket Science” jest próbą zainteresowania nauką szerszej rzeszy czytelników poprzez unikanie żargonu i przystępną prezentację.
Strona www autora


Skomentuj Tipsa en vn Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1478 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Tajemnice życia płodowego   Zimmer   2014-06-07
Czy ludzkość zmierza w kierunku kanibalizmu?   Lomborg   2014-06-09
Milczenie świerszczy   Yong   2014-06-11
Maccartyzm w klimatologii   Lomborg   2014-06-12
Życie w powiększeniu   Zimmer   2014-06-13
Pół miliarda lat samobójstw   Yong   2014-06-14
Amfisbeny   Naskręcki   2014-06-16
Pająk upodabnia się do ptasich odchodów   Coyne   2014-06-17
Tajemny składnik młodej krwi: oksytocyna?   Zimmer   2014-06-18
Architektura żywych budowli   Yong   2014-06-20
Krótko żyjące zwierzęta i bardzo stare rośliny   Zimmer   2014-06-21
Pająki społeczne wybierają swoje kariery   Yong   2014-06-23
Skrzydlata rzeka   Zimmer   2014-06-25
Dziwaczne, wysysające krew czerwie jurajskie   Cobb   2014-06-28
Zaproszenie na wspólne polowanie   Yong   2014-06-30
Marnie napisany artykuł o uroczym gryzoniu   Coyne   2014-07-03
Jak przypadek pomógł znaleźć sposób na suszę   Klein Leichman   2014-07-04
Przespać atak antybiotyku   Yong   2014-07-06
Uprawy GM są dobre dla środowiska     2014-07-08
Trawa w uchu. Ale po co?   Coyne   2014-07-09
Zoo w gębie   Zimmer   2014-07-10
Suplementem diety wampira   Yong   2014-07-11
Seks z wymarłym ludem dał gen życia na wysokości   Yong   2014-07-15
Lot przez przestrzeń wewnętrzną   Zimmer   2014-07-17
Osa, która zatyka wejście do gniazda trupami mrówek   Yong   2014-07-18
Czym jest nauka i dlaczego ma nas obchodzić?   Sokal   2014-07-22
Nowy, opierzony i czteroskrzydły dinosaur   Coyne   2014-07-23
Oglądanie oceanu brzęczącym nosem   Zimmer   2014-07-26
OLBRZYMI owad wodny (i kilka innych)   Coyne   2014-07-28
Najbardziej zdumiewające oczy w przyrodzie   Yong   2014-07-29
Czy jaszczurka “widzi” skórą   Yong   2014-08-02
Nowy opierzony dinozaur sugeruje, że większość dinozaurów miała pióra   Coyne   2014-08-03
Ewolucja łożyska a seksualna zimna wojna   Yong   2014-08-04
Energia odnawialna nie działa   Ridley   2014-08-07
Czy istnieje darwinowskie wyjaśnienie ludzkiej kreatywności?   Dennett   2014-08-08
Gry zespołowe plemników   Yong   2014-08-09
Oko ciemieniowe hatterii   Mayer   2014-08-10
Osobisty mikrobiom w cyfrach   Zimmer   2014-08-14
Izraelska koszulka EKG monitoruje serca, ratuje życie   Shamah   2014-08-17
Grantowie na Galápagos i ich hybrydowe gatunki   Coyne   2014-08-18
Ośmiornica dba o swoje jaja przez 53 miesiące, a potem umiera   Yong   2014-08-20
Cuda genetyki: arbuz bez pestek   Coyne   2014-08-25
Utracony sposób tworzenia ciał przed istnieniem  szkieletów i muszli   Yong   2014-08-26
Usunięcie obrzydzenia z medycyny mikrobiomowej   Zimmer   2014-08-28
Tysiąc współpracujących, samorganizujących się robotów   Yong   2014-08-30
Nogoprządki   Naskręcki   2014-09-01
Drzewo zapachów   Zimmer   2014-09-02
Sposób szczura na trujący pokarm   Yong   2014-09-05
Raczkowanie w ewolucji   Zimmer   2014-09-06
Zmieniająca kolor płachta zainspirowana skórą ośmiornicy   Yong   2014-09-08
Erotyczna doniosłość bioder walenia   Zimmer   2014-09-11
Co słychać w sprawie globalnego ocieplenia?   Ridley   2014-09-14
Foki mogły przenieść gruźlicę do Nowego Świata   Yong   2014-09-16
Jak kolibry odzyskały utracone przez ptaki odczuwanie słodyczy   Yong   2014-09-19
Ochrona zagrożonych węży wymaga ochrony węży jadowitych   Yong   2014-09-22
Uo, zaklinacz deszczu   Naskręcki   2014-09-23
Co wypadające dyski mówią nam o 700 milionach lat ewolucji   Zimmer   2014-09-24
O korzyściach przypadkowego kolekcjonowania okazów   Naskręcki   2014-09-28
Pradawnym płazom odrastały kończyny   Coyne   2014-09-29
Trawienny drapacz chmur   Yong   2014-09-30
Ofiary naszych ułomności   Naskręcki   2014-10-02
Jak dotarliśmy do teraźniejszości   Ridley   2014-10-05
Dlaczego kod genetyczny nie jest uniwersalny   Cobb   2014-10-06
Ukryte przed wzrokiem zoo w Central Park   Zimmer   2014-10-09
Specjacja sympatryczna we wnętrzu cykady   Yong   2014-10-10
Nocny stukot małych kopyt   Naskręcki   2014-10-12
Wojna domowa w ludzkim genomie     2014-10-13
Penetrujący jaskinie robot-wąż wzorowany na grzechotnikach rogatych   Yong   2014-10-19
Dowody ewolucji: wideo i nieco dłuższy wywód   Coyne   2014-10-22
O wyższości lepszego nad gorszym   Zimmer   2014-10-26
Powódź pożyczonych genów u powstania maleńkich ekstremistów   Yong   2014-10-30
Tak, neandertalczycy to my!   Mayer   2014-11-04
Zgarbowate   Naskręcki   2014-11-10
Facet od nauki przeciwko GMO   Coyne   2014-11-12
Figę dostaje ten kto rano wstaje   Yong   2014-11-13
Mrówki, altruizm i poświęcenie   Ridley   2014-11-14
Norowirus: doskonały patogen wyłania się z cienia   Zimmer   2014-11-15
Siedem narzędzi myślenia   Dennett   2014-11-19
Ciężarna wężyca przygotowuje się do macierzyństwa   Yong   2014-11-20
Naturalność życia rodzinnego?   Zimmer   2014-11-25
Genetyka kocich łat   Coyne   2014-11-26
Świat RNA   Cobb   2014-11-27
Dymorfizm płciowy i ideologia   Coyne   2014-12-01
Gdy mutację przeciwstawić infekcji – od anemii sierpowatej do Eboli   Lewis   2014-12-02
Nasze wewnętrzne pióra   Zimmer   2014-12-03
Nie wszystkie muchy latają   Naskręcki   2014-12-04
Jest tuż za tobą! Czy to duch, czy robot?   Yong   2014-12-06
Najstarsza jak dotąd identyfikacja medycyny sądowej   Coyne   2014-12-10
Samoloty bez pilotów i samochody bez kierowców   Ridley   2014-12-11
Tworzenie dowodów w oparciu o politykę   Ridley   2014-12-16
Pisklę przypominające wyglądem i zachowaniem trującą gąsienicę   Coyne   2014-12-18
Wierzący nagradzani za życia   Coyne   2014-12-21
Nietoperze owocożerne także mają sonar (ale niezbyt dobry)   Yong   2014-12-22
Implanty WiFi do mózgu dla rąk robota   Zimmer   2014-12-25
Naukowcy wprowadzają nową tradycję kulturową dzikim sikorkom   Yong   2014-12-26
List do władz Uniwersytetu  Harvarda   Pinker   2014-12-26
Dlaczego zwierzęta są urocze?   Coyne   2014-12-30
Dlaczego te dziwaczne owady sygnalizują ostrzeżenie po ataku?   Yong   2014-12-31
Leniwce i pancerniki widzą czarno-biały świat   Yong   2015-01-06
Ogony CAT osłabiają centralny dogmat – dlaczego ma to znaczenie i dlaczego nie ma   Cobb   2015-01-08

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Lekarze bez Granic


Wojna w Ukrainie


Krytycy Izraela


Walka z malarią


Przedwyborcza kampania


Nowy ateizm


Rzeczywiste łamanie


Jest lepiej


Aburd


Rasy - konstrukt


Zielone energie


Zmiana klimatu


Pogrzebać złudzenia Oslo


Kilka poważnych...


Przeciwko autentyczności


Nowy ateizm


Lomborg


„Choroba” przywrócona przez Putina


„Przebudzeni”


Pod sztandarem


Wielki przekret


Łamanie praw człowieka


Jason Hill


Dlaczego BIden


Korzenie kryzysu energetycznego



Obietnica



Pytanie bez odpowiedzi



Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Małgorzata, Andrzej, Henryk