Prawda

Sobota, 24 lipca 2021 - 09:48

« Poprzedni Następny »


Nowy raport: Bakteria po stu milionach lat nadal żywa!


Jerry A. Coyne 2020-08-08


Osłupiałem. Nowy raport w piśmie “Nature Communications” pokazuje, że pewne bakterie mogą pozostawać w uśpieniu przez ponad 100 milionów lat w osadach morskich – niewiarygodna ilość czasu, by organizm pozostał “żywy” – jeśli można to nazwać “żywym”. Ja to robię: w końcu, zebrane i ożywione przez badaczy bakterie zachowały zdolność przemiany materii, pobierania organicznych substancji i rozmnażania się. Uśpienie, przynajmniej dla mnie, nie jest tym samym, co “śmierć”.


Kliknij na link pod zrzutem z ekranu, żeby przeczytać artykuł (pdf jest tutaj).




https://www.nature.com/articles/s41467-020-17330-1


Eksperyment był pracochłonny, ale wyniki są proste. Jeśli chcesz poznać wszystkie drastyczne szczegóły, artykuł jest dostępny.


W skrócie, autorzy pobrali próbki gliniastych osadów w różnym wieku z Kręgu Południowego Pacyfiku i zapewniają, że zrobili to w taki sposób, by wykluczyć zanieczyszczenie nowoczesnymi bakteriami. Wspierając swoje twierdzenie tym, że bakterie, które znaleźli wewnątrz rdzeni pobranych z dna morskiego, były rzeczywiście bakteriami in situ, argumentowali, że glina jest niemal nieprzepuszczalna dla bakterii, z bardzo małymi porami, a ponad pobranymi osadami była gruba, nieprzepuszczalna warstwa. I mieli bardzo rygorystyczne środki ostrożności, by zapobiec zanieczyszczeniu.  


Aby zobaczyć, czy jakieś bakterie w osadach są zdolne do biologicznej aktywności włącznie z reprodukcją, testowali “anabolizm” (syntezę cząsteczek) przez trzymanie bakterii z tlenem (bakteriom kontrolnym nie dano tlenu), jak też z radioaktywnie oznakowanymi cząsteczkami, które można było pobrać i zamienić w białka i inne cząsteczki. Dodane cząsteczki obejmowały 13C6-glukozy, 13C2-octanu, 13C3-kwasu pirogronowego, 13C-dwuwęglanu, 13C-15N-mieszanki aminokwasów [mieszanka 20 aminokwasów] i 15N-amonu. Inną kontrolą było zabijanie bakterii formaldehydem. Badacze mogli wtedy zobaczyć przez mikroskop fluorescencyjny i radioaktywną wizualizację, czy prekursorowe cząsteczki zostały pobrane przez bakterie.  


Wreszcie, badacze mogli izolować bakterie w różnych momentach czasowych (próbki sprawdzające aktywność, wzrost i obecność bakteryjną pobrano w trzecim i szóstym tygodniu oraz po 18 miesiącach), żeby zobaczyć, czy wzrasta bakteryjne miano, tj., czy się dzielą. Na koniec autorzy wyizolowali RNA (16S rRNA) z indywidualnych bakterii, namnożyli, zsekwencjonowali powoli ewoluujący RNA i zobaczyli, do jakich grup żyjących bakterii należały te prastare bakterie. (To zakłada, że nadal możemy rozpoznać grupy z nowoczesnych sekwencji, ale te cząsteczki ewoluują bardzo powoli.)


Wyniki:

1.) Aerobowe bakterie (bakterie, które potrzebują tlenu) nadal były zdolne do życia, rozpoczynając metabolizm i reprodukcję nawet, kiedy pochodził z osadów w wieku 101,5 milionów lat. Anaerobowym bakteriom, które nie potrzebują tlenu, nie poszło nawet w przybliżeniu tak dobrze i autorzy sądzą, że także niskie koncentracje tlenu w osadach przez czas geologiczny po prostu zabijają anaerobowe bakterie.


Tutaj jest ilustracja z artykułu, która pokazuje zdjęcia bakterii, z tymi samymi bakteriami badanymi następnie na pobór dodanych cząsteczek. Podpis jest skomplikowany, ale możecie zobaczyć, że szczególnie z dodanymi aminokwasami (i tlenem) komórki świecą się intensywnie (d i h są obrazami z mikroskopu elektronowego tych samych bakterii, pokazanych jako świecące w rzędach).


(from paper): Cells from incubations of U1365 9H-3 with 13C-bicarbonate and 15N ammonium (a–d) and 13C,15N-Amino acid mix (e–h). (a, e) SYBR Green I-stained cells under fluorescence microscopy. b, c, f, g Ratio images of 13C/12C (b, f) and 12C15N/12C14N ratios (c, g) of the same regions imaged in a, e, demonstrating locations of 13C and 15N incorporation. Color-scale ranges of the ratios are shown as numbers appearing at top and bottom of the color bar. The background membrane region, which is identified by fluorescence images, is excluded from the ratio calculation and shown as black background. d, h. Secondary electron (NanoSIMS) images of the same regions in a, e. Bars represent 5 µm. Similar images were processed for obtaining the dataset (Supplementary Data 1) of substrate incorporations for 6986 individual cells. 

(from paper): Cells from incubations of U1365 9H-3 with 13C-bicarbonate and 15N ammonium (a–d) and 13C,15N-Amino acid mix (e–h). (a, e) SYBR Green I-stained cells under fluorescence microscopy. b, c, f, g Ratio images of 13C/12C (b, f) and 12C15N/12C14N ratios (c, g) of the same regions imaged in a, e, demonstrating locations of 13C and 15N incorporation. Color-scale ranges of the ratios are shown as numbers appearing at top and bottom of the color bar. The background membrane region, which is identified by fluorescence images, is excluded from the ratio calculation and shown as black background. d, h. Secondary electron (NanoSIMS) images of the same regions in a, e. Bars represent 5 µm. Similar images were processed for obtaining the dataset (Supplementary Data 1) of substrate incorporations for 6986 individual cells.

 


2.) Bakterie dzieliły się, co mierzono wzrostem ich liczby w próbach w miarę upływu czasu.


3.) Było znacznie trudniej znaleźć metabolizująca anaerobowe bakterie niż aerobowe.
Te pierwsze były praktycznie martwe.


4.) Linie rodowe bakterii zidentyfikowanych w osadach
, sądzone na podstawie sekwencjonowania ich i porównania 16S rRNA do nowoczesnych próbek, obejmują Actinobacteria,  Bacteroidetes,  Firmicutes,  Alphaproteobacteria,  Betaproteobacteria,  GammaproteobacteriaDeltaproteobacteria, oraz sinice (“cyjanobakterie”). Byłoby ciekawe porównanie sekwencji tych wczesnych gatunków z ich nowoczesnymi krewnymi, żeby zobaczyć dokładnie, ile i jakiego rodzaju zachodziło ewolucji.  


5.) Jak przeżyły?
 Jedną hipotezą było, że przetrwały jako uśpione spory, co może trwać długo u bakterii. Wykluczono jednak tę możliwość, ponieważ żadna zidentyfikowana bakteria nie pochodziła z linii tworzących spory. Wydaje się, że bakterie po prostu przeszły w stan uśpienia, przeżywając bez żadnego – lub niemal żadnego – dającego się wykryć metabolizmu i bez rozmnażania się. 


To nasuwa pytanie: czy te rzeczy rzeczywiście były żywe 101,5 milionów lat temu? Nie widzę, dlaczego nie miałyby być, chyba że uważa się coś, co wchodzi w stan uśpienia, za martwe, a potem, jak Łazarz, zmartwychwstaje, kiedy uśpienie zostaje przełamane. Jeśli ufamy autorom, że podjęli wystarczające środki ostrożności, by zapobiec zanieczyszczeniu współczesnymi bakteriami, to mamy tutaj najstarsze żywe organizmy na Ziemi.  


h/t: Jeremy

_________________

Morono, Y., Ito, M., Hoshino, T. et al. Aerobic microbial life persists in oxic marine sediment as old as 101.5 million yearsNat Commun 11, 3626 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17330-1


New report: Bacteria can remain alive for over 100 million years!

Why Evolution Is True, 30 lipca 2020

Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska



Jerry A. Coyne

Emerytowany profesor na wydziale ekologii i ewolucji University of Chicago, jego książka "Why Evolution is True" (Polskie wydanie: "Ewolucja jest faktem", Prószyński i Ska, 2009r.) została przełożona na kilkanaście języków, a przez Richarda Dawkinsa jest oceniana jako najlepsza książka o ewolucji.  Jerry Coyne jest jednym z najlepszych na świecie specjalistów od specjacji, rozdzielania się gatunków. Jest również jednym ze znanych "nowych ateistów" i autorem książki "Faith vs Fakt". Jest wielkim miłośnikiem kotów i osobistym przyjacielem redaktor naczelnej.
 

Skomentuj     Wyślij artykuł do znajomego:     Wydrukuj






Nauka

Znalezionych 1220 artykuły.

Tytuł   Autor   Opublikowany

Nieuchwytny neuron babci   Novella   2021-07-22
Cierpienie i pytanie, czy przestaniemy jeść mięso   Koraszewski   2021-07-14
Czy nadchodzi hydroponika?   Novella   2021-07-13
Raport Unii Europejskiej o glifosacie   Novella   2021-07-10
Dlaczego ideologii nie należy mieszać z nauką   Coyne   2021-06-30
Nagonka na Izrael grasuje w stowarzyszeniach nauk ścisłych, medycyny i edukacji   Chesler   2021-06-24
Szczęśliwi pracoholicy   Witkowski   2021-06-03
Propaganda w wykonaniu nauczycieli akademickich   Chesler   2021-06-02
Ewolucja wielokomórkowości   Novella   2021-05-07
Polityczna polaryzacja jest przesadzona   Novella   2021-05-04
Wrotki były kiedyś sztandarową grupą istot bez seksu, a teraz sądzi się, że ukradkiem odstawiają szybkie numerki   Coyne   2021-04-22
Błędna historia antykolonializmu   Tupy   2021-04-21
Mayflower wyrusza w podróż raz jeszcze   Koraszewski   2021-04-19
Genetyczny przełącznik CRISPR   Novella   2021-04-16
Wielkie zdarzenie oksydacyjne   Novela   2021-04-09
Kiedy panika klimatyczna zlewa się z kulturą anulowania   Lomborg   2021-04-06
Czy wykształceni ludzie są bardziej antysemiccy?   Albert Cheng i Ian Kingsbury   2021-04-05
Nieoczekiwana historia i cudowny sukces szczepionek   Ridley   2021-03-31
Innowacja jest geograficznie zlokalizowanym i chwilowym zjawiskiem   Ridley   2021-03-29
Czy gąbki są najbliższymi krewnymi pozostałych zwierząt?   Coyne   2021-03-26
Kilka lekcji z rosyjskiej rewolucji. Jak kuszący radykalny nihilizm prowadzi do ekstremizmu   Geifman   2021-03-22
Wracamy do raju?   Łukaszewski   2021-03-18
Ślimakowi morskiemu odrasta tułów z odciętej głowy, czyli “autotomia z kleptoplastią”   Coyne   2021-03-15
Ewolucyjne korzyści udawania ofiary   Clark   2021-03-11
Ludzie i wymieranie megafauny   Novella   2021-03-10
Banany edytowane przez CRISPR   Novella   2021-03-02
Nikczemne grzyby naśladują kwiaty trawy, by ułatwić własne rozmnażanie się   Coyne   2021-02-26
Co zabiło megafaunę Ameryki Północnej?   Novella   2021-02-25
Stresy i nowe szczepy wirusa   Ridley   2021-02-12
EWOLUCJA wirusa Covid-19   Coyne   2021-02-10
Czy „toksyczna kobiecość” jest główną przyczyną bojów o społeczną sprawiedliwość?   Coyne   2021-02-08
Najmniejszy gad (i owodniowiec) świata: BARDZO mały kameleon   Coyne   2021-02-05
Dlaczego kocimiętka i matatabi doprowadzają koty do szaleństwa? Grupa badaczy mówi, że te rośliny mogą chronić je przed komarami   Coyne   2021-02-02
Bądźcie sceptyczni wobec wideo pokazujących “skutki uboczne” szczepionki   Novella   2021-01-28
Szaleństwo odnawialnej energii   Ridley   2021-01-23
Głębia ludzkiej historii   Novella   2021-01-19
Dlaczego szczepionki mRNA mogą zrewolucjonizować medycynę?   Ridley   2021-01-02
Szczepionka mRNA na koronawirusa: świadectwo ludzkiej pomysłowości i mocy nauki   Coyne   2021-01-01
Dziwaczny rodzaj rasistowskiego patriarchatu   Arora   2020-12-31
Centrala muszek owocowych: Bloomington Drosophila Stock Center   Coyne   2020-12-29
Pierwszy raport o używaniu narzędzi przez pszczoły: rodzimy gatunek używa grudek łajna, by odeprzeć drapieżne szerszenie   Coyne   2020-12-23
Nie – żadne chi nie istnieje   Novella   2020-12-21
Moc nauki dostarczyła najlepszej możliwej wiadomości w tym koszmarnym roku   Ridley   2020-12-18
Szczątkowa cecha ptaków, która mogła być funkcjonalna u przodków: zdalne wyczuwanie drgań dziobem (nadal czynne u kiwi)   Coyne   2020-12-16
Paradoks wielce niedoskonałego dobra   Koraszewski   2020-12-11
Nasiona roślin ewoluują, by upodobnić się odchodów antylopy, a oszukane żuki gnojowe odtaczają i zagrzebują nasiona   Coyne   2020-12-10
AI – asystent lekarza   Novella   2020-12-09
Czy problem zwijania białka został rozwiązany?   Coyne   2020-12-05
„Gryzoń skunksowy”, który żuje trujące rośliny i wypluwa truciznę na swoje futro   Coyne   2020-12-02
Intensywne zbieranie leczniczej rośliny przez ludzi prowadzi do ewolucji nowych kolorów liści i kwiatów   Coyne   2020-11-28
Jak ewoluuuje altruizm?   Coyne   2020-11-25
Filozof zainfekowany efektem potwierdzenia wyjaśnia, dlaczego ewolucja dowodzi Boga   Coyne   2020-11-23
Według nowych badań są cztery gatunki pingwinów białobrewych, a nie tylko jeden   Coyne   2020-11-19
Gra w łajdactwo, by zrozumieć łajdaków   Novella   2020-11-18
Ewolucja psów   Novella   2020-11-09
Genomowa i ewolucyjna analiza wymarłego kota szablozębnego   Coyne   2020-10-31
Zakład Simon-Ehrlich po 40 latach   Gale L. Pooley   2020-10-23
Używające narzędzi mrówki budują struktury, by spijać roztwór cukru w pojemnikach, nie topiąc się   Coyne   2020-10-22
Czego pandemia nauczyła nas o nauce?   Ridley   2020-10-19
Przeddarwinowscy “darwiniści”   Berry   2020-10-16
Covid 19 może przejmować kontrolę nad receptorami bólu, uśmierzając ból i podnosząc szerzenie się choroby: możliwy rezultat doboru naturalnego   Coyne   2020-10-15
Znowu wrzawa, że “teoria ewolucji wywrócona”, ale jak zwykle, robią z igły widły   Coyne   2020-10-13
Intelektualna pustka numeru “New Scientist” o ewolucji: 4. Rzekome znaczenie dryfu genetycznego w ewolucji   Coyne   2020-10-09
Chromosomy Y ludzi, neandertalczyków i denisowian   Novella   2020-10-08
Intelektualna pustka numeru “New Scientist” o ewolucji: 3. Rzekome znaczenie epigenetyki w ewolucji   Coyne   2020-10-07
Intelektualna pustka numeru “New Scientist” o ewolucji: 2. Rzekome nieistnienie gatunków   Coyne   2020-10-05
Intelektualna pustka numeru “New Scientist” o ewolucji: 1. Genetyczna plastyczność    Coyne   2020-10-03
“New Scientist”: Darwin jednak miał rację    Coyne   2020-10-01
Uprawy GMO i wzrost plonów   Novella   2020-09-28
Książka o psychologii ewolucyjnej, która pokazuje wartość tej dziedziny – ale nie wartość memów   Coyne   2020-09-22
Przyjemności seksu i jagód   Ridley   2020-09-18
Czy można falsyfikować naukowe teorie? Naukowiec odpowiada, że “nie”   Coyne   2020-09-12
Naukowe pismo “Nature” przystaje do Przebudzonych twierdząc, że zarówno płeć, jak gender są niebinarne   Coyne   2020-09-09
Wybór ostatecznej wolności   Witkowski   2020-09-07
Polio zlikwidowane w Afryce   Novella   2020-09-05
Czy wyrazy ludzkiej twarzy są uniwersalne w okazywaniu emocji?   Coyne   2020-09-02
Barwny erudyta J.B.S. Haldane   Coyne   2020-08-28
Modelowanie zbijania się pingwinów cesarskich w gromadę: każdy dostaje równie dużo ciepła   Coyne   2020-08-25
Jak algorytmy wpływają na twoje życie   Novella   2020-08-24
Z okazji dziewięćdziesiątych urodzin Thomasa Sowella   Jacoby   2020-08-22
Prawdziwie długa szyja: 6-metrowy wodny gad z triasu z szyją długości 2,7 metra   Coyne   2020-08-19
Wątrobiane duszki   Novella   2020-08-17
Rozrzedzanie krwi bez groźby krwawienia   Novella   2020-08-14
Nowy raport: Bakteria po stu milionach lat nadal żywa!   Coyne   2020-08-08
Modlitwa to nie jest lekarstwo   Nowella   2020-08-07
Maleńki, 10-centymetrowy dinosaur, który zjadał owady   Coyne   2020-08-06
Piękny skoczek, który upodabnia się do mrówki   Coyne   2020-08-03
Urodziny Rosalind Franklin!   Cobb   2020-07-31
Kondor wielki: ptak, który rzadko kiedy macha skrzydłami   Coyne   2020-07-28
Czy ludzie byli w Nowym Świecie ponad 30 tysięcy lat temu?   Coyne   2020-07-26
Oszaleć na punkcie nietoperzy w czasach korony i politykierstwa   Collins   2020-07-25
Dwa gatunki dały zdolną do życia hybrydę, mimo że rozeszły się 150 milionów lat temu   Coyne   2020-07-23
Niccolo Tartaglia jego tajemnica   Jacoby   2020-07-20
Akcja afirmatywna w wieloetnicznym narodzie   Hyams   2020-07-17
Dekolonizacja ewolucji (i Darwina) była nieunikniona   Coyne   2020-07-15
Filtr mózgu (czyli czego nie widzimy)   Novella   2020-07-14
Homeopatia jest bezwartościowa a czasami szkodliwa   Novella   2020-07-10
Pięć błędnych wyobrażeń o ewolucji: jedno jest wątpliwe, jedno niesłuszne   Coyne   2020-07-08
Wiecznie kurczący się tranzystor i wynalezienie Google   Ridley   2020-07-06
Postmodernizm: filozofia, która stoi za naszymi wojnami kulturowymi i postępującym nihilizmem   Hill   2020-07-02

« Poprzednia strona  Następna strona »
Polecane
artykuły

Bohaterzy chińskiego narodu



Naukowcy Unii Europejskiej



Teoria Rasy



Przekupieni



Heretycki impuls



Nie klanial



Cervantes



Wojaki Chrystusa



 Palestyńskie weto



Wzmacnianie układu odpornościowego



Wykluczenie Tajwanu z WHO



Drzazgę źle się czyta



Sześć lat



Pochodzenie



Papież Franciszek



Schadenfreude



Pseudonaukowa histeria...


Panstwo etc



Biły się dwa bogi


 Forma przejściowa


Wstęga Möbiusa


Przemysł produkcji kłamstw


Jesteś tym, co czytasz,



Radykalne poglądy polityczne


Einstein



Socjologia



Allah stworzyl



Uprzednie doświadczenie



Żydowski exodus



PRL Chrystusem narodów



Odrastające głowy hydry nazizmu



Homeopatia, wibracje i oszustwo


Żołnierz IDF



Prawo powrotu


Listy z naszego sadu
Redaktor naczelny:   Hili
Webmaster:   Andrzej Koraszewski
Współpracownicy:   Jacek, , Malgorzata, Andrzej, Marcin, Henryk